Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2205680	2205682	3	26 [0]	[0] 61	aaeR	predicted DNA‑binding transcriptional regulator, efflux system

GAAAAAGATAAGCTGCCGCTGAAGGTACAGGTCGTGATCAACTCGCTGACGGATTATTTTGT  >  minE/2205618‑2205679                                                              | gAAAAAGATAAGCTGCCGCTGAAGGTACAGGTCGTGATCAACTCGCTGACGGATTATTttgt  <  1:143953/62‑1 (MQ=255) gAAAAAGATAAGCTGCCGCTGAAGGTACAGGTCGTGATCAACTCGCTGACGGATTATTttgt  <  1:86170/62‑1 (MQ=255) gAAAAAGATAAGCTGCCGCTGAAGGTACAGGTCGTGATCAACTCGCTGACGGATTATTttgt  <  1:700497/62‑1 (MQ=255) gAAAAAGATAAGCTGCCGCTGAAGGTACAGGTCGTGATCAACTCGCTGACGGATTATTttgt  <  1:390948/62‑1 (MQ=255) gAAAAAGATAAGCTGCCGCTGAAGGTACAGGTCGTGATCAACTCGCTGACGGATTATTttgt  <  1:3600591/62‑1 (MQ=255) gAAAAAGATAAGCTGCCGCTGAAGGTACAGGTCGTGATCAACTCGCTGACGGATTATTttgt  <  1:3600474/62‑1 (MQ=255) gAAAAAGATAAGCTGCCGCTGAAGGTACAGGTCGTGATCAACTCGCTGACGGATTATTttgt  <  1:3490019/62‑1 (MQ=255) gAAAAAGATAAGCTGCCGCTGAAGGTACAGGTCGTGATCAACTCGCTGACGGATTATTttgt  <  1:3328216/62‑1 (MQ=255) gAAAAAGATAAGCTGCCGCTGAAGGTACAGGTCGTGATCAACTCGCTGACGGATTATTttgt  <  1:3244149/62‑1 (MQ=255) gAAAAAGATAAGCTGCCGCTGAAGGTACAGGTCGTGATCAACTCGCTGACGGATTATTttgt  <  1:3053866/62‑1 (MQ=255) gAAAAAGATAAGCTGCCGCTGAAGGTACAGGTCGTGATCAACTCGCTGACGGATTATTttgt  <  1:2787055/62‑1 (MQ=255) gAAAAAGATAAGCTGCCGCTGAAGGTACAGGTCGTGATCAACTCGCTGACGGATTATTttgt  <  1:2779934/62‑1 (MQ=255) gAAAAAGATAAGCTGCCGCTGAAGGTACAGGTCGTGATCAACTCGCTGACGGATTATTttgt  <  1:2774147/62‑1 (MQ=255) gAAAAAGATAAGCTGCCGCTGAAGGTACAGGTCGTGATCAACTCGCTGACGGATTATTttgt  <  1:2748211/62‑1 (MQ=255) gAAAAAGATAAGCTGCCGCTGAAGGTACAGGTCGTGATCAACTCGCTGACGGATTATTttgt  <  1:2691314/62‑1 (MQ=255) gAAAAAGATAAGCTGCCGCTGAAGGTACAGGTCGTGATCAACTCGCTGACGGATTATTttgt  <  1:2651368/62‑1 (MQ=255) gAAAAAGATAAGCTGCCGCTGAAGGTACAGGTCGTGATCAACTCGCTGACGGATTATTttgt  <  1:2405197/62‑1 (MQ=255) gAAAAAGATAAGCTGCCGCTGAAGGTACAGGTCGTGATCAACTCGCTGACGGATTATTttgt  <  1:2091221/62‑1 (MQ=255) gAAAAAGATAAGCTGCCGCTGAAGGTACAGGTCGTGATCAACTCGCTGACGGATTATTttgt  <  1:2016657/62‑1 (MQ=255) gAAAAAGATAAGCTGCCGCTGAAGGTACAGGTCGTGATCAACTCGCTGACGGATTATTttgt  <  1:1759659/62‑1 (MQ=255) gAAAAAGATAAGCTGCCGCTGAAGGTACAGGTCGTGATCAACTCGCTGACGGATTATTttgt  <  1:1616249/62‑1 (MQ=255) gAAAAAGATAAGCTGCCGCTGAAGGTACAGGTCGTGATCAACTCGCTGACGGATTATTttgt  <  1:121144/62‑1 (MQ=255)       gATAAGCTGCCGCTGAAGGTACAGGTCGTGATCAACTCGCTGACGGATTATTttgt  <  1:1618273/56‑1 (MQ=255)            gCTGCCGCTGAAGGTACAGGTCGTGATCAACTCGCTGACGGATTATTttgt  <  1:891222/51‑1 (MQ=255)               gCCGCTGAAGGTACAGGTCGTGATCAACTCGCTGACGGATTATTttgt  <  1:745842/48‑1 (MQ=255)                   cTGAAGGTACAGGTCGTGATCAACTCGCTGACGGATTATTttgt  <  1:2048676/44‑1 (MQ=255)                                                              | GAAAAAGATAAGCTGCCGCTGAAGGTACAGGTCGTGATCAACTCGCTGACGGATTATTTTGT  >  minE/2205618‑2205679

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑