Missing coverage evidence...
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AGATGCCCTTCCATATGGTGTACAGGGATCGCCGGAACGTCCCAGGCAAACGCCAGAGAACG  >  minE/2060910‑2060971                                                              | aGATGCCCTTCCATATGGTGTACAGGGATCGCCGGAACGTCCCAGGCAAACGCCAGAGAACg  >  1:2898115/1‑62 (MQ=255) aGATGCCCTTCCATATGGTGTACAGGGATCGCCGGAACGTCCCAGGCAAACGCCAGAGAACg  >  1:810282/1‑62 (MQ=255) aGATGCCCTTCCATATGGTGTACAGGGATCGCCGGAACGTCCCAGGCAAACGCCAGAGAACg  >  1:712408/1‑62 (MQ=255) aGATGCCCTTCCATATGGTGTACAGGGATCGCCGGAACGTCCCAGGCAAACGCCAGAGAACg  >  1:663929/1‑62 (MQ=255) aGATGCCCTTCCATATGGTGTACAGGGATCGCCGGAACGTCCCAGGCAAACGCCAGAGAACg  >  1:454781/1‑62 (MQ=255) aGATGCCCTTCCATATGGTGTACAGGGATCGCCGGAACGTCCCAGGCAAACGCCAGAGAACg  >  1:3641150/1‑62 (MQ=255) aGATGCCCTTCCATATGGTGTACAGGGATCGCCGGAACGTCCCAGGCAAACGCCAGAGAACg  >  1:3582732/1‑62 (MQ=255) aGATGCCCTTCCATATGGTGTACAGGGATCGCCGGAACGTCCCAGGCAAACGCCAGAGAACg  >  1:3547534/1‑62 (MQ=255) aGATGCCCTTCCATATGGTGTACAGGGATCGCCGGAACGTCCCAGGCAAACGCCAGAGAACg  >  1:3345714/1‑62 (MQ=255) aGATGCCCTTCCATATGGTGTACAGGGATCGCCGGAACGTCCCAGGCAAACGCCAGAGAACg  >  1:3319927/1‑62 (MQ=255) aGATGCCCTTCCATATGGTGTACAGGGATCGCCGGAACGTCCCAGGCAAACGCCAGAGAACg  >  1:318754/1‑62 (MQ=255) aGATGCCCTTCCATATGGTGTACAGGGATCGCCGGAACGTCCCAGGCAAACGCCAGAGAACg  >  1:2955184/1‑62 (MQ=255) aGATGCCCTTCCATATGGTGTACAGGGATCGCCGGAACGTCCCAGGCAAACGCCAGAGAACg  >  1:1072145/1‑62 (MQ=255) aGATGCCCTTCCATATGGTGTACAGGGATCGCCGGAACGTCCCAGGCAAACGCCAGAGAACg  >  1:2880751/1‑62 (MQ=255) aGATGCCCTTCCATATGGTGTACAGGGATCGCCGGAACGTCCCAGGCAAACGCCAGAGAACg  >  1:2592800/1‑62 (MQ=255) aGATGCCCTTCCATATGGTGTACAGGGATCGCCGGAACGTCCCAGGCAAACGCCAGAGAACg  >  1:245060/1‑62 (MQ=255) aGATGCCCTTCCATATGGTGTACAGGGATCGCCGGAACGTCCCAGGCAAACGCCAGAGAACg  >  1:2324789/1‑62 (MQ=255) aGATGCCCTTCCATATGGTGTACAGGGATCGCCGGAACGTCCCAGGCAAACGCCAGAGAACg  >  1:2050402/1‑62 (MQ=255) aGATGCCCTTCCATATGGTGTACAGGGATCGCCGGAACGTCCCAGGCAAACGCCAGAGAACg  >  1:1764311/1‑62 (MQ=255) aGATGCCCTTCCATATGGTGTACAGGGATCGCCGGAACGTCCCAGGCAAACGCCAGAGAACg  >  1:1622238/1‑62 (MQ=255) aGATGCCCTTCCATATGGTGTACAGGGATCGCCGGAACGTCCCAGGCAAACGCCAGAGAACg  >  1:1197108/1‑62 (MQ=255) aGATGCCCTTCCATATGGTGTACAGGGATCGCCGGAACGTCCCAGGCAAACGCCAGAGAACg  >  1:1128157/1‑62 (MQ=255) aGATGCCCTTCCATATGGTATACAGGGATCGCCGGAACGTCCCAGGCAAACGCCAGAGAACg  >  1:153027/1‑62 (MQ=255)                                                              | AGATGCCCTTCCATATGGTGTACAGGGATCGCCGGAACGTCCCAGGCAAACGCCAGAGAACG  >  minE/2060910‑2060971

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑