Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2203466	2203609	144	38 [0]	[0] 107	[aaeB]–[aaeA]	[aaeB],[aaeA]

TACAATGGCGGTCGCCAGTTTTACCGCAAAGCGAATATGTTGGTTAGCAATGGAGAAAATA  >  minE/2203405‑2203465                                                             | tACAATGGCGGTCGCCAGTTTTACCGCAAAGCGAATATGTTGGTTAGCAATGGAGAAAATa  >  1:3548756/1‑61 (MQ=255) tACAATGGCGGTCGCCAGTTTTACCGCAAAGCGAATATGTTGGTTAGCAATGGAGAAAATa  >  1:2855081/1‑61 (MQ=255) tACAATGGCGGTCGCCAGTTTTACCGCAAAGCGAATATGTTGGTTAGCAATGGAGAAAATa  >  1:2860242/1‑61 (MQ=255) tACAATGGCGGTCGCCAGTTTTACCGCAAAGCGAATATGTTGGTTAGCAATGGAGAAAATa  >  1:295324/1‑61 (MQ=255) tACAATGGCGGTCGCCAGTTTTACCGCAAAGCGAATATGTTGGTTAGCAATGGAGAAAATa  >  1:3015666/1‑61 (MQ=255) tACAATGGCGGTCGCCAGTTTTACCGCAAAGCGAATATGTTGGTTAGCAATGGAGAAAATa  >  1:303465/1‑61 (MQ=255) tACAATGGCGGTCGCCAGTTTTACCGCAAAGCGAATATGTTGGTTAGCAATGGAGAAAATa  >  1:3149232/1‑61 (MQ=255) tACAATGGCGGTCGCCAGTTTTACCGCAAAGCGAATATGTTGGTTAGCAATGGAGAAAATa  >  1:3159599/1‑61 (MQ=255) tACAATGGCGGTCGCCAGTTTTACCGCAAAGCGAATATGTTGGTTAGCAATGGAGAAAATa  >  1:3374700/1‑61 (MQ=255) tACAATGGCGGTCGCCAGTTTTACCGCAAAGCGAATATGTTGGTTAGCAATGGAGAAAATa  >  1:3389608/1‑61 (MQ=255) tACAATGGCGGTCGCCAGTTTTACCGCAAAGCGAATATGTTGGTTAGCAATGGAGAAAATa  >  1:2615622/1‑61 (MQ=255) tACAATGGCGGTCGCCAGTTTTACCGCAAAGCGAATATGTTGGTTAGCAATGGAGAAAATa  >  1:3642372/1‑61 (MQ=255) tACAATGGCGGTCGCCAGTTTTACCGCAAAGCGAATATGTTGGTTAGCAATGGAGAAAATa  >  1:407967/1‑61 (MQ=255) tACAATGGCGGTCGCCAGTTTTACCGCAAAGCGAATATGTTGGTTAGCAATGGAGAAAATa  >  1:458235/1‑61 (MQ=255) tACAATGGCGGTCGCCAGTTTTACCGCAAAGCGAATATGTTGGTTAGCAATGGAGAAAATa  >  1:613144/1‑61 (MQ=255) tACAATGGCGGTCGCCAGTTTTACCGCAAAGCGAATATGTTGGTTAGCAATGGAGAAAATa  >  1:650129/1‑61 (MQ=255) tACAATGGCGGTCGCCAGTTTTACCGCAAAGCGAATATGTTGGTTAGCAATGGAGAAAATa  >  1:663709/1‑61 (MQ=255) tACAATGGCGGTCGCCAGTTTTACCGCAAAGCGAATATGTTGGTTAGCAATGGAGAAAATa  >  1:978042/1‑61 (MQ=255) tACAATGGCGGTCGCCAGTTTTACCGCAAAGCGAATATGTTGGTTAGCAATGGAGAAAATa  >  1:989376/1‑61 (MQ=255) tACAATGGCGGTCGCCAGTTTTACCGCAAAGCGAATATGTTGGTTAGCAATGGAGAAAATa  >  1:1660866/1‑61 (MQ=255) tACAATGGCGGTCGCCAGTTTTACCGCAAAGCGAATATGTTGGTTAGCAATGGAGAAAATa  >  1:1144585/1‑61 (MQ=255) tACAATGGCGGTCGCCAGTTTTACCGCAAAGCGAATATGTTGGTTAGCAATGGAGAAAATa  >  1:1217111/1‑61 (MQ=255) tACAATGGCGGTCGCCAGTTTTACCGCAAAGCGAATATGTTGGTTAGCAATGGAGAAAATa  >  1:1236568/1‑61 (MQ=255) tACAATGGCGGTCGCCAGTTTTACCGCAAAGCGAATATGTTGGTTAGCAATGGAGAAAATa  >  1:12481/1‑61 (MQ=255) tACAATGGCGGTCGCCAGTTTTACCGCAAAGCGAATATGTTGGTTAGCAATGGAGAAAATa  >  1:1379191/1‑61 (MQ=255) tACAATGGCGGTCGCCAGTTTTACCGCAAAGCGAATATGTTGGTTAGCAATGGAGAAAATa  >  1:1544713/1‑61 (MQ=255) tACAATGGCGGTCGCCAGTTTTACCGCAAAGCGAATATGTTGGTTAGCAATGGAGAAAATa  >  1:1611980/1‑61 (MQ=255) tACAATGGCGGTCGCCAGTTTTACCGCAAAGCGAATATGTTGGTTAGCAATGGAGAAAATa  >  1:1624761/1‑61 (MQ=255) tACAATGGCGGTCGCCAGTTTTACCGCAAAGCGAATATGTTGGTTAGCAATGGAGAAAATa  >  1:1639197/1‑61 (MQ=255) tACAATGGCGGTCGCCAGTTTTACCGCAAAGCGAATATGTTGGTTAGCAATGGAGAAAATa  >  1:1128872/1‑61 (MQ=255) tACAATGGCGGTCGCCAGTTTTACCGCAAAGCGAATATGTTGGTTAGCAATGGAGAAAATa  >  1:1835100/1‑61 (MQ=255) tACAATGGCGGTCGCCAGTTTTACCGCAAAGCGAATATGTTGGTTAGCAATGGAGAAAATa  >  1:1987946/1‑61 (MQ=255) tACAATGGCGGTCGCCAGTTTTACCGCAAAGCGAATATGTTGGTTAGCAATGGAGAAAATa  >  1:2012013/1‑61 (MQ=255) tACAATGGCGGTCGCCAGTTTTACCGCAAAGCGAATATGTTGGTTAGCAATGGAGAAAATa  >  1:2014280/1‑61 (MQ=255) tACAATGGCGGTCGCCAGTTTTACCGCAAAGCGAATATGTTGGTTAGCAATGGAGAAAATa  >  1:207162/1‑61 (MQ=255) tACAATGGCGGTCGCCAGTTTTACCGCAAAGCGAATATGTTGGTTAGCAATGGAGAAAATa  >  1:2294362/1‑61 (MQ=255) tACAATGGCGGTCGCCAGTTTTACCGCAAAGCGAATATGTTGGTTAGCAATGGAGAAAATa  >  1:2336846/1‑61 (MQ=255) tACAATGGCGGTCGCCAGTTTTACCGCAAAGCGAATATGTTGGTTAGCAATGGAGAAAATa  >  1:2502560/1‑61 (MQ=255)                                                             | TACAATGGCGGTCGCCAGTTTTACCGCAAAGCGAATATGTTGGTTAGCAATGGAGAAAATA  >  minE/2203405‑2203465

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑