Missing coverage evidence...
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GGAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCC  >  minE/2104090‑2104150                                                             | ggAAGCTGGAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTcc  <  1:3163197/61‑1 (MQ=255) ggAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTcc  <  1:471661/61‑1 (MQ=255) ggAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTcc  <  1:3069405/61‑1 (MQ=255) ggAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTcc  <  1:3135306/61‑1 (MQ=255) ggAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTcc  <  1:3261091/61‑1 (MQ=255) ggAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTcc  <  1:3374405/61‑1 (MQ=255) ggAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTcc  <  1:339688/61‑1 (MQ=255) ggAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTcc  <  1:3538445/61‑1 (MQ=255) ggAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTcc  <  1:3624662/61‑1 (MQ=255) ggAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTcc  <  1:381799/61‑1 (MQ=255) ggAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTcc  <  1:405847/61‑1 (MQ=255) ggAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTcc  <  1:436437/61‑1 (MQ=255) ggAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTcc  <  1:3006086/61‑1 (MQ=255) ggAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTcc  <  1:500668/61‑1 (MQ=255) ggAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTcc  <  1:500703/61‑1 (MQ=255) ggAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTcc  <  1:513260/61‑1 (MQ=255) ggAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTcc  <  1:546304/61‑1 (MQ=255) ggAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTcc  <  1:682621/61‑1 (MQ=255) ggAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTcc  <  1:782400/61‑1 (MQ=255) ggAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTcc  <  1:796738/61‑1 (MQ=255) ggAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTcc  <  1:805881/61‑1 (MQ=255) ggAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTcc  <  1:873368/61‑1 (MQ=255) ggAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTcc  <  1:92255/61‑1 (MQ=255) ggAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTcc  <  1:994781/61‑1 (MQ=255) ggAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTcc  <  1:2235366/61‑1 (MQ=255) ggAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTcc  <  1:1088360/61‑1 (MQ=255) ggAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTcc  <  1:1134091/61‑1 (MQ=255) ggAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTcc  <  1:1134344/61‑1 (MQ=255) ggAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTcc  <  1:1450615/61‑1 (MQ=255) ggAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTcc  <  1:1470803/61‑1 (MQ=255) ggAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTcc  <  1:1674454/61‑1 (MQ=255) ggAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTcc  <  1:1715562/61‑1 (MQ=255) ggAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTcc  <  1:183714/61‑1 (MQ=255) ggAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTcc  <  1:1877556/61‑1 (MQ=255) ggAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTcc  <  1:1897880/61‑1 (MQ=255) ggAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTcc  <  1:2047647/61‑1 (MQ=255) ggAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTcc  <  1:1049203/61‑1 (MQ=255) ggAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTcc  <  1:2312027/61‑1 (MQ=255) ggAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTcc  <  1:2356628/61‑1 (MQ=255) ggAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTcc  <  1:2419787/61‑1 (MQ=255) ggAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTcc  <  1:2432206/61‑1 (MQ=255) ggAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTcc  <  1:2549124/61‑1 (MQ=255) ggAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTcc  <  1:2674411/61‑1 (MQ=255) ggAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTcc  <  1:2693738/61‑1 (MQ=255) ggAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTcc  <  1:2723268/61‑1 (MQ=255) ggAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTcc  <  1:2750854/61‑1 (MQ=255)                    gCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTcc  <  1:2385972/42‑1 (MQ=255)                        gTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTcc  <  1:2678408/38‑1 (MQ=255)                                                             | GGAAGCTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCC  >  minE/2104090‑2104150

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑