Missing coverage evidence...
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TCACGCAGAGAACGGCGAGTTCCCGGTTCGTGCATCTCCTGCCAGGTTTCCCACATGCTTTGCA  >  minE/1971650‑1971713                                                            |     tCACGCAGAGAACGGCGAGTTCCCGGTTCGTGCATCTCCTGCCAGGTTTCCCACATGCtt      >  1:3466953/1‑60 (MQ=255) tCACGCAGAGAACGGCGAGTTCCCGGTTCGTGCATCTCCTGCCAGGTTTCCCACATGCtt      >  1:2803700/1‑60 (MQ=255) tCACGCAGAGAACGGCGAGTTCCCGGTTCGTGCATCTCCTGCCAGGTTTCCCACATGCtt      >  1:2816225/1‑60 (MQ=255) tCACGCAGAGAACGGCGAGTTCCCGGTTCGTGCATCTCCTGCCAGGTTTCCCACATGCtt      >  1:2877871/1‑60 (MQ=255) tCACGCAGAGAACGGCGAGTTCCCGGTTCGTGCATCTCCTGCCAGGTTTCCCACATGCtt      >  1:2975868/1‑60 (MQ=255) tCACGCAGAGAACGGCGAGTTCCCGGTTCGTGCATCTCCTGCCAGGTTTCCCACATGCtt      >  1:3075175/1‑60 (MQ=255) tCACGCAGAGAACGGCGAGTTCCCGGTTCGTGCATCTCCTGCCAGGTTTCCCACATGCtt      >  1:3219117/1‑60 (MQ=255) tCACGCAGAGAACGGCGAGTTCCCGGTTCGTGCATCTCCTGCCAGGTTTCCCACATGCtt      >  1:331361/1‑60 (MQ=255) tCACGCAGAGAACGGCGAGTTCCCGGTTCGTGCATCTCCTGCCAGGTTTCCCACATGCtt      >  1:333510/1‑60 (MQ=255) tCACGCAGAGAACGGCGAGTTCCCGGTTCGTGCATCTCCTGCCAGGTTTCCCACATGCtt      >  1:3342039/1‑60 (MQ=255) tCACGCAGAGAACGGCGAGTTCCCGGTTCGTGCATCTCCTGCCAGGTTTCCCACATGCtt      >  1:3389010/1‑60 (MQ=255) tCACGCAGAGAACGGCGAGTTCCCGGTTCGTGCATCTCCTGCCAGGTTTCCCACATGCtt      >  1:343317/1‑60 (MQ=255) tCACGCAGAGAACGGCGAGTTCCCGGTTCGTGCATCTCCTGCCAGGTTTCCCACATGCtt      >  1:2724591/1‑60 (MQ=255) tCACGCAGAGAACGGCGAGTTCCCGGTTCGTGCATCTCCTGCCAGGTTTCCCACATGCtt      >  1:3560006/1‑60 (MQ=255) tCACGCAGAGAACGGCGAGTTCCCGGTTCGTGCATCTCCTGCCAGGTTTCCCACATGCtt      >  1:3646674/1‑60 (MQ=255) tCACGCAGAGAACGGCGAGTTCCCGGTTCGTGCATCTCCTGCCAGGTTTCCCACATGCtt      >  1:365855/1‑60 (MQ=255) tCACGCAGAGAACGGCGAGTTCCCGGTTCGTGCATCTCCTGCCAGGTTTCCCACATGCtt      >  1:373229/1‑60 (MQ=255) tCACGCAGAGAACGGCGAGTTCCCGGTTCGTGCATCTCCTGCCAGGTTTCCCACATGCtt      >  1:490107/1‑60 (MQ=255) tCACGCAGAGAACGGCGAGTTCCCGGTTCGTGCATCTCCTGCCAGGTTTCCCACATGCtt      >  1:496028/1‑60 (MQ=255) tCACGCAGAGAACGGCGAGTTCCCGGTTCGTGCATCTCCTGCCAGGTTTCCCACATGCtt      >  1:643629/1‑60 (MQ=255) tCACGCAGAGAACGGCGAGTTCCCGGTTCGTGCATCTCCTGCCAGGTTTCCCACATGCtt      >  1:763746/1‑60 (MQ=255) tCACGCAGAGAACGGCGAGTTCCCGGTTCGTGCATCTCCTGCCAGGTTTCCCACATGCtt      >  1:772091/1‑60 (MQ=255) tCACGCAGAGAACGGCGAGTTCCCGGTTCGTGCATCTCCTGCCAGGTTTCCCACATGCtt      >  1:979204/1‑60 (MQ=255) tCACGCAGAGAACGGCGAGTTCCCGGTTCGTGCATCTCCTGCCAGGTTTCCCACATGCtt      >  1:2488655/1‑60 (MQ=255) tCACGCAGAGAACGGCGAGTTCCCGGTTCGTGCATCTCCTGCCAGGTTTCCCACATGCtt      >  1:1335834/1‑60 (MQ=255) tCACGCAGAGAACGGCGAGTTCCCGGTTCGTGCATCTCCTGCCAGGTTTCCCACATGCtt      >  1:1490135/1‑60 (MQ=255) tCACGCAGAGAACGGCGAGTTCCCGGTTCGTGCATCTCCTGCCAGGTTTCCCACATGCtt      >  1:151937/1‑60 (MQ=255) tCACGCAGAGAACGGCGAGTTCCCGGTTCGTGCATCTCCTGCCAGGTTTCCCACATGCtt      >  1:1594912/1‑60 (MQ=255) tCACGCAGAGAACGGCGAGTTCCCGGTTCGTGCATCTCCTGCCAGGTTTCCCACATGCtt      >  1:1835795/1‑60 (MQ=255) tCACGCAGAGAACGGCGAGTTCCCGGTTCGTGCATCTCCTGCCAGGTTTCCCACATGCtt      >  1:1869632/1‑60 (MQ=255) tCACGCAGAGAACGGCGAGTTCCCGGTTCGTGCATCTCCTGCCAGGTTTCCCACATGCtt      >  1:1994224/1‑60 (MQ=255) tCACGCAGAGAACGGCGAGTTCCCGGTTCGTGCATCTCCTGCCAGGTTTCCCACATGCtt      >  1:2016756/1‑60 (MQ=255) tCACGCAGAGAACGGCGAGTTCCCGGTTCGTGCATCTCCTGCCAGGTTTCCCACATGCtt      >  1:207840/1‑60 (MQ=255) tCACGCAGAGAACGGCGAGTTCCCGGTTCGTGCATCTCCTGCCAGGTTTCCCACATGCtt      >  1:2118141/1‑60 (MQ=255) tCACGCAGAGAACGGCGAGTTCCCGGTTCGTGCATCTCCTGCCAGGTTTCCCACATGCtt      >  1:1152037/1‑60 (MQ=255) tCACGCAGAGAACGGCGAGTTCCCGGTTCGTGCATCTCCTGCCAGGTTTCCCACATGCtt      >  1:2512186/1‑60 (MQ=255) tCACGCAGAGAACGGCGAGTTCCCGGTTCGTGCATCTCCTGCCAGGTTTCCCACATGCtt      >  1:2535298/1‑60 (MQ=255) tCACGCAGAGAACGGCGAGTTCCCGGTTCGTGCATCTCCTGCCAGGTTTCCCACATGCtt      >  1:2550328/1‑60 (MQ=255) tCACGCAGAGAACGGCGAGTTCCCGGTTCGTGCATCTCCTGCCAGGTTTCCCACATGCtt      >  1:2597915/1‑60 (MQ=255) tCACGCAGAGAACGGCGAGTTCCCGGTTCGTGCATCTCCTGCCAGGTTTCCCACATGCtt      >  1:2667879/1‑60 (MQ=255) tCACGCAGAGAACGGCGAGTTCCCGGTTCGTGCATCTCCTGCCAGGTTTCCCACATGCtt      >  1:2691540/1‑60 (MQ=255) tCACGCAGAGAACGGCGAGTTCCCGGTTCGTGCATCTCCTGCCAGGTTTCCCACATGCtt      >  1:269534/1‑60 (MQ=255) tCACGCAGAGAACGGCGAGTTCCCGGTTCGTGCATCTCCTGCCAGGTTTCCCACATGCtt      >  1:270126/1‑60 (MQ=255) tCACGCAGAGAACGGCGAGTTCCCGGTTCGTGCATCTCCTGCCAGGTTTCCCACATGCtt      >  1:2707814/1‑60 (MQ=255) tCACGCAGAGAACGGCGAGTTCCCGGTTCGTGCATCTCCTGCCAGGTTTCCCACATGCtt      >  1:2709685/1‑60 (MQ=255) tCACGCAGAGAACGGCGAGTTCCCGGTTCGTGCA‑‑TCCTGCCAGGTTTCCCACATGCTTTGCa  >  1:1418822/1‑62 (MQ=255)                                                            |     TCACGCAGAGAACGGCGAGTTCCCGGTTCGTGCATCTCCTGCCAGGTTTCCCACATGCTTTGCA  >  minE/1971650‑1971713

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑