Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2138856	2138922	67	99 [0]	[0] 14	infB	fused protein chain initiation factor 2, IF2

AGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCA  >  minE/2138820‑2138855                                    | aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGGGGCa  >  1:1657217/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGATGCa  >  1:3240578/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGTCa  >  1:1672180/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:3074884/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:3253266/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:3229991/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:3212991/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:321107/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:3197962/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:3152530/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:3114412/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:3111898/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:3097359/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:3349686/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:303824/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:3009191/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:2995362/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:2950804/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:2945165/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:2932287/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:2900515/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:2882174/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:282992/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:2819295/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:2816186/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:277867/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:787469/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:961158/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:960808/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:960231/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:943762/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:936348/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:924953/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:891988/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:850181/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:841429/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:840616/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:824149/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:333677/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:733456/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:675564/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:662490/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:632065/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:620091/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:573173/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:503217/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:475509/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:3513530/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:3401704/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:2708924/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:157839/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:2067886/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:2032763/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:2007534/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:1957729/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:1912437/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:1906614/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:1886777/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:1834395/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:1832302/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:1790822/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:1649593/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:2071642/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:1513510/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:1511548/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:1464619/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:1460727/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:1304925/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:1277793/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:1277316/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:1226318/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:1219858/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:1171341/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:1128195/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:2419523/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:1111001/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:2668781/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:2639004/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:2633612/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:2614925/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:2545730/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:2530951/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:2527309/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:2519817/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:2518665/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:2492314/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:24759/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:2723215/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:2406149/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:2366193/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:2231853/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:2208631/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:2206117/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:2204714/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:219086/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:2190272/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:2155637/1‑36 (MQ=255) aGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:2103388/1‑36 (MQ=255) aGGCTTCCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCa  >  1:673837/1‑36 (MQ=255)                                    | AGGCTTTCCGCTTCAATCACTTTACGTGCAGAGGCA  >  minE/2138820‑2138855

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑