Missing coverage evidence...
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CCGCACCAACGGACCGCTGAATGAGCAGTTGCATGAGCGCCATGACGCCAGTGATTTCGAG  >  minE/2002263‑2002323                                                             | ccGCACCATCGGACCGCTGAATGAGCAGTTGCATGAGCGCCATGACGCCAGTGATTTCgag  <  1:1942046/61‑1 (MQ=255) ccGCACCAACGGACCTCTGAATGAGCAGTTGCATGAGCGCCATGACGCCAGTGATTTCgag  <  1:1934548/61‑1 (MQ=255) ccGCACCAACGGACCGCTTAATGAGCAGTTGCATGAGCGCCATGACGCCAGTGATTTCgag  <  1:3385958/61‑1 (MQ=255) ccGCACCAACGGACCGCTGAATTAGCAGTTGCATGAGCGCCATGACGCCAGTGATTTCgag  <  1:3639380/61‑1 (MQ=255) ccGCACCAACGGACCGCTGAATGAGCAGTTGCATGAGCGCCATGACGTCAGTGATTTCgag  <  1:2791205/61‑1 (MQ=255) ccGCACCAACGGACCGCTGAATGAGCAGTTGCATGAGCGCCATGACGCCAGTGATTTCgag  <  1:2899561/61‑1 (MQ=255) ccGCACCAACGGACCGCTGAATGAGCAGTTGCATGAGCGCCATGACGCCAGTGATTTCgag  <  1:317597/61‑1 (MQ=255) ccGCACCAACGGACCGCTGAATGAGCAGTTGCATGAGCGCCATGACGCCAGTGATTTCgag  <  1:3224660/61‑1 (MQ=255) ccGCACCAACGGACCGCTGAATGAGCAGTTGCATGAGCGCCATGACGCCAGTGATTTCgag  <  1:3293161/61‑1 (MQ=255) ccGCACCAACGGACCGCTGAATGAGCAGTTGCATGAGCGCCATGACGCCAGTGATTTCgag  <  1:3464960/61‑1 (MQ=255) ccGCACCAACGGACCGCTGAATGAGCAGTTGCATGAGCGCCATGACGCCAGTGATTTCgag  <  1:3483855/61‑1 (MQ=255) ccGCACCAACGGACCGCTGAATGAGCAGTTGCATGAGCGCCATGACGCCAGTGATTTCgag  <  1:3489404/61‑1 (MQ=255) ccGCACCAACGGACCGCTGAATGAGCAGTTGCATGAGCGCCATGACGCCAGTGATTTCgag  <  1:3567210/61‑1 (MQ=255) ccGCACCAACGGACCGCTGAATGAGCAGTTGCATGAGCGCCATGACGCCAGTGATTTCgag  <  1:3616538/61‑1 (MQ=255) ccGCACCAACGGACCGCTGAATGAGCAGTTGCATGAGCGCCATGACGCCAGTGATTTCgag  <  1:393594/61‑1 (MQ=255) ccGCACCAACGGACCGCTGAATGAGCAGTTGCATGAGCGCCATGACGCCAGTGATTTCgag  <  1:446956/61‑1 (MQ=255) ccGCACCAACGGACCGCTGAATGAGCAGTTGCATGAGCGCCATGACGCCAGTGATTTCgag  <  1:581237/61‑1 (MQ=255) ccGCACCAACGGACCGCTGAATGAGCAGTTGCATGAGCGCCATGACGCCAGTGATTTCgag  <  1:596794/61‑1 (MQ=255) ccGCACCAACGGACCGCTGAATGAGCAGTTGCATGAGCGCCATGACGCCAGTGATTTCgag  <  1:694477/61‑1 (MQ=255) ccGCACCAACGGACCGCTGAATGAGCAGTTGCATGAGCGCCATGACGCCAGTGATTTCgag  <  1:728294/61‑1 (MQ=255) ccGCACCAACGGACCGCTGAATGAGCAGTTGCATGAGCGCCATGACGCCAGTGATTTCgag  <  1:955111/61‑1 (MQ=255) ccGCACCAACGGACCGCTGAATGAGCAGTTGCATGAGCGCCATGACGCCAGTGATTTCgag  <  1:975767/61‑1 (MQ=255) ccGCACCAACGGACCGCTGAATGAGCAGTTGCATGAGCGCCATGACGCCAGTGATTTCgag  <  1:2207338/61‑1 (MQ=255) ccGCACCAACGGACCGCTGAATGAGCAGTTGCATGAGCGCCATGACGCCAGTGATTTCgag  <  1:1223578/61‑1 (MQ=255) ccGCACCAACGGACCGCTGAATGAGCAGTTGCATGAGCGCCATGACGCCAGTGATTTCgag  <  1:1429207/61‑1 (MQ=255) ccGCACCAACGGACCGCTGAATGAGCAGTTGCATGAGCGCCATGACGCCAGTGATTTCgag  <  1:1581412/61‑1 (MQ=255) ccGCACCAACGGACCGCTGAATGAGCAGTTGCATGAGCGCCATGACGCCAGTGATTTCgag  <  1:1677893/61‑1 (MQ=255) ccGCACCAACGGACCGCTGAATGAGCAGTTGCATGAGCGCCATGACGCCAGTGATTTCgag  <  1:1758144/61‑1 (MQ=255) ccGCACCAACGGACCGCTGAATGAGCAGTTGCATGAGCGCCATGACGCCAGTGATTTCgag  <  1:2060587/61‑1 (MQ=255) ccGCACCAACGGACCGCTGAATGAGCAGTTGCATGAGCGCCATGACGCCAGTGATTTCgag  <  1:2081023/61‑1 (MQ=255) ccGCACCAACGGACCGCTGAATGAGCAGTTGCATGAGCGCCATGACGCCAGTGATTTCgag  <  1:2106304/61‑1 (MQ=255) ccGCACCAACGGACCGCTGAATGAGCAGTTGCATGAGCGCCATGACGCCAGTGATTTCgag  <  1:289821/61‑1 (MQ=255) ccGCACCAACGGACCGCTGAATGAGCAGTTGCATGAGCGCCATGACGCCAGTGATTTCgag  <  1:2355194/61‑1 (MQ=255) ccGCACCAACGGACCGCTGAATGAGCAGTTGCATGAGCGCCATGACGCCAGTGATTTCgag  <  1:2378414/61‑1 (MQ=255) ccGCACCAACGGACCGCTGAATGAGCAGTTGCATGAGCGCCATGACGCCAGTGATTTCgag  <  1:2474/61‑1 (MQ=255) ccGCACCAACGGACCGCTGAATGAGCAGTTGCATGAGCGCCATGACGCCAGTGATTTCgag  <  1:2509959/61‑1 (MQ=255) ccGCACCAACGGACCGCTGAATGAGCAGTTGCATGAGCGCCATGACGCCAGTGATTTCgag  <  1:2617569/61‑1 (MQ=255) ccGCACCAACGGACCGCTGAATGAGCAGTTGCATGAGCGCCATGACGCCAGTGATTTCgag  <  1:2663892/61‑1 (MQ=255) ccGCACCAACGGACCGCTGAATGAGCAGTTGCATGAGCGCCATGACGCCAGTGATTTCgag  <  1:2694413/61‑1 (MQ=255) ccGCACCAACGGACCGCTGAAAGAGCAGTTGCATGAGCGCCATGACGCCAGTGATTTCgag  <  1:968802/61‑1 (MQ=255) ccGAACCAACGGACCGCTGAATGAGCAGTTGCATGAGCGCCATGACGCCAGTGATTTCgag  <  1:2758388/61‑1 (MQ=255)  cGCACCAACGGACCGCTGAATGAGCAGTTGCATGAGCGCCATGACGCCAGTGATTTCgag  <  1:819177/60‑1 (MQ=255)  cGCACCAACGGACCGCTGAATGAGCAGTTGCATGAGCGCCATGACGCCAGTGATTTCgag  <  1:1215260/60‑1 (MQ=255)                     aTGAGCAGTTGCATGAGCGCCATGACGCCAGTGATTTCgag  <  1:3232228/41‑1 (MQ=255)                       gAGCAGTTGCATGAGCGCCATGACGCCAGTGATTTCgag  <  1:596688/39‑1 (MQ=255)                         gCAGTTGCATGAGCGCCATGACGCCAGTGATTTCgag  <  1:3267434/37‑1 (MQ=255)                                                             | CCGCACCAACGGACCGCTGAATGAGCAGTTGCATGAGCGCCATGACGCCAGTGATTTCGAG  >  minE/2002263‑2002323

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑