Missing coverage evidence...
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ACGGATTTGACTGAACGTCCCCAGGCGGCTGTCGGCAATAATAATGCCGAGCGCCACCAGCA  >  minE/2215144‑2215205                                                              | aCGGATTTGACTGAACGTCCCCAGGCGGCTGTCGGCAATAATAATGCCGAGCGCCACCAGCa  <  1:3066233/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTGACTGAACGTCCCCAGGCGGCTGTCGGCAATAATAATGCCGAGCGCCACCAGCa  <  1:1096743/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTGACTGAACGTCCCCAGGCGGCTGTCGGCAATAATAATGCCGAGCGCCACCAGCa  <  1:238311/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTGACTGAACGTCCCCAGGCGGCTGTCGGCAATAATAATGCCGAGCGCCACCAGCa  <  1:2441924/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTGACTGAACGTCCCCAGGCGGCTGTCGGCAATAATAATGCCGAGCGCCACCAGCa  <  1:2588346/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTGACTGAACGTCCCCAGGCGGCTGTCGGCAATAATAATGCCGAGCGCCACCAGCa  <  1:2629223/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTGACTGAACGTCCCCAGGCGGCTGTCGGCAATAATAATGCCGAGCGCCACCAGCa  <  1:277322/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTGACTGAACGTCCCCAGGCGGCTGTCGGCAATAATAATGCCGAGCGCCACCAGCa  <  1:2818308/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTGACTGAACGTCCCCAGGCGGCTGTCGGCAATAATAATGCCGAGCGCCACCAGCa  <  1:3018655/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTGACTGAACGTCCCCAGGCGGCTGTCGGCAATAATAATGCCGAGCGCCACCAGCa  <  1:3048670/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTGACTGAACGTCCCCAGGCGGCTGTCGGCAATAATAATGCCGAGCGCCACCAGCa  <  1:3063154/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTGACTGAACGTCCCCAGGCGGCTGTCGGCAATAATAATGCCGAGCGCCACCAGCa  <  1:2366101/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTGACTGAACGTCCCCAGGCGGCTGTCGGCAATAATAATGCCGAGCGCCACCAGCa  <  1:3211036/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTGACTGAACGTCCCCAGGCGGCTGTCGGCAATAATAATGCCGAGCGCCACCAGCa  <  1:3344098/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTGACTGAACGTCCCCAGGCGGCTGTCGGCAATAATAATGCCGAGCGCCACCAGCa  <  1:3446216/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTGACTGAACGTCCCCAGGCGGCTGTCGGCAATAATAATGCCGAGCGCCACCAGCa  <  1:3514047/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTGACTGAACGTCCCCAGGCGGCTGTCGGCAATAATAATGCCGAGCGCCACCAGCa  <  1:3527328/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTGACTGAACGTCCCCAGGCGGCTGTCGGCAATAATAATGCCGAGCGCCACCAGCa  <  1:366540/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTGACTGAACGTCCCCAGGCGGCTGTCGGCAATAATAATGCCGAGCGCCACCAGCa  <  1:437131/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTGACTGAACGTCCCCAGGCGGCTGTCGGCAATAATAATGCCGAGCGCCACCAGCa  <  1:454696/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTGACTGAACGTCCCCAGGCGGCTGTCGGCAATAATAATGCCGAGCGCCACCAGCa  <  1:902417/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTGACTGAACGTCCCCAGGCGGCTGTCGGCAATAATAATGCCGAGCGCCACCAGCa  <  1:987741/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTGACTGAACGTCCCCAGGCGGCTGTCGGCAATAATAATGCCGAGCGCCACCAGCa  <  1:1696553/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTGACTGAACGTCCCCAGGCGGCTGTCGGCAATAATAATGCCGAGCGCCACCAGCa  <  1:1161944/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTGACTGAACGTCCCCAGGCGGCTGTCGGCAATAATAATGCCGAGCGCCACCAGCa  <  1:1166215/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTGACTGAACGTCCCCAGGCGGCTGTCGGCAATAATAATGCCGAGCGCCACCAGCa  <  1:1227912/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTGACTGAACGTCCCCAGGCGGCTGTCGGCAATAATAATGCCGAGCGCCACCAGCa  <  1:1251265/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTGACTGAACGTCCCCAGGCGGCTGTCGGCAATAATAATGCCGAGCGCCACCAGCa  <  1:1281459/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTGACTGAACGTCCCCAGGCGGCTGTCGGCAATAATAATGCCGAGCGCCACCAGCa  <  1:1337432/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTGACTGAACGTCCCCAGGCGGCTGTCGGCAATAATAATGCCGAGCGCCACCAGCa  <  1:1341029/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTGACTGAACGTCCCCAGGCGGCTGTCGGCAATAATAATGCCGAGCGCCACCAGCa  <  1:1359853/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTGACTGAACGTCCCCAGGCGGCTGTCGGCAATAATAATGCCGAGCGCCACCAGCa  <  1:143719/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTGACTGAACGTCCCCAGGCGGCTGTCGGCAATAATAATGCCGAGCGCCACCAGCa  <  1:1516506/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTGACTGAACGTCCCCAGGCGGCTGTCGGCAATAATAATGCCGAGCGCCACCAGCa  <  1:1699856/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTGACTGAACGTCCCCAGGCGGCTGTCGGCAATAATAATGCCGAGCGCCACCAGCa  <  1:1763028/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTGACTGAACGTCCCCAGGCGGCTGTCGGCAATAATAATGCCGAGCGCCACCAGCa  <  1:1849399/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTGACTGAACGTCCCCAGGCGGCTGTCGGCAATAATAATGCCGAGCGCCACCAGCa  <  1:1912862/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTGACTGAACGTCCCCAGGCGGCTGTCGGCAATAATAATGCCGAGCGCCACCAGCa  <  1:2065081/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTGACTGAACGTCCCCAGGCGGCTGTCGGCAATAATAATGCCGAGCGCCACCAGCa  <  1:2084081/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTGACTGAACGTCCCCAGGCGGCTGTCGGCAATAATAATGCCGAGCGCCACCAGCa  <  1:2086274/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTGACTGAACGTCCCCAGGCGGCTGTCGGCAATAATAATGCCGAGCGCCACCAGCa  <  1:2149813/62‑1 (MQ=255) aCGGATTTGACTGAACGTCCCCAGGCGGCTGTCGGCAATAATAATGCCGAGCGCCACCAGCa  <  1:2218513/62‑1 (MQ=255)                       aGGCGGCTGTCGGCAATAATAATGCCGAGCGCCACCAGCa  <  1:3024555/40‑1 (MQ=255)                         gcggcTGTCGGCAATAATAATGCCGAGCGCCACCAGCa  <  1:2293066/38‑1 (MQ=255)                                                              | ACGGATTTGACTGAACGTCCCCAGGCGGCTGTCGGCAATAATAATGCCGAGCGCCACCAGCA  >  minE/2215144‑2215205

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑