Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2225308	2225346	39	35 [0]	[0] 12	prmA/dusB	methylase for 50S ribosomal subunit protein L11/tRNA‑dihydrouridine synthase B

GGGGCGAAGTGCGAGCAAGCTCACAAAAGGCACGTAAATTTGCCGATTA  >  minE/2225259‑2225307                                                 | ggggCGAAGTGCGAGCAAGCTCACAAAAGGCACGTAAATTTGCCGatta  >  1:373357/1‑49 (MQ=255) ggggCGAAGTGCGAGCAAGCTCACAAAAGGCACGTAAATTTGCCGatta  >  1:2545044/1‑49 (MQ=255) ggggCGAAGTGCGAGCAAGCTCACAAAAGGCACGTAAATTTGCCGatta  >  1:2886346/1‑49 (MQ=255) ggggCGAAGTGCGAGCAAGCTCACAAAAGGCACGTAAATTTGCCGatta  >  1:2887207/1‑49 (MQ=255) ggggCGAAGTGCGAGCAAGCTCACAAAAGGCACGTAAATTTGCCGatta  >  1:3043658/1‑49 (MQ=255) ggggCGAAGTGCGAGCAAGCTCACAAAAGGCACGTAAATTTGCCGatta  >  1:30873/1‑49 (MQ=255) ggggCGAAGTGCGAGCAAGCTCACAAAAGGCACGTAAATTTGCCGatta  >  1:3322640/1‑49 (MQ=255) ggggCGAAGTGCGAGCAAGCTCACAAAAGGCACGTAAATTTGCCGatta  >  1:3490919/1‑49 (MQ=255) ggggCGAAGTGCGAGCAAGCTCACAAAAGGCACGTAAATTTGCCGatta  >  1:357129/1‑49 (MQ=255) ggggCGAAGTGCGAGCAAGCTCACAAAAGGCACGTAAATTTGCCGatta  >  1:2440969/1‑49 (MQ=255) ggggCGAAGTGCGAGCAAGCTCACAAAAGGCACGTAAATTTGCCGatta  >  1:412455/1‑49 (MQ=255) ggggCGAAGTGCGAGCAAGCTCACAAAAGGCACGTAAATTTGCCGatta  >  1:455276/1‑49 (MQ=255) ggggCGAAGTGCGAGCAAGCTCACAAAAGGCACGTAAATTTGCCGatta  >  1:576118/1‑49 (MQ=255) ggggCGAAGTGCGAGCAAGCTCACAAAAGGCACGTAAATTTGCCGatta  >  1:584078/1‑49 (MQ=255) ggggCGAAGTGCGAGCAAGCTCACAAAAGGCACGTAAATTTGCCGatta  >  1:590526/1‑49 (MQ=255) ggggCGAAGTGCGAGCAAGCTCACAAAAGGCACGTAAATTTGCCGatta  >  1:601485/1‑49 (MQ=255) ggggCGAAGTGCGAGCAAGCTCACAAAAGGCACGTAAATTTGCCGatta  >  1:609787/1‑49 (MQ=255) ggggCGAAGTGCGAGCAAGCTCACAAAAGGCACGTAAATTTGCCGatta  >  1:77302/1‑49 (MQ=255) ggggCGAAGTGCGAGCAAGCTCACAAAAGGCACGTAAATTTGCCGatta  >  1:2173598/1‑49 (MQ=255) ggggCGAAGTGCGAGCAAGCTCACAAAAGGCACGTAAATTTGCCGatta  >  1:1370500/1‑49 (MQ=255) ggggCGAAGTGCGAGCAAGCTCACAAAAGGCACGTAAATTTGCCGatta  >  1:137903/1‑49 (MQ=255) ggggCGAAGTGCGAGCAAGCTCACAAAAGGCACGTAAATTTGCCGatta  >  1:1444803/1‑49 (MQ=255) ggggCGAAGTGCGAGCAAGCTCACAAAAGGCACGTAAATTTGCCGatta  >  1:1485944/1‑49 (MQ=255) ggggCGAAGTGCGAGCAAGCTCACAAAAGGCACGTAAATTTGCCGatta  >  1:148972/1‑49 (MQ=255) ggggCGAAGTGCGAGCAAGCTCACAAAAGGCACGTAAATTTGCCGatta  >  1:1634009/1‑49 (MQ=255) ggggCGAAGTGCGAGCAAGCTCACAAAAGGCACGTAAATTTGCCGatta  >  1:1690876/1‑49 (MQ=255) ggggCGAAGTGCGAGCAAGCTCACAAAAGGCACGTAAATTTGCCGatta  >  1:2139664/1‑49 (MQ=255) ggggCGAAGTGCGAGCAAGCTCACAAAAGGCACGTAAATTTGCCGatta  >  1:1267447/1‑49 (MQ=255) ggggCGAAGTGCGAGCAAGCTCACAAAAGGCACGTAAATTTGCCGatta  >  1:220089/1‑49 (MQ=255) ggggCGAAGTGCGAGCAAGCTCACAAAAGGCACGTAAATTTGCCGatta  >  1:2238817/1‑49 (MQ=255) ggggCGAAGTGCGAGCAAGCTCACAAAAGGCACGTAAATTTGCCGatta  >  1:2242564/1‑49 (MQ=255) ggggCGAAGTGCGAGCAAGCTCACAAAAGGCACGTAAATTTGCCGatta  >  1:22427/1‑49 (MQ=255) ggggCGAAGTGCGAGCAAGCTCACAAAAGGCACGTAAATTTGCCGatta  >  1:2273296/1‑49 (MQ=255) ggggCGAAGTGCGAGCAAGCTCACAAAAGGCACGTAAATTTGCCGatta  >  1:2339466/1‑49 (MQ=255) ggggCGAAGTGCGAGCAAGCTCACAAAAGGCACGTAAATTTGCCGatta  >  1:2393333/1‑49 (MQ=255)                                                 | GGGGCGAAGTGCGAGCAAGCTCACAAAAGGCACGTAAATTTGCCGATTA  >  minE/2225259‑2225307

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑