Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	170931	170950	20	24 [0]	[0] 44	pyrH	uridylate kinase

GGTCTGGCGAAAGCGGGTATGAACCGCGTTGTGGGCGACCACATGGGGATGCTGGCGAC  >  minE/170872‑170930                                                           | ggTCTGGCGAAAGCGGGTATGAACCGCGTTGTGGGCGACCACATGGGGATGCTGGCGAc  <  1:1347799/59‑1 (MQ=255)    cTGGCGTAAGCGGGTATGAACCGCGTTGTGGGCGACCACATGGGGATGCTGGCGAc  <  1:2758176/56‑1 (MQ=255)    cTGGCGAAAGCGGGTATGAACCGCGTTGTGGGCGACCACATGGGGATGCTGGCGAc  <  1:249482/56‑1 (MQ=255)    cTGGCGAAAGCGGGTATGAACCGCGTTGTGGGCGACCACATGGGGATGCTGGCGAc  <  1:997002/56‑1 (MQ=255)    cTGGCGAAAGCGGGTATGAACCGCGTTGTGGGCGACCACATGGGGATGCTGGCGAc  <  1:891591/56‑1 (MQ=255)    cTGGCGAAAGCGGGTATGAACCGCGTTGTGGGCGACCACATGGGGATGCTGGCGAc  <  1:751322/56‑1 (MQ=255)    cTGGCGAAAGCGGGTATGAACCGCGTTGTGGGCGACCACATGGGGATGCTGGCGAc  <  1:458698/56‑1 (MQ=255)    cTGGCGAAAGCGGGTATGAACCGCGTTGTGGGCGACCACATGGGGATGCTGGCGAc  <  1:3400091/56‑1 (MQ=255)    cTGGCGAAAGCGGGTATGAACCGCGTTGTGGGCGACCACATGGGGATGCTGGCGAc  <  1:3395853/56‑1 (MQ=255)    cTGGCGAAAGCGGGTATGAACCGCGTTGTGGGCGACCACATGGGGATGCTGGCGAc  <  1:3086506/56‑1 (MQ=255)    cTGGCGAAAGCGGGTATGAACCGCGTTGTGGGCGACCACATGGGGATGCTGGCGAc  <  1:2854072/56‑1 (MQ=255)    cTGGCGAAAGCGGGTATGAACCGCGTTGTGGGCGACCACATGGGGATGCTGGCGAc  <  1:2829267/56‑1 (MQ=255)    cTGGCGAAAGCGGGTATGAACCGCGTTGTGGGCGACCACATGGGGATGCTGGCGAc  <  1:256281/56‑1 (MQ=255)    cTGGCGAAAGCGGGTATGAACCGCGTTGTGGGCGACCACATGGGGATGCTGGCGAc  <  1:1027047/56‑1 (MQ=255)    cTGGCGAAAGCGGGTATGAACCGCGTTGTGGGCGACCACATGGGGATGCTGGCGAc  <  1:2230781/56‑1 (MQ=255)    cTGGCGAAAGCGGGTATGAACCGCGTTGTGGGCGACCACATGGGGATGCTGGCGAc  <  1:208942/56‑1 (MQ=255)    cTGGCGAAAGCGGGTATGAACCGCGTTGTGGGCGACCACATGGGGATGCTGGCGAc  <  1:2064861/56‑1 (MQ=255)    cTGGCGAAAGCGGGTATGAACCGCGTTGTGGGCGACCACATGGGGATGCTGGCGAc  <  1:1948927/56‑1 (MQ=255)    cTGGCGAAAGCGGGTATGAACCGCGTTGTGGGCGACCACATGGGGATGCTGGCGAc  <  1:1929722/56‑1 (MQ=255)    cTGGCGAAAGCGGGTATGAACCGCGTTGTGGGCGACCACATGGGGATGCTGGCGAc  <  1:1845715/56‑1 (MQ=255)    cTGGCGAAAGCGGGTATGAACCGCGTTGTGGGCGACCACATGGGGATGCTGGCGAc  <  1:1394878/56‑1 (MQ=255)    cTGGCGAAAGCGGGTATGAACCGCGTTGTGGGCGACCACATGGGGATGCTGGCGAc  <  1:1107873/56‑1 (MQ=255)     tGGCGAAAGCGGGTATGAACCGCGTTGTGGGCGACCACATGGGGATGCTGGCGAc  <  1:2142441/55‑1 (MQ=255)     tGGCGAAAGCGGGTATGAACCGCGTTGTGGGCGACCACATGGGGATGCTGGCGAc  <  1:185192/55‑1 (MQ=255)                                                           | GGTCTGGCGAAAGCGGGTATGAACCGCGTTGTGGGCGACCACATGGGGATGCTGGCGAC  >  minE/170872‑170930

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑