Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2213433	2213460	28	32 [0]	[0] 49	yhdE	conserved hypothetical protein

GATAATTTGCGCAACATCTGCGCCGCATGCTCTGCGTCGCGCGGTTTCTCCAGCACTTCTCC  >  minE/2213371‑2213432                                                              | gATAATTTGCGCAACATCTGCGCCGCATGCTCTGCGTCGCGCGGTTTCTCCAGCACTTCTcc  >  1:2858823/1‑62 (MQ=255) gATAATTTGCGCAACATCTGCGCCGCATGCTCTGCGTCGCGCGGTTTCTCCAGCACTTCTcc  >  1:837442/1‑62 (MQ=255) gATAATTTGCGCAACATCTGCGCCGCATGCTCTGCGTCGCGCGGTTTCTCCAGCACTTCTcc  >  1:639818/1‑62 (MQ=255) gATAATTTGCGCAACATCTGCGCCGCATGCTCTGCGTCGCGCGGTTTCTCCAGCACTTCTcc  >  1:59296/1‑62 (MQ=255) gATAATTTGCGCAACATCTGCGCCGCATGCTCTGCGTCGCGCGGTTTCTCCAGCACTTCTcc  >  1:573900/1‑62 (MQ=255) gATAATTTGCGCAACATCTGCGCCGCATGCTCTGCGTCGCGCGGTTTCTCCAGCACTTCTcc  >  1:483159/1‑62 (MQ=255) gATAATTTGCGCAACATCTGCGCCGCATGCTCTGCGTCGCGCGGTTTCTCCAGCACTTCTcc  >  1:44931/1‑62 (MQ=255) gATAATTTGCGCAACATCTGCGCCGCATGCTCTGCGTCGCGCGGTTTCTCCAGCACTTCTcc  >  1:404699/1‑62 (MQ=255) gATAATTTGCGCAACATCTGCGCCGCATGCTCTGCGTCGCGCGGTTTCTCCAGCACTTCTcc  >  1:363546/1‑62 (MQ=255) gATAATTTGCGCAACATCTGCGCCGCATGCTCTGCGTCGCGCGGTTTCTCCAGCACTTCTcc  >  1:3506529/1‑62 (MQ=255) gATAATTTGCGCAACATCTGCGCCGCATGCTCTGCGTCGCGCGGTTTCTCCAGCACTTCTcc  >  1:3468242/1‑62 (MQ=255) gATAATTTGCGCAACATCTGCGCCGCATGCTCTGCGTCGCGCGGTTTCTCCAGCACTTCTcc  >  1:3346044/1‑62 (MQ=255) gATAATTTGCGCAACATCTGCGCCGCATGCTCTGCGTCGCGCGGTTTCTCCAGCACTTCTcc  >  1:3257313/1‑62 (MQ=255) gATAATTTGCGCAACATCTGCGCCGCATGCTCTGCGTCGCGCGGTTTCTCCAGCACTTCTcc  >  1:3166112/1‑62 (MQ=255) gATAATTTGCGCAACATCTGCGCCGCATGCTCTGCGTCGCGCGGTTTCTCCAGCACTTCTcc  >  1:3161823/1‑62 (MQ=255) gATAATTTGCGCAACATCTGCGCCGCATGCTCTGCGTCGCGCGGTTTCTCCAGCACTTCTcc  >  1:108593/1‑62 (MQ=255) gATAATTTGCGCAACATCTGCGCCGCATGCTCTGCGTCGCGCGGTTTCTCCAGCACTTCTcc  >  1:2660177/1‑62 (MQ=255) gATAATTTGCGCAACATCTGCGCCGCATGCTCTGCGTCGCGCGGTTTCTCCAGCACTTCTcc  >  1:2404329/1‑62 (MQ=255) gATAATTTGCGCAACATCTGCGCCGCATGCTCTGCGTCGCGCGGTTTCTCCAGCACTTCTcc  >  1:2184481/1‑62 (MQ=255) gATAATTTGCGCAACATCTGCGCCGCATGCTCTGCGTCGCGCGGTTTCTCCAGCACTTCTcc  >  1:1974266/1‑62 (MQ=255) gATAATTTGCGCAACATCTGCGCCGCATGCTCTGCGTCGCGCGGTTTCTCCAGCACTTCTcc  >  1:1883222/1‑62 (MQ=255) gATAATTTGCGCAACATCTGCGCCGCATGCTCTGCGTCGCGCGGTTTCTCCAGCACTTCTcc  >  1:1791937/1‑62 (MQ=255) gATAATTTGCGCAACATCTGCGCCGCATGCTCTGCGTCGCGCGGTTTCTCCAGCACTTCTcc  >  1:1677350/1‑62 (MQ=255) gATAATTTGCGCAACATCTGCGCCGCATGCTCTGCGTCGCGCGGTTTCTCCAGCACTTCTcc  >  1:1651939/1‑62 (MQ=255) gATAATTTGCGCAACATCTGCGCCGCATGCTCTGCGTCGCGCGGTTTCTCCAGCACTTCTcc  >  1:1594813/1‑62 (MQ=255) gATAATTTGCGCAACATCTGCGCCGCATGCTCTGCGTCGCGCGGTTTCTCCAGCACTTCTcc  >  1:1590429/1‑62 (MQ=255) gATAATTTGCGCAACATCTGCGCCGCATGCTCTGCGTCGCGCGGTTTCTCCAGCACTTCTcc  >  1:1573133/1‑62 (MQ=255) gATAATTTGCGCAACATCTGCGCCGCATGCTCTGCGTCGCGCGGTTTCTCCAGCACTTCTcc  >  1:1464744/1‑62 (MQ=255) gATAATTTGCGCAACATCTGCGCCGCATGCTCTGCGTCGCGCGGTTTCTCCAGCACTTCTcc  >  1:1355076/1‑62 (MQ=255) gATAATTTGCGCAACATCTGCGCCGCATGCTCTGCGTCGCGCGGTTTCTCCAGCACTTCTcc  >  1:1300298/1‑62 (MQ=255) gATAATTTGCGCAACATCTGCGCCGCATGCTCTGCGTCGCGCGGTTTCTCCAGCACTTCTcc  >  1:1250648/1‑62 (MQ=255) gATAATTTGCGCAACATATGCGCCGCATGCTCTGCGTCGCGCGGTTTCTCCAGCACTTCTcc  >  1:402833/1‑62 (MQ=255)                                                              | GATAATTTGCGCAACATCTGCGCCGCATGCTCTGCGTCGCGCGGTTTCTCCAGCACTTCTCC  >  minE/2213371‑2213432

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑