Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1981736	1981792	57	58 [0]	[0] 34	yggR	predicted transporter

AGATTTGCCACTCCCCGTCGCCCCCGTCACCAGAATCAGGCCATTCTCGCTCTTGAGTAATTC  >  minE/1981673‑1981735                                                               | aGATTTGCCACTCCCCGTCGCCCCCGTCACCAGAATCAGGCCATTCTCGCTCTT‑AGTAATTc  <  1:2674828/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCCACTCCCCGTCGCCCCCGTCACGAGAATCAGGCCATTCTCGCTCTTGAGTAATTc  <  1:514811/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCCACTCCCCGTCGCCCCCGTCACCAGAATCCGGCCATTCTCGCTCTTGAGTAATTc  <  1:2432057/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCCACTCCCCGTCGCCCCCGTCACCAGAATCAGGCCATTCTCGCTCTTGAGTAATTc  <  1:3256926/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCCACTCCCCGTCGCCCCCGTCACCAGAATCAGGCCATTCTCGCTCTTGAGTAATTc  <  1:1006226/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCCACTCCCCGTCGCCCCCGTCACCAGAATCAGGCCATTCTCGCTCTTGAGTAATTc  <  1:2680898/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCCACTCCCCGTCGCCCCCGTCACCAGAATCAGGCCATTCTCGCTCTTGAGTAATTc  <  1:2723597/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCCACTCCCCGTCGCCCCCGTCACCAGAATCAGGCCATTCTCGCTCTTGAGTAATTc  <  1:2804082/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCCACTCCCCGTCGCCCCCGTCACCAGAATCAGGCCATTCTCGCTCTTGAGTAATTc  <  1:2814825/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCCACTCCCCGTCGCCCCCGTCACCAGAATCAGGCCATTCTCGCTCTTGAGTAATTc  <  1:2835610/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCCACTCCCCGTCGCCCCCGTCACCAGAATCAGGCCATTCTCGCTCTTGAGTAATTc  <  1:3033445/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCCACTCCCCGTCGCCCCCGTCACCAGAATCAGGCCATTCTCGCTCTTGAGTAATTc  <  1:30723/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCCACTCCCCGTCGCCCCCGTCACCAGAATCAGGCCATTCTCGCTCTTGAGTAATTc  <  1:3077002/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCCACTCCCCGTCGCCCCCGTCACCAGAATCAGGCCATTCTCGCTCTTGAGTAATTc  <  1:3174466/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCCACTCCCCGTCGCCCCCGTCACCAGAATCAGGCCATTCTCGCTCTTGAGTAATTc  <  1:3239672/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCCACTCCCCGTCGCCCCCGTCACCAGAATCAGGCCATTCTCGCTCTTGAGTAATTc  <  1:2549649/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCCACTCCCCGTCGCCCCCGTCACCAGAATCAGGCCATTCTCGCTCTTGAGTAATTc  <  1:3259784/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCCACTCCCCGTCGCCCCCGTCACCAGAATCAGGCCATTCTCGCTCTTGAGTAATTc  <  1:3302867/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCCACTCCCCGTCGCCCCCGTCACCAGAATCAGGCCATTCTCGCTCTTGAGTAATTc  <  1:3538629/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCCACTCCCCGTCGCCCCCGTCACCAGAATCAGGCCATTCTCGCTCTTGAGTAATTc  <  1:355661/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCCACTCCCCGTCGCCCCCGTCACCAGAATCAGGCCATTCTCGCTCTTGAGTAATTc  <  1:374392/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCCACTCCCCGTCGCCCCCGTCACCAGAATCAGGCCATTCTCGCTCTTGAGTAATTc  <  1:432182/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCCACTCCCCGTCGCCCCCGTCACCAGAATCAGGCCATTCTCGCTCTTGAGTAATTc  <  1:540005/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCCACTCCCCGTCGCCCCCGTCACCAGAATCAGGCCATTCTCGCTCTTGAGTAATTc  <  1:547495/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCCACTCCCCGTCGCCCCCGTCACCAGAATCAGGCCATTCTCGCTCTTGAGTAATTc  <  1:607590/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCCACTCCCCGTCGCCCCCGTCACCAGAATCAGGCCATTCTCGCTCTTGAGTAATTc  <  1:740713/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCCACTCCCCGTCGCCCCCGTCACCAGAATCAGGCCATTCTCGCTCTTGAGTAATTc  <  1:867702/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCCACTCCCCGTCGCCCCCGTCACCAGAATCAGGCCATTCTCGCTCTTGAGTAATTc  <  1:2059474/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCCACTCCCCGTCGCCCCCGTCACCAGAATCAGGCCATTCTCGCTCTTGAGTAATTc  <  1:1638411/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCCACTCCCCGTCGCCCCCGTCACCAGAATCAGGCCATTCTCGCTCTTGAGTAATTc  <  1:1650662/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCCACTCCCCGTCGCCCCCGTCACCAGAATCAGGCCATTCTCGCTCTTGAGTAATTc  <  1:1672829/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCCACTCCCCGTCGCCCCCGTCACCAGAATCAGGCCATTCTCGCTCTTGAGTAATTc  <  1:1776783/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCCACTCCCCGTCGCCCCCGTCACCAGAATCAGGCCATTCTCGCTCTTGAGTAATTc  <  1:1809948/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCCACTCCCCGTCGCCCCCGTCACCAGAATCAGGCCATTCTCGCTCTTGAGTAATTc  <  1:1859419/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCCACTCCCCGTCGCCCCCGTCACCAGAATCAGGCCATTCTCGCTCTTGAGTAATTc  <  1:191486/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCCACTCCCCGTCGCCCCCGTCACCAGAATCAGGCCATTCTCGCTCTTGAGTAATTc  <  1:1924915/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCCACTCCCCGTCGCCCCCGTCACCAGAATCAGGCCATTCTCGCTCTTGAGTAATTc  <  1:1454438/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCCACTCCCCGTCGCCCCCGTCACCAGAATCAGGCCATTCTCGCTCTTGAGTAATTc  <  1:198051/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCCACTCCCCGTCGCCCCCGTCACCAGAATCAGGCCATTCTCGCTCTTGAGTAATTc  <  1:1985232/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCCACTCCCCGTCGCCCCCGTCACCAGAATCAGGCCATTCTCGCTCTTGAGTAATTc  <  1:1301871/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCCACTCCCCGTCGCCCCCGTCACCAGAATCAGGCCATTCTCGCTCTTGAGTAATTc  <  1:2097408/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCCACTCCCCGTCGCCCCCGTCACCAGAATCAGGCCATTCTCGCTCTTGAGTAATTc  <  1:1254571/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCCACTCCCCGTCGCCCCCGTCACCAGAATCAGGCCATTCTCGCTCTTGAGTAATTc  <  1:2252202/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCCACTCCCCGTCGCCCCCGTCACCAGAATCAGGCCATTCTCGCTCTTGAGTAATTc  <  1:1229208/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCCACTCCCCGTCGCCCCCGTCACCAGAATCAGGCCATTCTCGCTCTTGAGTAATTc  <  1:2256501/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCCACTCCCCGTCGCCCCCGTCACCAGAATCAGGCCATTCTCGCTCTTGAGTAATTc  <  1:2350868/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCCACTCCCCGTCGCCCCCGTCACCAGAATCAGGCCATTCTCGCTCTTGAGTAATTc  <  1:2398403/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCCACTCCCCGTCGCCCCCGTCACCAGAATCAGGCCATTCTCGCTCTTGAGTAATTc  <  1:2514994/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCCACTCCCCGTCGCCCCCGTCACCAGAATCAGGCCATTCTCGCTCTTGAGTAATTc  <  1:2521238/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCCACTCCCCGTCGCCCCCGTCACAAGAATCAGGCCATTCTCGCTCTTGAGTAATTc  <  1:1122900/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCCACTACCCGTCGCCCCCGTCACCAGAATCAGGCCATTCTCGCTCTTGAGTAATTc  <  1:2770085/62‑1 (MQ=255)   aTTTGCCACTCCCCGTCGCCCCCGTCACCAGAATCAGGCCATTCTCGCTCTTGAGTAATTc  <  1:1620086/61‑1 (MQ=255)   aTTTGCCACTCCCCGTCGCCCCCGTCACCAGAATCAGGCCATTCTCGCTCTTGAGTAATTc  <  1:1357535/61‑1 (MQ=255)   aTTTGCCACTCCCCGTCGCCCCCGTCACCAGAATCAGGCCATTCTCGCTCTTGAGTAATTc  <  1:224652/61‑1 (MQ=255)     ttGCCACTCCCCGTCGCCCCCGTCACCAGAATCAGGCCATTCTCGCTCTTGAGTAATTc  <  1:487985/59‑1 (MQ=255)             ccccGTCGCCCCCGTCACCAGAATCAGGCCATTCTCGCTCTTGAGTAATTc  <  1:3117010/51‑1 (MQ=255)                            cACCAGAATCAGGCCATTCTCGCTCTTGAGTAATTc  <  1:2952198/36‑1 (MQ=255)                             aCCAGAATCAGGCCATTCTCGCTCTTGAGTAATTc  <  1:2543211/35‑1 (MQ=255)                                                               | AGATTTGCCACTCCCCGTCGCCCCCGTCACCAGAATCAGGCCATTCTCGCTCTTGAGTAATTC  >  minE/1981673‑1981735

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑