Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1880463	1880513	51	83 [0]	[0] 35	chpA	toxin of the ChpA‑ChpR toxin‑antitoxin system, endoribonuclease

TCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAT  >  minE/1880403‑1880462                                                            | tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACGCATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:3374889/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:3244916/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:3477598/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:3451402/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:3450687/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:344380/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:3397506/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:3325409/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:3303570/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:3251627/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:3246268/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:3483758/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:3190128/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:3174350/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:3173209/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:3166938/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:3156522/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:3141401/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:3136682/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:3055344/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:2955037/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:447661/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:843028/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:653133/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:637256/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:586764/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:545452/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:538089/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:515464/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:511435/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:476184/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:453462/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:2793852/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:446773/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:442617/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:407421/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:3601131/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:3592704/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:3554019/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:3550537/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:3537056/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:349496/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:1283341/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:1700998/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:1632091/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:1630206/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:1616565/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:1564186/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:155664/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:1419541/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:1356084/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:132903/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:174069/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:1275789/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:1236028/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:1203028/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:1195245/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:1172674/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:1162011/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:1156643/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:1154450/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:1154308/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:2194702/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:2715435/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:2707543/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:2692703/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:2663426/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:254197/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:2461353/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:2443831/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:2408093/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:2266619/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:2201041/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:1067087/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:2189436/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:2171336/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:2161824/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:2101015/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:1913913/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:1881801/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:1844147/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:1841360/1‑60 (MQ=255) tCCTTTTGATTGAGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAt  >  1:1550984/1‑60 (MQ=255)                                                            | TCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACAT  >  minE/1880403‑1880462

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑