Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1961272	1961277	6	37 [0]	[0] 12	pgk	phosphoglycerate kinase

TAGTTAACAACCGGCAGCAGAGAGAATTCTTCGTTGTACTCGCCTTCGGTAGGACGACCCAG  >  minE/1961210‑1961271                                                              | tAGTTAACAACCGGCAGCAGAGAGAATTCTTCGTTGTACTCGCCTTCGGTAGGACGACCCAg  <  1:3351412/62‑1 (MQ=255) tAGTTAACAACCGGCAGCAGAGAGAATTCTTCGTTGTACTCGCCTTCGGTAGGACGACCCAg  <  1:1180135/62‑1 (MQ=255) tAGTTAACAACCGGCAGCAGAGAGAATTCTTCGTTGTACTCGCCTTCGGTAGGACGACCCAg  <  1:3045098/62‑1 (MQ=255) tAGTTAACAACCGGCAGCAGAGAGAATTCTTCGTTGTACTCGCCTTCGGTAGGACGACCCAg  <  1:3159959/62‑1 (MQ=255) tAGTTAACAACCGGCAGCAGAGAGAATTCTTCGTTGTACTCGCCTTCGGTAGGACGACCCAg  <  1:3186246/62‑1 (MQ=255) tAGTTAACAACCGGCAGCAGAGAGAATTCTTCGTTGTACTCGCCTTCGGTAGGACGACCCAg  <  1:3216936/62‑1 (MQ=255) tAGTTAACAACCGGCAGCAGAGAGAATTCTTCGTTGTACTCGCCTTCGGTAGGACGACCCAg  <  1:3281370/62‑1 (MQ=255) tAGTTAACAACCGGCAGCAGAGAGAATTCTTCGTTGTACTCGCCTTCGGTAGGACGACCCAg  <  1:3290337/62‑1 (MQ=255) tAGTTAACAACCGGCAGCAGAGAGAATTCTTCGTTGTACTCGCCTTCGGTAGGACGACCCAg  <  1:3316067/62‑1 (MQ=255) tAGTTAACAACCGGCAGCAGAGAGAATTCTTCGTTGTACTCGCCTTCGGTAGGACGACCCAg  <  1:2981272/62‑1 (MQ=255) tAGTTAACAACCGGCAGCAGAGAGAATTCTTCGTTGTACTCGCCTTCGGTAGGACGACCCAg  <  1:3351851/62‑1 (MQ=255) tAGTTAACAACCGGCAGCAGAGAGAATTCTTCGTTGTACTCGCCTTCGGTAGGACGACCCAg  <  1:3472197/62‑1 (MQ=255) tAGTTAACAACCGGCAGCAGAGAGAATTCTTCGTTGTACTCGCCTTCGGTAGGACGACCCAg  <  1:551323/62‑1 (MQ=255) tAGTTAACAACCGGCAGCAGAGAGAATTCTTCGTTGTACTCGCCTTCGGTAGGACGACCCAg  <  1:569432/62‑1 (MQ=255) tAGTTAACAACCGGCAGCAGAGAGAATTCTTCGTTGTACTCGCCTTCGGTAGGACGACCCAg  <  1:70154/62‑1 (MQ=255) tAGTTAACAACCGGCAGCAGAGAGAATTCTTCGTTGTACTCGCCTTCGGTAGGACGACCCAg  <  1:90468/62‑1 (MQ=255) tAGTTAACAACCGGCAGCAGAGAGAATTCTTCGTTGTACTCGCCTTCGGTAGGACGACCCAg  <  1:907283/62‑1 (MQ=255) tAGTTAACAACCGGCAGCAGAGAGAATTCTTCGTTGTACTCGCCTTCGGTAGGACGACCCAg  <  1:936941/62‑1 (MQ=255) tAGTTAACAACCGGCAGCAGAGAGAATTCTTCGTTGTACTCGCCTTCGGTAGGACGACCCAg  <  1:27190/62‑1 (MQ=255) tAGTTAACAACCGGCAGCAGAGAGAATTCTTCGTTGTACTCGCCTTCGGTAGGACGACCCAg  <  1:1334440/62‑1 (MQ=255) tAGTTAACAACCGGCAGCAGAGAGAATTCTTCGTTGTACTCGCCTTCGGTAGGACGACCCAg  <  1:1358465/62‑1 (MQ=255) tAGTTAACAACCGGCAGCAGAGAGAATTCTTCGTTGTACTCGCCTTCGGTAGGACGACCCAg  <  1:1373730/62‑1 (MQ=255) tAGTTAACAACCGGCAGCAGAGAGAATTCTTCGTTGTACTCGCCTTCGGTAGGACGACCCAg  <  1:1522750/62‑1 (MQ=255) tAGTTAACAACCGGCAGCAGAGAGAATTCTTCGTTGTACTCGCCTTCGGTAGGACGACCCAg  <  1:1700378/62‑1 (MQ=255) tAGTTAACAACCGGCAGCAGAGAGAATTCTTCGTTGTACTCGCCTTCGGTAGGACGACCCAg  <  1:1736582/62‑1 (MQ=255) tAGTTAACAACCGGCAGCAGAGAGAATTCTTCGTTGTACTCGCCTTCGGTAGGACGACCCAg  <  1:1937960/62‑1 (MQ=255) tAGTTAACAACCGGCAGCAGAGAGAATTCTTCGTTGTACTCGCCTTCGGTAGGACGACCCAg  <  1:1961414/62‑1 (MQ=255) tAGTTAACAACCGGCAGCAGAGAGAATTCTTCGTTGTACTCGCCTTCGGTAGGACGACCCAg  <  1:2028260/62‑1 (MQ=255) tAGTTAACAACCGGCAGCAGAGAGAATTCTTCGTTGTACTCGCCTTCGGTAGGACGACCCAg  <  1:2035001/62‑1 (MQ=255) tAGTTAACAACCGGCAGCAGAGAGAATTCTTCGTTGTACTCGCCTTCGGTAGGACGACCCAg  <  1:2189963/62‑1 (MQ=255) tAGTTAACAACCGGCAGCAGAGAGAATTCTTCGTTGTACTCGCCTTCGGTAGGACGACCCAg  <  1:2192109/62‑1 (MQ=255) tAGTTAACAACCGGCAGCAGAGAGAATTCTTCGTTGTACTCGCCTTCGGTAGGACGACCCAg  <  1:2566012/62‑1 (MQ=255) tAGTTAACAACCGGCAGCAGAGAGAATTCTTCGTTGTACTCGCCTTCGGTAGGACGACCCAg  <  1:2604789/62‑1 (MQ=255) tAGTTAACAACCGGCAGCAGAGAGAATTCTTCGTTGTACTCGCCTTCGGTAGGACGACCCAg  <  1:2844221/62‑1 (MQ=255)  aGTTAACAACCGGCAGCAGAGAGAATTCTTCGTTGTACTCGCCTTCGGTAGGACGACCCAg  <  1:397701/61‑1 (MQ=255)  aGTTAACAACCGGCAGCAGAGAGAATTCTTCGTTGTACTCGCCTTCGGTAGGACGACCCAg  <  1:809471/61‑1 (MQ=255)                agcagAGAGAATTCTTCGTTGTACTCGCCTTCGGTAGGACGACCCAg  <  1:1220207/47‑1 (MQ=255)                                                              | TAGTTAACAACCGGCAGCAGAGAGAATTCTTCGTTGTACTCGCCTTCGGTAGGACGACCCAG  >  minE/1961210‑1961271

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑