Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1991540	1991550	11	61 [0]	[0] 58	mltC	membrane‑bound lytic murein transglycosylase C

AAAAGGCGATACCTATAACGAAGCCTGGGTCAAAGATACCAACGGTTTTGA  >  minE/1991489‑1991539                                                   | aaaaGGGGATACCTATAACGAAGCCTGGGTCAAAGATACCAACGGTTTTGa  >  1:619083/1‑51 (MQ=255) aaaaGGCGATACCTATAACGCAGCCTGGGTCAAAGATACCAACGGTTTTGa  >  1:782308/1‑51 (MQ=255) aaaaGGCGATACCTATAACGAAGCCTGGGTCAAAGATACCAACGGTTTTGa  >  1:2956307/1‑51 (MQ=255) aaaaGGCGATACCTATAACGAAGCCTGGGTCAAAGATACCAACGGTTTTGa  >  1:3411357/1‑51 (MQ=255) aaaaGGCGATACCTATAACGAAGCCTGGGTCAAAGATACCAACGGTTTTGa  >  1:336662/1‑51 (MQ=255) aaaaGGCGATACCTATAACGAAGCCTGGGTCAAAGATACCAACGGTTTTGa  >  1:3314163/1‑51 (MQ=255) aaaaGGCGATACCTATAACGAAGCCTGGGTCAAAGATACCAACGGTTTTGa  >  1:3291578/1‑51 (MQ=255) aaaaGGCGATACCTATAACGAAGCCTGGGTCAAAGATACCAACGGTTTTGa  >  1:3246588/1‑51 (MQ=255) aaaaGGCGATACCTATAACGAAGCCTGGGTCAAAGATACCAACGGTTTTGa  >  1:3220820/1‑51 (MQ=255) aaaaGGCGATACCTATAACGAAGCCTGGGTCAAAGATACCAACGGTTTTGa  >  1:3037368/1‑51 (MQ=255) aaaaGGCGATACCTATAACGAAGCCTGGGTCAAAGATACCAACGGTTTTGa  >  1:296749/1‑51 (MQ=255) aaaaGGCGATACCTATAACGAAGCCTGGGTCAAAGATACCAACGGTTTTGa  >  1:343913/1‑51 (MQ=255) aaaaGGCGATACCTATAACGAAGCCTGGGTCAAAGATACCAACGGTTTTGa  >  1:2897929/1‑51 (MQ=255) aaaaGGCGATACCTATAACGAAGCCTGGGTCAAAGATACCAACGGTTTTGa  >  1:2767403/1‑51 (MQ=255) aaaaGGCGATACCTATAACGAAGCCTGGGTCAAAGATACCAACGGTTTTGa  >  1:2759632/1‑51 (MQ=255) aaaaGGCGATACCTATAACGAAGCCTGGGTCAAAGATACCAACGGTTTTGa  >  1:2745781/1‑51 (MQ=255) aaaaGGCGATACCTATAACGAAGCCTGGGTCAAAGATACCAACGGTTTTGa  >  1:2733130/1‑51 (MQ=255) aaaaGGCGATACCTATAACGAAGCCTGGGTCAAAGATACCAACGGTTTTGa  >  1:3426798/1‑51 (MQ=255) aaaaGGCGATACCTATAACGAAGCCTGGGTCAAAGATACCAACGGTTTTGa  >  1:2726065/1‑51 (MQ=255) aaaaGGCGATACCTATAACGAAGCCTGGGTCAAAGATACCAACGGTTTTGa  >  1:3563483/1‑51 (MQ=255) aaaaGGCGATACCTATAACGAAGCCTGGGTCAAAGATACCAACGGTTTTGa  >  1:3605332/1‑51 (MQ=255) aaaaGGCGATACCTATAACGAAGCCTGGGTCAAAGATACCAACGGTTTTGa  >  1:377992/1‑51 (MQ=255) aaaaGGCGATACCTATAACGAAGCCTGGGTCAAAGATACCAACGGTTTTGa  >  1:422109/1‑51 (MQ=255) aaaaGGCGATACCTATAACGAAGCCTGGGTCAAAGATACCAACGGTTTTGa  >  1:495178/1‑51 (MQ=255) aaaaGGCGATACCTATAACGAAGCCTGGGTCAAAGATACCAACGGTTTTGa  >  1:518837/1‑51 (MQ=255) aaaaGGCGATACCTATAACGAAGCCTGGGTCAAAGATACCAACGGTTTTGa  >  1:53447/1‑51 (MQ=255) aaaaGGCGATACCTATAACGAAGCCTGGGTCAAAGATACCAACGGTTTTGa  >  1:55951/1‑51 (MQ=255) aaaaGGCGATACCTATAACGAAGCCTGGGTCAAAGATACCAACGGTTTTGa  >  1:564422/1‑51 (MQ=255) aaaaGGCGATACCTATAACGAAGCCTGGGTCAAAGATACCAACGGTTTTGa  >  1:740404/1‑51 (MQ=255) aaaaGGCGATACCTATAACGAAGCCTGGGTCAAAGATACCAACGGTTTTGa  >  1:814025/1‑51 (MQ=255) aaaaGGCGATACCTATAACGAAGCCTGGGTCAAAGATACCAACGGTTTTGa  >  1:892374/1‑51 (MQ=255) aaaaGGCGATACCTATAACGAAGCCTGGGTCAAAGATACCAACGGTTTTGa  >  1:1971213/1‑51 (MQ=255) aaaaGGCGATACCTATAACGAAGCCTGGGTCAAAGATACCAACGGTTTTGa  >  1:1094987/1‑51 (MQ=255) aaaaGGCGATACCTATAACGAAGCCTGGGTCAAAGATACCAACGGTTTTGa  >  1:1111426/1‑51 (MQ=255) aaaaGGCGATACCTATAACGAAGCCTGGGTCAAAGATACCAACGGTTTTGa  >  1:1120902/1‑51 (MQ=255) aaaaGGCGATACCTATAACGAAGCCTGGGTCAAAGATACCAACGGTTTTGa  >  1:1125093/1‑51 (MQ=255) aaaaGGCGATACCTATAACGAAGCCTGGGTCAAAGATACCAACGGTTTTGa  >  1:1290593/1‑51 (MQ=255) aaaaGGCGATACCTATAACGAAGCCTGGGTCAAAGATACCAACGGTTTTGa  >  1:1350685/1‑51 (MQ=255) aaaaGGCGATACCTATAACGAAGCCTGGGTCAAAGATACCAACGGTTTTGa  >  1:1609263/1‑51 (MQ=255) aaaaGGCGATACCTATAACGAAGCCTGGGTCAAAGATACCAACGGTTTTGa  >  1:1704040/1‑51 (MQ=255) aaaaGGCGATACCTATAACGAAGCCTGGGTCAAAGATACCAACGGTTTTGa  >  1:1741763/1‑51 (MQ=255) aaaaGGCGATACCTATAACGAAGCCTGGGTCAAAGATACCAACGGTTTTGa  >  1:1774123/1‑51 (MQ=255) aaaaGGCGATACCTATAACGAAGCCTGGGTCAAAGATACCAACGGTTTTGa  >  1:181089/1‑51 (MQ=255) aaaaGGCGATACCTATAACGAAGCCTGGGTCAAAGATACCAACGGTTTTGa  >  1:19372/1‑51 (MQ=255) aaaaGGCGATACCTATAACGAAGCCTGGGTCAAAGATACCAACGGTTTTGa  >  1:193739/1‑51 (MQ=255) aaaaGGCGATACCTATAACGAAGCCTGGGTCAAAGATACCAACGGTTTTGa  >  1:1048489/1‑51 (MQ=255) aaaaGGCGATACCTATAACGAAGCCTGGGTCAAAGATACCAACGGTTTTGa  >  1:203906/1‑51 (MQ=255) aaaaGGCGATACCTATAACGAAGCCTGGGTCAAAGATACCAACGGTTTTGa  >  1:205731/1‑51 (MQ=255) aaaaGGCGATACCTATAACGAAGCCTGGGTCAAAGATACCAACGGTTTTGa  >  1:2074319/1‑51 (MQ=255) aaaaGGCGATACCTATAACGAAGCCTGGGTCAAAGATACCAACGGTTTTGa  >  1:2185913/1‑51 (MQ=255) aaaaGGCGATACCTATAACGAAGCCTGGGTCAAAGATACCAACGGTTTTGa  >  1:2248895/1‑51 (MQ=255) aaaaGGCGATACCTATAACGAAGCCTGGGTCAAAGATACCAACGGTTTTGa  >  1:2311707/1‑51 (MQ=255) aaaaGGCGATACCTATAACGAAGCCTGGGTCAAAGATACCAACGGTTTTGa  >  1:2314138/1‑51 (MQ=255) aaaaGGCGATACCTATAACGAAGCCTGGGTCAAAGATACCAACGGTTTTGa  >  1:2380109/1‑51 (MQ=255) aaaaGGCGATACCTATAACGAAGCCTGGGTCAAAGATACCAACGGTTTTGa  >  1:2483711/1‑51 (MQ=255) aaaaGGCGATACCTATAACGAAGCCTGGGTCAAAGATACCAACGGTTTTGa  >  1:2495217/1‑51 (MQ=255) aaaaGGCGATACCTATAACGAAGCCTGGGTCAAAGATACCAACGGTTTTGa  >  1:2557792/1‑51 (MQ=255) aaaaGGCGATACCTATAACGAAGCCTGGGTCAAAGATACCAACGGTTTTGa  >  1:2627440/1‑51 (MQ=255) aaaaGGCGATACCTATAACGAAGCCTGGGTCAAAGATACCAACGGTTTTGa  >  1:2632250/1‑51 (MQ=255) aaaaGGCGATACCTATAACGAAGCCTGGGTCAAAGATACCAACGGTTTTGa  >  1:2711494/1‑51 (MQ=255)  aaaGGCGATACCTATAACGAAGCCTGGGTCAAAGATACCAACGGTTTTGa  >  1:1846799/1‑50 (MQ=255)                                                   | AAAAGGCGATACCTATAACGAAGCCTGGGTCAAAGATACCAACGGTTTTGA  >  minE/1991489‑1991539

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑