Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2064608	2064656	49	39 [0]	[0] 5	rpoD	RNA polymerase, sigma 70 (sigma D) factor

CCGAAGCAGTTTGACTACCTGGTCAACAGCATGCGCGTCATGATGGACCGCGTTCGTACGCA  >  minE/2064546‑2064607                                                              | ccGAAGCAGTTTGACTACCTGGTCAACAGCATGCGCGTCATGATGGACCGCGTTCGTACGCa  <  1:401224/62‑1 (MQ=255) ccGAAGCAGTTTGACTACCTGGTCAACAGCATGCGCGTCATGATGGACCGCGTTCGTACGCa  <  1:1002604/62‑1 (MQ=255) ccGAAGCAGTTTGACTACCTGGTCAACAGCATGCGCGTCATGATGGACCGCGTTCGTACGCa  <  1:2590748/62‑1 (MQ=255) ccGAAGCAGTTTGACTACCTGGTCAACAGCATGCGCGTCATGATGGACCGCGTTCGTACGCa  <  1:2631489/62‑1 (MQ=255) ccGAAGCAGTTTGACTACCTGGTCAACAGCATGCGCGTCATGATGGACCGCGTTCGTACGCa  <  1:3062316/62‑1 (MQ=255) ccGAAGCAGTTTGACTACCTGGTCAACAGCATGCGCGTCATGATGGACCGCGTTCGTACGCa  <  1:3097097/62‑1 (MQ=255) ccGAAGCAGTTTGACTACCTGGTCAACAGCATGCGCGTCATGATGGACCGCGTTCGTACGCa  <  1:3209511/62‑1 (MQ=255) ccGAAGCAGTTTGACTACCTGGTCAACAGCATGCGCGTCATGATGGACCGCGTTCGTACGCa  <  1:3250242/62‑1 (MQ=255) ccGAAGCAGTTTGACTACCTGGTCAACAGCATGCGCGTCATGATGGACCGCGTTCGTACGCa  <  1:326558/62‑1 (MQ=255) ccGAAGCAGTTTGACTACCTGGTCAACAGCATGCGCGTCATGATGGACCGCGTTCGTACGCa  <  1:3467217/62‑1 (MQ=255) ccGAAGCAGTTTGACTACCTGGTCAACAGCATGCGCGTCATGATGGACCGCGTTCGTACGCa  <  1:2468819/62‑1 (MQ=255) ccGAAGCAGTTTGACTACCTGGTCAACAGCATGCGCGTCATGATGGACCGCGTTCGTACGCa  <  1:433236/62‑1 (MQ=255) ccGAAGCAGTTTGACTACCTGGTCAACAGCATGCGCGTCATGATGGACCGCGTTCGTACGCa  <  1:509859/62‑1 (MQ=255) ccGAAGCAGTTTGACTACCTGGTCAACAGCATGCGCGTCATGATGGACCGCGTTCGTACGCa  <  1:538934/62‑1 (MQ=255) ccGAAGCAGTTTGACTACCTGGTCAACAGCATGCGCGTCATGATGGACCGCGTTCGTACGCa  <  1:539154/62‑1 (MQ=255) ccGAAGCAGTTTGACTACCTGGTCAACAGCATGCGCGTCATGATGGACCGCGTTCGTACGCa  <  1:558302/62‑1 (MQ=255) ccGAAGCAGTTTGACTACCTGGTCAACAGCATGCGCGTCATGATGGACCGCGTTCGTACGCa  <  1:79013/62‑1 (MQ=255) ccGAAGCAGTTTGACTACCTGGTCAACAGCATGCGCGTCATGATGGACCGCGTTCGTACGCa  <  1:806434/62‑1 (MQ=255) ccGAAGCAGTTTGACTACCTGGTCAACAGCATGCGCGTCATGATGGACCGCGTTCGTACGCa  <  1:906505/62‑1 (MQ=255) ccGAAGCAGTTTGACTACCTGGTCAACAGCATGCGCGTCATGATGGACCGCGTTCGTACGCa  <  1:1771946/62‑1 (MQ=255) ccGAAGCAGTTTGACTACCTGGTCAACAGCATGCGCGTCATGATGGACCGCGTTCGTACGCa  <  1:1176432/62‑1 (MQ=255) ccGAAGCAGTTTGACTACCTGGTCAACAGCATGCGCGTCATGATGGACCGCGTTCGTACGCa  <  1:1366453/62‑1 (MQ=255) ccGAAGCAGTTTGACTACCTGGTCAACAGCATGCGCGTCATGATGGACCGCGTTCGTACGCa  <  1:1469302/62‑1 (MQ=255) ccGAAGCAGTTTGACTACCTGGTCAACAGCATGCGCGTCATGATGGACCGCGTTCGTACGCa  <  1:1539809/62‑1 (MQ=255) ccGAAGCAGTTTGACTACCTGGTCAACAGCATGCGCGTCATGATGGACCGCGTTCGTACGCa  <  1:1550308/62‑1 (MQ=255) ccGAAGCAGTTTGACTACCTGGTCAACAGCATGCGCGTCATGATGGACCGCGTTCGTACGCa  <  1:155459/62‑1 (MQ=255) ccGAAGCAGTTTGACTACCTGGTCAACAGCATGCGCGTCATGATGGACCGCGTTCGTACGCa  <  1:1684076/62‑1 (MQ=255) ccGAAGCAGTTTGACTACCTGGTCAACAGCATGCGCGTCATGATGGACCGCGTTCGTACGCa  <  1:1129195/62‑1 (MQ=255) ccGAAGCAGTTTGACTACCTGGTCAACAGCATGCGCGTCATGATGGACCGCGTTCGTACGCa  <  1:1811741/62‑1 (MQ=255) ccGAAGCAGTTTGACTACCTGGTCAACAGCATGCGCGTCATGATGGACCGCGTTCGTACGCa  <  1:195951/62‑1 (MQ=255) ccGAAGCAGTTTGACTACCTGGTCAACAGCATGCGCGTCATGATGGACCGCGTTCGTACGCa  <  1:1966783/62‑1 (MQ=255) ccGAAGCAGTTTGACTACCTGGTCAACAGCATGCGCGTCATGATGGACCGCGTTCGTACGCa  <  1:204970/62‑1 (MQ=255) ccGAAGCAGTTTGACTACCTGGTCAACAGCATGCGCGTCATGATGGACCGCGTTCGTACGCa  <  1:2099820/62‑1 (MQ=255) ccGAAGCAGTTTGACTACCTGGTCAACAGCATGCGCGTCATGATGGACCGCGTTCGTACGCa  <  1:2124080/62‑1 (MQ=255) ccGAAGCAGTTTGACTACCTGGTCAACAGCATGCGCGTCATGATGGACCGCGTTCGTACGCa  <  1:2366322/62‑1 (MQ=255) ccGAAGCAGTTTGACTACCTGGTCAACAGCATGCGCGTCATGATGGACAGCGTTCGTACGCa  <  1:1501482/62‑1 (MQ=255)      gCAGTTTGACTACCTGGTCAACAGCATGCGCGTCATGATGGACCGCGTTCGTACGCa  <  1:3405469/57‑1 (MQ=255)                      gTCAACAGCATGCGCGTCATGATGGACCGCGTTCGTACGCa  <  1:2147436/41‑1 (MQ=255)                          aCAGCATGCGCGTCATGATGGACCGCGTTCGTACGCa  <  1:3624294/37‑1 (MQ=255)                                                              | CCGAAGCAGTTTGACTACCTGGTCAACAGCATGCGCGTCATGATGGACCGCGTTCGTACGCA  >  minE/2064546‑2064607

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑