Missing coverage evidence...
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CACCCGCGTGCCGCTGATGAATGAGTTTGGTGAATACCCGCATCCGAAGCCGCGCATCATCT  >  minE/2074815‑2074876                                                              | cacGCGCGTGCCGCTGATGAATGAGTTTGGTGAATACCCGCATCCGAAGCCGCGCATCATCt  <  1:2319865/62‑1 (MQ=255) cacCCGCGTGCCGCTGATTAATGAGTTTGGTGAATACCCGCATCCGAAGCCGCGCATCATCt  <  1:393480/62‑1 (MQ=255) cacCCGCGTGCCGCTGATGAATGAGTTTTGTGAATACCCGCATCCGAAGCCGCGCATCATCt  <  1:2289624/62‑1 (MQ=255) cacCCGCGTGCCGCTGATGAATGAGTTTGGTGAATACCCGCATCCGAAGCCGCGCATCATCt  <  1:3345065/62‑1 (MQ=255) cacCCGCGTGCCGCTGATGAATGAGTTTGGTGAATACCCGCATCCGAAGCCGCGCATCATCt  <  1:2798307/62‑1 (MQ=255) cacCCGCGTGCCGCTGATGAATGAGTTTGGTGAATACCCGCATCCGAAGCCGCGCATCATCt  <  1:2800082/62‑1 (MQ=255) cacCCGCGTGCCGCTGATGAATGAGTTTGGTGAATACCCGCATCCGAAGCCGCGCATCATCt  <  1:2979374/62‑1 (MQ=255) cacCCGCGTGCCGCTGATGAATGAGTTTGGTGAATACCCGCATCCGAAGCCGCGCATCATCt  <  1:29915/62‑1 (MQ=255) cacCCGCGTGCCGCTGATGAATGAGTTTGGTGAATACCCGCATCCGAAGCCGCGCATCATCt  <  1:3040114/62‑1 (MQ=255) cacCCGCGTGCCGCTGATGAATGAGTTTGGTGAATACCCGCATCCGAAGCCGCGCATCATCt  <  1:3071001/62‑1 (MQ=255) cacCCGCGTGCCGCTGATGAATGAGTTTGGTGAATACCCGCATCCGAAGCCGCGCATCATCt  <  1:3083876/62‑1 (MQ=255) cacCCGCGTGCCGCTGATGAATGAGTTTGGTGAATACCCGCATCCGAAGCCGCGCATCATCt  <  1:3169619/62‑1 (MQ=255) cacCCGCGTGCCGCTGATGAATGAGTTTGGTGAATACCCGCATCCGAAGCCGCGCATCATCt  <  1:3254142/62‑1 (MQ=255) cacCCGCGTGCCGCTGATGAATGAGTTTGGTGAATACCCGCATCCGAAGCCGCGCATCATCt  <  1:1200265/62‑1 (MQ=255) cacCCGCGTGCCGCTGATGAATGAGTTTGGTGAATACCCGCATCCGAAGCCGCGCATCATCt  <  1:3359262/62‑1 (MQ=255) cacCCGCGTGCCGCTGATGAATGAGTTTGGTGAATACCCGCATCCGAAGCCGCGCATCATCt  <  1:3393690/62‑1 (MQ=255) cacCCGCGTGCCGCTGATGAATGAGTTTGGTGAATACCCGCATCCGAAGCCGCGCATCATCt  <  1:3422944/62‑1 (MQ=255) cacCCGCGTGCCGCTGATGAATGAGTTTGGTGAATACCCGCATCCGAAGCCGCGCATCATCt  <  1:3480063/62‑1 (MQ=255) cacCCGCGTGCCGCTGATGAATGAGTTTGGTGAATACCCGCATCCGAAGCCGCGCATCATCt  <  1:410289/62‑1 (MQ=255) cacCCGCGTGCCGCTGATGAATGAGTTTGGTGAATACCCGCATCCGAAGCCGCGCATCATCt  <  1:55598/62‑1 (MQ=255) cacCCGCGTGCCGCTGATGAATGAGTTTGGTGAATACCCGCATCCGAAGCCGCGCATCATCt  <  1:580521/62‑1 (MQ=255) cacCCGCGTGCCGCTGATGAATGAGTTTGGTGAATACCCGCATCCGAAGCCGCGCATCATCt  <  1:902134/62‑1 (MQ=255) cacCCGCGTGCCGCTGATGAATGAGTTTGGTGAATACCCGCATCCGAAGCCGCGCATCATCt  <  1:987565/62‑1 (MQ=255) cacCCGCGTGCCGCTGATGAATGAGTTTGGTGAATACCCGCATCCGAAGCCGCGCATCATCt  <  1:2679182/62‑1 (MQ=255) cacCCGCGTGCCGCTGATGAATGAGTTTGGTGAATACCCGCATCCGAAGCCGCGCATCATCt  <  1:1066496/62‑1 (MQ=255) cacCCGCGTGCCGCTGATGAATGAGTTTGGTGAATACCCGCATCCGAAGCCGCGCATCATCt  <  1:1212423/62‑1 (MQ=255) cacCCGCGTGCCGCTGATGAATGAGTTTGGTGAATACCCGCATCCGAAGCCGCGCATCATCt  <  1:1231724/62‑1 (MQ=255) cacCCGCGTGCCGCTGATGAATGAGTTTGGTGAATACCCGCATCCGAAGCCGCGCATCATCt  <  1:1237203/62‑1 (MQ=255) cacCCGCGTGCCGCTGATGAATGAGTTTGGTGAATACCCGCATCCGAAGCCGCGCATCATCt  <  1:1340108/62‑1 (MQ=255) cacCCGCGTGCCGCTGATGAATGAGTTTGGTGAATACCCGCATCCGAAGCCGCGCATCATCt  <  1:135761/62‑1 (MQ=255) cacCCGCGTGCCGCTGATGAATGAGTTTGGTGAATACCCGCATCCGAAGCCGCGCATCATCt  <  1:1427096/62‑1 (MQ=255) cacCCGCGTGCCGCTGATGAATGAGTTTGGTGAATACCCGCATCCGAAGCCGCGCATCATCt  <  1:1433211/62‑1 (MQ=255) cacCCGCGTGCCGCTGATGAATGAGTTTGGTGAATACCCGCATCCGAAGCCGCGCATCATCt  <  1:1804526/62‑1 (MQ=255) cacCCGCGTGCCGCTGATGAATGAGTTTGGTGAATACCCGCATCCGAAGCCGCGCATCATCt  <  1:1810135/62‑1 (MQ=255) cacCCGCGTGCCGCTGATGAATGAGTTTGGTGAATACCCGCATCCGAAGCCGCGCATCATCt  <  1:1915479/62‑1 (MQ=255) cacCCGCGTGCCGCTGATGAATGAGTTTGGTGAATACCCGCATCCGAAGCCGCGCATCATCt  <  1:19458/62‑1 (MQ=255) cacCCGCGTGCCGCTGATGAATGAGTTTGGTGAATACCCGCATCCGAAGCCGCGCATCATCt  <  1:1976823/62‑1 (MQ=255) cacCCGCGTGCCGCTGATGAATGAGTTTGGTGAATACCCGCATCCGAAGCCGCGCATCATCt  <  1:2360319/62‑1 (MQ=255) cacCCGCGTGCCGCTGATGAATGAGTTTGGTGAATACCCGCATCCGAAGCCGCGCATCATCt  <  1:2496770/62‑1 (MQ=255) cacCCGCGTGCCGCTGATGAATGAGTTTGGTGAATACCCGCATCCGAAGCAGCGCATCATCt  <  1:464082/62‑1 (MQ=255)  acCCGCGTGCCGCTGATGTATGAGTTTGGTGAATACCCGCATCCGAAGCCGCGCATCATCt  <  1:2129416/61‑1 (MQ=255)  acCCGCGTGCCGCTGATGAATGAGTTTGGTGAATACCCGCATCCGAAGCCGCGCATCATCt  <  1:357222/61‑1 (MQ=255)  acCCGCGTGCCGCTGATGAATGAGTTTGGTGAATACCCGCATCCGAAGCCGCGCATCATCt  <  1:2154648/61‑1 (MQ=255)  acCCGCGTGCCGCTGATGAATGAGTTTGGTGAATACCCGCATCCGAAGCCGCGCATCATCt  <  1:2568589/61‑1 (MQ=255)  acCCGCGTGCCGCTGATGAATGAGTTTGGTGAATACCCGCATCCGAAGCCGCGCATCATCt  <  1:2736300/61‑1 (MQ=255)   cccGCGTGCCGCTGATGAATGAGTTTGGTGAATACCCGCATCCGAAGCCGCGCATCATCt  <  1:1560510/60‑1 (MQ=255)                gatgaATGAGTTTGGTGAATACCCGCATCCGAAGCCGCGCATCATCt  <  1:784283/47‑1 (MQ=255)                                                              | CACCCGCGTGCCGCTGATGAATGAGTTTGGTGAATACCCGCATCCGAAGCCGCGCATCATCT  >  minE/2074815‑2074876

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑