Missing coverage evidence...
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GATGGTAAAAGCCGTGCCCCATTTATTATAACCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCG  >  minE/2113369‑2113429                                                             | gATGGTAAAAGCCGTGCCCCATTTATTATAACCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCg  <  1:3215623/61‑1 (MQ=255) gATGGTAAAAGCCGTGCCCCATTTATTATAACCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCg  <  1:2654562/61‑1 (MQ=255) gATGGTAAAAGCCGTGCCCCATTTATTATAACCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCg  <  1:2675849/61‑1 (MQ=255) gATGGTAAAAGCCGTGCCCCATTTATTATAACCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCg  <  1:2687127/61‑1 (MQ=255) gATGGTAAAAGCCGTGCCCCATTTATTATAACCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCg  <  1:2780483/61‑1 (MQ=255) gATGGTAAAAGCCGTGCCCCATTTATTATAACCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCg  <  1:2835689/61‑1 (MQ=255) gATGGTAAAAGCCGTGCCCCATTTATTATAACCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCg  <  1:2843271/61‑1 (MQ=255) gATGGTAAAAGCCGTGCCCCATTTATTATAACCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCg  <  1:2889544/61‑1 (MQ=255) gATGGTAAAAGCCGTGCCCCATTTATTATAACCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCg  <  1:2893028/61‑1 (MQ=255) gATGGTAAAAGCCGTGCCCCATTTATTATAACCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCg  <  1:2944017/61‑1 (MQ=255) gATGGTAAAAGCCGTGCCCCATTTATTATAACCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCg  <  1:2985564/61‑1 (MQ=255) gATGGTAAAAGCCGTGCCCCATTTATTATAACCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCg  <  1:3116909/61‑1 (MQ=255) gATGGTAAAAGCCGTGCCCCATTTATTATAACCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCg  <  1:2642717/61‑1 (MQ=255) gATGGTAAAAGCCGTGCCCCATTTATTATAACCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCg  <  1:3265935/61‑1 (MQ=255) gATGGTAAAAGCCGTGCCCCATTTATTATAACCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCg  <  1:337504/61‑1 (MQ=255) gATGGTAAAAGCCGTGCCCCATTTATTATAACCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCg  <  1:3380582/61‑1 (MQ=255) gATGGTAAAAGCCGTGCCCCATTTATTATAACCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCg  <  1:3520383/61‑1 (MQ=255) gATGGTAAAAGCCGTGCCCCATTTATTATAACCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCg  <  1:3555506/61‑1 (MQ=255) gATGGTAAAAGCCGTGCCCCATTTATTATAACCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCg  <  1:595270/61‑1 (MQ=255) gATGGTAAAAGCCGTGCCCCATTTATTATAACCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCg  <  1:657910/61‑1 (MQ=255) gATGGTAAAAGCCGTGCCCCATTTATTATAACCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCg  <  1:675281/61‑1 (MQ=255) gATGGTAAAAGCCGTGCCCCATTTATTATAACCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCg  <  1:699935/61‑1 (MQ=255) gATGGTAAAAGCCGTGCCCCATTTATTATAACCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCg  <  1:758968/61‑1 (MQ=255) gATGGTAAAAGCCGTGCCCCATTTATTATAACCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCg  <  1:77350/61‑1 (MQ=255) gATGGTAAAAGCCGTGCCCCATTTATTATAACCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCg  <  1:1961838/61‑1 (MQ=255) gATGGTAAAAGCCGTGCCCCATTTATTATAACCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCg  <  1:1043155/61‑1 (MQ=255) gATGGTAAAAGCCGTGCCCCATTTATTATAACCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCg  <  1:1105205/61‑1 (MQ=255) gATGGTAAAAGCCGTGCCCCATTTATTATAACCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCg  <  1:1189566/61‑1 (MQ=255) gATGGTAAAAGCCGTGCCCCATTTATTATAACCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCg  <  1:1347219/61‑1 (MQ=255) gATGGTAAAAGCCGTGCCCCATTTATTATAACCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCg  <  1:1396022/61‑1 (MQ=255) gATGGTAAAAGCCGTGCCCCATTTATTATAACCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCg  <  1:1547243/61‑1 (MQ=255) gATGGTAAAAGCCGTGCCCCATTTATTATAACCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCg  <  1:1640821/61‑1 (MQ=255) gATGGTAAAAGCCGTGCCCCATTTATTATAACCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCg  <  1:1692394/61‑1 (MQ=255) gATGGTAAAAGCCGTGCCCCATTTATTATAACCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCg  <  1:1887180/61‑1 (MQ=255) gATGGTAAAAGCCGTGCCCCATTTATTATAACCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCg  <  1:1900422/61‑1 (MQ=255) gATGGTAAAAGCCGTGCCCCATTTATTATAACCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCg  <  1:1933806/61‑1 (MQ=255) gATGGTAAAAGCCGTGCCCCATTTATTATAACCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCg  <  1:1041823/61‑1 (MQ=255) gATGGTAAAAGCCGTGCCCCATTTATTATAACCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCg  <  1:1966001/61‑1 (MQ=255) gATGGTAAAAGCCGTGCCCCATTTATTATAACCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCg  <  1:2066425/61‑1 (MQ=255) gATGGTAAAAGCCGTGCCCCATTTATTATAACCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCg  <  1:2066938/61‑1 (MQ=255) gATGGTAAAAGCCGTGCCCCATTTATTATAACCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCg  <  1:2095704/61‑1 (MQ=255) gATGGTAAAAGCCGTGCCCCATTTATTATAACCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCg  <  1:212457/61‑1 (MQ=255) gATGGTAAAAGCCGTGCCCCATTTATTATAACCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCg  <  1:2295375/61‑1 (MQ=255) gATGGTAAAAGCCGTGCCCCATTTATTATAACCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCg  <  1:2401075/61‑1 (MQ=255) gATGGTAAAAGCCGTGCCCCATTTATTATAACCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCg  <  1:2510113/61‑1 (MQ=255) gATGGTAAAAGCCGTGCCCCATTTATTATAACCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCg  <  1:2619343/61‑1 (MQ=255) gATGGTAAAAGCCGTGCCCCATTTATTATAACCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCg  <  1:2626513/61‑1 (MQ=255)                     aTTTATTATAACCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCg  <  1:2350966/41‑1 (MQ=255)                                                             | GATGGTAAAAGCCGTGCCCCATTTATTATAACCCCACCGCTATTTCGTCTTGAGGCTGGCG  >  minE/2113369‑2113429

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑