Missing coverage evidence...
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CAATACCGCCGAGGATCACCGGTACATCTTTCCACGCCTCTTTACAACGCTGGGTATAAACC  >  minE/2023420‑2023481                                                              | cAATACCGCCTAGGATCACCGGTACATCTTTCCACGCCTCTTTACAACGCTGGGTATAAAcc  <  1:1297803/62‑1 (MQ=255) cAATACCGCCGAGTATCACCGGTACATCTTTCCACGCCTCTTTACAACGCTGGGTATAAAcc  <  1:1777283/62‑1 (MQ=255) cAATACCGCCGAGGATCACCGGTACATCTTTCCACGCCTCTTTACAACGCTGGGTATATAcc  <  1:2730765/62‑1 (MQ=255) cAATACCGCCGAGGATCACCGGTACATCTTTCCACGCCTCTTTACAACGCTGGGTATAAAcc  <  1:3398890/62‑1 (MQ=255) cAATACCGCCGAGGATCACCGGTACATCTTTCCACGCCTCTTTACAACGCTGGGTATAAAcc  <  1:1057179/62‑1 (MQ=255) cAATACCGCCGAGGATCACCGGTACATCTTTCCACGCCTCTTTACAACGCTGGGTATAAAcc  <  1:2803755/62‑1 (MQ=255) cAATACCGCCGAGGATCACCGGTACATCTTTCCACGCCTCTTTACAACGCTGGGTATAAAcc  <  1:2888358/62‑1 (MQ=255) cAATACCGCCGAGGATCACCGGTACATCTTTCCACGCCTCTTTACAACGCTGGGTATAAAcc  <  1:3136772/62‑1 (MQ=255) cAATACCGCCGAGGATCACCGGTACATCTTTCCACGCCTCTTTACAACGCTGGGTATAAAcc  <  1:3142169/62‑1 (MQ=255) cAATACCGCCGAGGATCACCGGTACATCTTTCCACGCCTCTTTACAACGCTGGGTATAAAcc  <  1:3170473/62‑1 (MQ=255) cAATACCGCCGAGGATCACCGGTACATCTTTCCACGCCTCTTTACAACGCTGGGTATAAAcc  <  1:3222885/62‑1 (MQ=255) cAATACCGCCGAGGATCACCGGTACATCTTTCCACGCCTCTTTACAACGCTGGGTATAAAcc  <  1:3306099/62‑1 (MQ=255) cAATACCGCCGAGGATCACCGGTACATCTTTCCACGCCTCTTTACAACGCTGGGTATAAAcc  <  1:3373001/62‑1 (MQ=255) cAATACCGCCGAGGATCACCGGTACATCTTTCCACGCCTCTTTACAACGCTGGGTATAAAcc  <  1:2696096/62‑1 (MQ=255) cAATACCGCCGAGGATCACCGGTACATCTTTCCACGCCTCTTTACAACGCTGGGTATAAAcc  <  1:3402240/62‑1 (MQ=255) cAATACCGCCGAGGATCACCGGTACATCTTTCCACGCCTCTTTACAACGCTGGGTATAAAcc  <  1:3432254/62‑1 (MQ=255) cAATACCGCCGAGGATCACCGGTACATCTTTCCACGCCTCTTTACAACGCTGGGTATAAAcc  <  1:3477367/62‑1 (MQ=255) cAATACCGCCGAGGATCACCGGTACATCTTTCCACGCCTCTTTACAACGCTGGGTATAAAcc  <  1:3529105/62‑1 (MQ=255) cAATACCGCCGAGGATCACCGGTACATCTTTCCACGCCTCTTTACAACGCTGGGTATAAAcc  <  1:415716/62‑1 (MQ=255) cAATACCGCCGAGGATCACCGGTACATCTTTCCACGCCTCTTTACAACGCTGGGTATAAAcc  <  1:624190/62‑1 (MQ=255) cAATACCGCCGAGGATCACCGGTACATCTTTCCACGCCTCTTTACAACGCTGGGTATAAAcc  <  1:799381/62‑1 (MQ=255) cAATACCGCCGAGGATCACCGGTACATCTTTCCACGCCTCTTTACAACGCTGGGTATAAAcc  <  1:867266/62‑1 (MQ=255) cAATACCGCCGAGGATCACCGGTACATCTTTCCACGCCTCTTTACAACGCTGGGTATAAAcc  <  1:989354/62‑1 (MQ=255) cAATACCGCCGAGGATCACCGGTACATCTTTCCACGCCTCTTTACAACGCTGGGTATAAAcc  <  1:162745/62‑1 (MQ=255) cAATACCGCCGAGGATCACCGGTACATCTTTCCACGCCTCTTTACAACGCTGGGTATAAAcc  <  1:1214414/62‑1 (MQ=255) cAATACCGCCGAGGATCACCGGTACATCTTTCCACGCCTCTTTACAACGCTGGGTATAAAcc  <  1:1248188/62‑1 (MQ=255) cAATACCGCCGAGGATCACCGGTACATCTTTCCACGCCTCTTTACAACGCTGGGTATAAAcc  <  1:1287584/62‑1 (MQ=255) cAATACCGCCGAGGATCACCGGTACATCTTTCCACGCCTCTTTACAACGCTGGGTATAAAcc  <  1:1356422/62‑1 (MQ=255) cAATACCGCCGAGGATCACCGGTACATCTTTCCACGCCTCTTTACAACGCTGGGTATAAAcc  <  1:1451708/62‑1 (MQ=255) cAATACCGCCGAGGATCACCGGTACATCTTTCCACGCCTCTTTACAACGCTGGGTATAAAcc  <  1:1490199/62‑1 (MQ=255) cAATACCGCCGAGGATCACCGGTACATCTTTCCACGCCTCTTTACAACGCTGGGTATAAAcc  <  1:1505651/62‑1 (MQ=255) cAATACCGCCGAGGATCACCGGTACATCTTTCCACGCCTCTTTACAACGCTGGGTATAAAcc  <  1:1508552/62‑1 (MQ=255) cAATACCGCCGAGGATCACCGGTACATCTTTCCACGCCTCTTTACAACGCTGGGTATAAAcc  <  1:269/62‑1 (MQ=255) cAATACCGCCGAGGATCACCGGTACATCTTTCCACGCCTCTTTACAACGCTGGGTATAAAcc  <  1:1694530/62‑1 (MQ=255) cAATACCGCCGAGGATCACCGGTACATCTTTCCACGCCTCTTTACAACGCTGGGTATAAAcc  <  1:1889674/62‑1 (MQ=255) cAATACCGCCGAGGATCACCGGTACATCTTTCCACGCCTCTTTACAACGCTGGGTATAAAcc  <  1:2158539/62‑1 (MQ=255) cAATACCGCCGAGGATCACCGGTACATCTTTCCACGCCTCTTTACAACGCTGGGTATAAAcc  <  1:2328876/62‑1 (MQ=255) cAATACCGCCGAGGATCACCGGTACATCTTTCCACGCCTCTTTACAACGCTGGGTATAAAcc  <  1:2350047/62‑1 (MQ=255) cAATACCGCCGAGGATCACCGGTACATCTTTCCACGCCTCTTTACAACGCTGGGTATAAAcc  <  1:2488798/62‑1 (MQ=255) cAATACCGCCGAGGATCACCGGTACATCTTTCCACGCCTCTTTACAACGCTGGGTATAAAcc  <  1:2533980/62‑1 (MQ=255) cAATACCGCCGAGGATCACCGGTACATCTTTCCACGCCTCTTTACAACGCTGGGTATAAAcc  <  1:2546371/62‑1 (MQ=255)    tACCGCCGAGGATCACCGGTACATCTTTCCACGCCTCTTTACAACGCTGGGTATAAAcc  <  1:833206/59‑1 (MQ=255)               aTCACCGGTACATCTTTCCACGCCTCTTTACAACGCTGGGTATAAAcc  <  1:2239758/48‑1 (MQ=255)                   ccGGTACATCTTTCCACGCCTCTTTACAACGCTGGGTATAAAcc  <  1:1240443/44‑1 (MQ=255)                         cATCTTTCCACGCCTCTTTACATCGCTGGGTATAAAcc  <  1:2791055/38‑1 (MQ=255)                         cATCTTTCCACGCCTCTTTACAACGCTGGGTATAAAcc  <  1:3521812/38‑1 (MQ=255)                                                              | CAATACCGCCGAGGATCACCGGTACATCTTTCCACGCCTCTTTACAACGCTGGGTATAAACC  >  minE/2023420‑2023481

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑