Missing coverage evidence...
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TTCTGCTGCCGTGGGAATGACAAACAAGCATCCTGCTACCGCCATCGCCACCACCCACATCA  >  minE/2122383‑2122444                                                              | ttCTGCTGCCGTGGTAATGACAAACAATCATCCTGCTACCGCCATCGCCACCACCCACATCa  <  1:2658642/62‑1 (MQ=255) ttCTGCTGCCGTGGGAATGACAAACTAGCATCCTGCTACCGCCATCGCCACCACCCACATCa  <  1:1185218/62‑1 (MQ=255) ttCTGCTGCCGTGGGAATGACAAACAAGCATCCTGCTACCGCCATCGCCACCACCCACATCa  <  1:313371/62‑1 (MQ=255) ttCTGCTGCCGTGGGAATGACAAACAAGCATCCTGCTACCGCCATCGCCACCACCCACATCa  <  1:9185/62‑1 (MQ=255) ttCTGCTGCCGTGGGAATGACAAACAAGCATCCTGCTACCGCCATCGCCACCACCCACATCa  <  1:809697/62‑1 (MQ=255) ttCTGCTGCCGTGGGAATGACAAACAAGCATCCTGCTACCGCCATCGCCACCACCCACATCa  <  1:776941/62‑1 (MQ=255) ttCTGCTGCCGTGGGAATGACAAACAAGCATCCTGCTACCGCCATCGCCACCACCCACATCa  <  1:674787/62‑1 (MQ=255) ttCTGCTGCCGTGGGAATGACAAACAAGCATCCTGCTACCGCCATCGCCACCACCCACATCa  <  1:621541/62‑1 (MQ=255) ttCTGCTGCCGTGGGAATGACAAACAAGCATCCTGCTACCGCCATCGCCACCACCCACATCa  <  1:559140/62‑1 (MQ=255) ttCTGCTGCCGTGGGAATGACAAACAAGCATCCTGCTACCGCCATCGCCACCACCCACATCa  <  1:3561406/62‑1 (MQ=255) ttCTGCTGCCGTGGGAATGACAAACAAGCATCCTGCTACCGCCATCGCCACCACCCACATCa  <  1:3331264/62‑1 (MQ=255) ttCTGCTGCCGTGGGAATGACAAACAAGCATCCTGCTACCGCCATCGCCACCACCCACATCa  <  1:3246958/62‑1 (MQ=255) ttCTGCTGCCGTGGGAATGACAAACAAGCATCCTGCTACCGCCATCGCCACCACCCACATCa  <  1:3235762/62‑1 (MQ=255) ttCTGCTGCCGTGGGAATGACAAACAAGCATCCTGCTACCGCCATCGCCACCACCCACATCa  <  1:3222306/62‑1 (MQ=255) ttCTGCTGCCGTGGGAATGACAAACAAGCATCCTGCTACCGCCATCGCCACCACCCACATCa  <  1:3177087/62‑1 (MQ=255) ttCTGCTGCCGTGGGAATGACAAACAAGCATCCTGCTACCGCCATCGCCACCACCCACATCa  <  1:1026168/62‑1 (MQ=255) ttCTGCTGCCGTGGGAATGACAAACAAGCATCCTGCTACCGCCATCGCCACCACCCACATCa  <  1:2519033/62‑1 (MQ=255) ttCTGCTGCCGTGGGAATGACAAACAAGCATCCTGCTACCGCCATCGCCACCACCCACATCa  <  1:1811909/62‑1 (MQ=255) ttCTGCTGCCGTGGGAATGACAAACAAGCATCCTGCTACCGCCATCGCCACCACCCACATCa  <  1:1691131/62‑1 (MQ=255) ttCTGCTGCCGTGGGAATGACAAACAAGCATCCTGCTACCGCCATCGCCACCACCCACATCa  <  1:1510524/62‑1 (MQ=255) ttCTGCTGCCGTGGGAATGACAAACAAGCATCCTGCTACCGCCATCGCCACCACCCACATCa  <  1:120866/62‑1 (MQ=255) ttCTGCTGCCGTGGGAATGACAAACAAGCATCCTGCTACCGCCATCGCCACCACCCACATCa  <  1:1086241/62‑1 (MQ=255)  tCTGCTGCCGTGGGAATGACAAACAAGCATCCTGCTACCGCCATCGCCACCACCCACATCa  <  1:3113251/61‑1 (MQ=255)  tCTGCTGCCGTGGGAATGACAAACAAGCATCCTGCTACCGCCATCGCCACCACCCACATCa  <  1:3647350/61‑1 (MQ=255)   ctgctgCCGTGGGAATGACAAACAAGCATCCTGCTACCGCCATCGCCACCACCCACATCa  <  1:285606/60‑1 (MQ=255)   ctgctgCCGTGGGAATGACAAACAAGCATCCTGCTACCGCCATCGCCACCACCCACATCa  <  1:2489119/60‑1 (MQ=255)   ctgctgCCGTGGGAATGACAAACAAGCATCCTGCTACCGCCATCGCCACCACCCACATCa  <  1:1311576/60‑1 (MQ=255)      ctgcCGGGGGAATGACAAACAAGCATCCTGCTACCGCCATCGCCACCACCCACATCa  <  1:238805/57‑1 (MQ=255)                                                              | TTCTGCTGCCGTGGGAATGACAAACAAGCATCCTGCTACCGCCATCGCCACCACCCACATCA  >  minE/2122383‑2122444

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑