Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	minE	1,007,192	(T)5→6	intergenic (+130/‑56)	ydgH → / → ydgI	hypothetical protein/predicted arginine/ornithine antiporter transporter

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	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	minE	1,007,187	1	.	T	100.0%	327.4 / NA	91	intergenic (+125/‑61)	ydgH/ydgI	hypothetical protein/predicted arginine/ornithine antiporter transporter
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base . (0/0);  new base T (91/0);  total (91/0)

ACATCTCTTCGTAAAATCCCGCGCTTCAGTGGCAAACTCCA‑TTTTTATGCGTTTTGCCCT  >  minE/1007147‑1007206                                          |                    acaTCTCTTCGTAAAATCCCGCGCTTCAGTGGCAAACTCCa                      >  1:3516631/1‑41 (MQ=255) acaTCTCTTCGTAAAATCCCGCGCTTCAGTGGCAAACTCCa                      >  1:708473/1‑41 (MQ=255) acaTCTCTTCGTAAAATCCCGCGCTTCAGTGGCAAACTCCATTTTTTATGCGTTTTGCCCt  >  1:3097811/1‑61 (MQ=255) acaTCTCTTCGTAAAATCCCGCGCTTCAGTGGCAAACTCCATTTTTTATGCGTTTTGCCCt  >  1:3360752/1‑61 (MQ=255) acaTCTCTTCGTAAAATCCCGCGCTTCAGTGGCAAACTCCATTTTTTATGCGTTTTGCCCt  >  1:3356086/1‑61 (MQ=255) acaTCTCTTCGTAAAATCCCGCGCTTCAGTGGCAAACTCCATTTTTTATGCGTTTTGCCCt  >  1:3317092/1‑61 (MQ=255) acaTCTCTTCGTAAAATCCCGCGCTTCAGTGGCAAACTCCATTTTTTATGCGTTTTGCCCt  >  1:3307730/1‑61 (MQ=255) acaTCTCTTCGTAAAATCCCGCGCTTCAGTGGCAAACTCCATTTTTTATGCGTTTTGCCCt  >  1:3229752/1‑61 (MQ=255) acaTCTCTTCGTAAAATCCCGCGCTTCAGTGGCAAACTCCATTTTTTATGCGTTTTGCCCt  >  1:3162684/1‑61 (MQ=255) 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Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑