Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	1977675	1977723	49	53 [0]	[0] 80	endA	DNA‑specific endonuclease I

GTGCTGGCAGGACGGTGGACGTAAAAACTGCGCTAAAGATCCGGTCT  >  minE/1977628‑1977674                                               | gTGCTGGCAGGACGGTGGACGTAAAAACTGCGCTAAAGATCCGGTCt  >  1:3303372/1‑47 (MQ=255) gTGCTGGCAGGACGGTGGACGTAAAAACTGCGCTAAAGATCCGGTCt  >  1:2683187/1‑47 (MQ=255) gTGCTGGCAGGACGGTGGACGTAAAAACTGCGCTAAAGATCCGGTCt  >  1:2748928/1‑47 (MQ=255) gTGCTGGCAGGACGGTGGACGTAAAAACTGCGCTAAAGATCCGGTCt  >  1:2777416/1‑47 (MQ=255) gTGCTGGCAGGACGGTGGACGTAAAAACTGCGCTAAAGATCCGGTCt  >  1:2807416/1‑47 (MQ=255) gTGCTGGCAGGACGGTGGACGTAAAAACTGCGCTAAAGATCCGGTCt  >  1:2966970/1‑47 (MQ=255) gTGCTGGCAGGACGGTGGACGTAAAAACTGCGCTAAAGATCCGGTCt  >  1:300403/1‑47 (MQ=255) gTGCTGGCAGGACGGTGGACGTAAAAACTGCGCTAAAGATCCGGTCt  >  1:3073039/1‑47 (MQ=255) gTGCTGGCAGGACGGTGGACGTAAAAACTGCGCTAAAGATCCGGTCt  >  1:3094821/1‑47 (MQ=255) gTGCTGGCAGGACGGTGGACGTAAAAACTGCGCTAAAGATCCGGTCt  >  1:3148723/1‑47 (MQ=255) gTGCTGGCAGGACGGTGGACGTAAAAACTGCGCTAAAGATCCGGTCt  >  1:3160494/1‑47 (MQ=255) gTGCTGGCAGGACGGTGGACGTAAAAACTGCGCTAAAGATCCGGTCt  >  1:3224777/1‑47 (MQ=255) gTGCTGGCAGGACGGTGGACGTAAAAACTGCGCTAAAGATCCGGTCt  >  1:3286387/1‑47 (MQ=255) gTGCTGGCAGGACGGTGGACGTAAAAACTGCGCTAAAGATCCGGTCt  >  1:3294276/1‑47 (MQ=255) gTGCTGGCAGGACGGTGGACGTAAAAACTGCGCTAAAGATCCGGTCt  >  1:2669322/1‑47 (MQ=255) gTGCTGGCAGGACGGTGGACGTAAAAACTGCGCTAAAGATCCGGTCt  >  1:3340789/1‑47 (MQ=255) gTGCTGGCAGGACGGTGGACGTAAAAACTGCGCTAAAGATCCGGTCt  >  1:3368874/1‑47 (MQ=255) gTGCTGGCAGGACGGTGGACGTAAAAACTGCGCTAAAGATCCGGTCt  >  1:3415042/1‑47 (MQ=255) gTGCTGGCAGGACGGTGGACGTAAAAACTGCGCTAAAGATCCGGTCt  >  1:3566313/1‑47 (MQ=255) gTGCTGGCAGGACGGTGGACGTAAAAACTGCGCTAAAGATCCGGTCt  >  1:3609104/1‑47 (MQ=255) gTGCTGGCAGGACGGTGGACGTAAAAACTGCGCTAAAGATCCGGTCt  >  1:399200/1‑47 (MQ=255) gTGCTGGCAGGACGGTGGACGTAAAAACTGCGCTAAAGATCCGGTCt  >  1:426984/1‑47 (MQ=255) gTGCTGGCAGGACGGTGGACGTAAAAACTGCGCTAAAGATCCGGTCt  >  1:475575/1‑47 (MQ=255) gTGCTGGCAGGACGGTGGACGTAAAAACTGCGCTAAAGATCCGGTCt  >  1:574863/1‑47 (MQ=255) gTGCTGGCAGGACGGTGGACGTAAAAACTGCGCTAAAGATCCGGTCt  >  1:587794/1‑47 (MQ=255) gTGCTGGCAGGACGGTGGACGTAAAAACTGCGCTAAAGATCCGGTCt  >  1:826547/1‑47 (MQ=255) gTGCTGGCAGGACGGTGGACGTAAAAACTGCGCTAAAGATCCGGTCt  >  1:988474/1‑47 (MQ=255) gTGCTGGCAGGACGGTGGACGTAAAAACTGCGCTAAAGATCCGGTCt  >  1:1831750/1‑47 (MQ=255) gTGCTGGCAGGACGGTGGACGTAAAAACTGCGCTAAAGATCCGGTCt  >  1:1009932/1‑47 (MQ=255) gTGCTGGCAGGACGGTGGACGTAAAAACTGCGCTAAAGATCCGGTCt  >  1:1223597/1‑47 (MQ=255) gTGCTGGCAGGACGGTGGACGTAAAAACTGCGCTAAAGATCCGGTCt  >  1:1275109/1‑47 (MQ=255) gTGCTGGCAGGACGGTGGACGTAAAAACTGCGCTAAAGATCCGGTCt  >  1:1292627/1‑47 (MQ=255) gTGCTGGCAGGACGGTGGACGTAAAAACTGCGCTAAAGATCCGGTCt  >  1:1308321/1‑47 (MQ=255) gTGCTGGCAGGACGGTGGACGTAAAAACTGCGCTAAAGATCCGGTCt  >  1:1388479/1‑47 (MQ=255) gTGCTGGCAGGACGGTGGACGTAAAAACTGCGCTAAAGATCCGGTCt  >  1:1480618/1‑47 (MQ=255) gTGCTGGCAGGACGGTGGACGTAAAAACTGCGCTAAAGATCCGGTCt  >  1:1550292/1‑47 (MQ=255) gTGCTGGCAGGACGGTGGACGTAAAAACTGCGCTAAAGATCCGGTCt  >  1:1556645/1‑47 (MQ=255) gTGCTGGCAGGACGGTGGACGTAAAAACTGCGCTAAAGATCCGGTCt  >  1:1587310/1‑47 (MQ=255) gTGCTGGCAGGACGGTGGACGTAAAAACTGCGCTAAAGATCCGGTCt  >  1:1602778/1‑47 (MQ=255) gTGCTGGCAGGACGGTGGACGTAAAAACTGCGCTAAAGATCCGGTCt  >  1:1810515/1‑47 (MQ=255) gTGCTGGCAGGACGGTGGACGTAAAAACTGCGCTAAAGATCCGGTCt  >  1:1003599/1‑47 (MQ=255) gTGCTGGCAGGACGGTGGACGTAAAAACTGCGCTAAAGATCCGGTCt  >  1:1899966/1‑47 (MQ=255) gTGCTGGCAGGACGGTGGACGTAAAAACTGCGCTAAAGATCCGGTCt  >  1:2020909/1‑47 (MQ=255) gTGCTGGCAGGACGGTGGACGTAAAAACTGCGCTAAAGATCCGGTCt  >  1:2112521/1‑47 (MQ=255) gTGCTGGCAGGACGGTGGACGTAAAAACTGCGCTAAAGATCCGGTCt  >  1:2144948/1‑47 (MQ=255) gTGCTGGCAGGACGGTGGACGTAAAAACTGCGCTAAAGATCCGGTCt  >  1:2242114/1‑47 (MQ=255) gTGCTGGCAGGACGGTGGACGTAAAAACTGCGCTAAAGATCCGGTCt  >  1:2280201/1‑47 (MQ=255) gTGCTGGCAGGACGGTGGACGTAAAAACTGCGCTAAAGATCCGGTCt  >  1:234562/1‑47 (MQ=255) gTGCTGGCAGGACGGTGGACGTAAAAACTGCGCTAAAGATCCGGTCt  >  1:2486367/1‑47 (MQ=255) gTGCTGGCAGGACGGTGGACGTAAAAACTGCGCTAAAGATCCGGTCt  >  1:2488014/1‑47 (MQ=255) gTGCTGGCAGGACGGTGGACGTAAAAACTGCGCTAAAGATCCGGTCt  >  1:2568031/1‑47 (MQ=255) gTGCTGGCAGGACGGTGGACGTAAAAACTGCGCTAAAGATCCGGTCt  >  1:2621834/1‑47 (MQ=255) gTGCTGGCAGGACGGTGGACGTAAAAACTGCGCTAAAGATCAGGTCt  >  1:1904148/1‑47 (MQ=255)                                               | GTGCTGGCAGGACGGTGGACGTAAAAACTGCGCTAAAGATCCGGTCT  >  minE/1977628‑1977674

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑