Missing coverage evidence...
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GATATTGCCAGGGAAAGTGCCGCTATACGGGAGATGGGCTTTGAACATCTGCTGTTAGTCAC  >  minE/2250843‑2250904                                                              | gATATTGCCAGGGAAAGTGCCGCTATACGGGAGATGGGCTTTGAACATCTGCTGTTAGTCAc  >  1:371047/1‑62 (MQ=255) gATATTGCCAGGGAAAGTGCCGCTATACGGGAGATGGGCTTTGAACATCTGCTGTTAGTCAc  >  1:2730119/1‑62 (MQ=255) gATATTGCCAGGGAAAGTGCCGCTATACGGGAGATGGGCTTTGAACATCTGCTGTTAGTCAc  >  1:2884342/1‑62 (MQ=255) gATATTGCCAGGGAAAGTGCCGCTATACGGGAGATGGGCTTTGAACATCTGCTGTTAGTCAc  >  1:2925648/1‑62 (MQ=255) gATATTGCCAGGGAAAGTGCCGCTATACGGGAGATGGGCTTTGAACATCTGCTGTTAGTCAc  >  1:2992610/1‑62 (MQ=255) gATATTGCCAGGGAAAGTGCCGCTATACGGGAGATGGGCTTTGAACATCTGCTGTTAGTCAc  >  1:3174313/1‑62 (MQ=255) gATATTGCCAGGGAAAGTGCCGCTATACGGGAGATGGGCTTTGAACATCTGCTGTTAGTCAc  >  1:3186274/1‑62 (MQ=255) gATATTGCCAGGGAAAGTGCCGCTATACGGGAGATGGGCTTTGAACATCTGCTGTTAGTCAc  >  1:3576620/1‑62 (MQ=255) gATATTGCCAGGGAAAGTGCCGCTATACGGGAGATGGGCTTTGAACATCTGCTGTTAGTCAc  >  1:366813/1‑62 (MQ=255) gATATTGCCAGGGAAAGTGCCGCTATACGGGAGATGGGCTTTGAACATCTGCTGTTAGTCAc  >  1:229927/1‑62 (MQ=255) gATATTGCCAGGGAAAGTGCCGCTATACGGGAGATGGGCTTTGAACATCTGCTGTTAGTCAc  >  1:419059/1‑62 (MQ=255) gATATTGCCAGGGAAAGTGCCGCTATACGGGAGATGGGCTTTGAACATCTGCTGTTAGTCAc  >  1:447005/1‑62 (MQ=255) gATATTGCCAGGGAAAGTGCCGCTATACGGGAGATGGGCTTTGAACATCTGCTGTTAGTCAc  >  1:547994/1‑62 (MQ=255) gATATTGCCAGGGAAAGTGCCGCTATACGGGAGATGGGCTTTGAACATCTGCTGTTAGTCAc  >  1:577617/1‑62 (MQ=255) gATATTGCCAGGGAAAGTGCCGCTATACGGGAGATGGGCTTTGAACATCTGCTGTTAGTCAc  >  1:647477/1‑62 (MQ=255) gATATTGCCAGGGAAAGTGCCGCTATACGGGAGATGGGCTTTGAACATCTGCTGTTAGTCAc  >  1:760936/1‑62 (MQ=255) gATATTGCCAGGGAAAGTGCCGCTATACGGGAGATGGGCTTTGAACATCTGCTGTTAGTCAc  >  1:803955/1‑62 (MQ=255) gATATTGCCAGGGAAAGTGCCGCTATACGGGAGATGGGCTTTGAACATCTGCTGTTAGTCAc  >  1:860334/1‑62 (MQ=255) gATATTGCCAGGGAAAGTGCCGCTATACGGGAGATGGGCTTTGAACATCTGCTGTTAGTCAc  >  1:1936901/1‑62 (MQ=255) gATATTGCCAGGGAAAGTGCCGCTATACGGGAGATGGGCTTTGAACATCTGCTGTTAGTCAc  >  1:1279248/1‑62 (MQ=255) gATATTGCCAGGGAAAGTGCCGCTATACGGGAGATGGGCTTTGAACATCTGCTGTTAGTCAc  >  1:131239/1‑62 (MQ=255) gATATTGCCAGGGAAAGTGCCGCTATACGGGAGATGGGCTTTGAACATCTGCTGTTAGTCAc  >  1:1344954/1‑62 (MQ=255) gATATTGCCAGGGAAAGTGCCGCTATACGGGAGATGGGCTTTGAACATCTGCTGTTAGTCAc  >  1:1472516/1‑62 (MQ=255) gATATTGCCAGGGAAAGTGCCGCTATACGGGAGATGGGCTTTGAACATCTGCTGTTAGTCAc  >  1:1513966/1‑62 (MQ=255) gATATTGCCAGGGAAAGTGCCGCTATACGGGAGATGGGCTTTGAACATCTGCTGTTAGTCAc  >  1:1557734/1‑62 (MQ=255) gATATTGCCAGGGAAAGTGCCGCTATACGGGAGATGGGCTTTGAACATCTGCTGTTAGTCAc  >  1:1569982/1‑62 (MQ=255) gATATTGCCAGGGAAAGTGCCGCTATACGGGAGATGGGCTTTGAACATCTGCTGTTAGTCAc  >  1:1627308/1‑62 (MQ=255) gATATTGCCAGGGAAAGTGCCGCTATACGGGAGATGGGCTTTGAACATCTGCTGTTAGTCAc  >  1:1114220/1‑62 (MQ=255) gATATTGCCAGGGAAAGTGCCGCTATACGGGAGATGGGCTTTGAACATCTGCTGTTAGTCAc  >  1:1954442/1‑62 (MQ=255) gATATTGCCAGGGAAAGTGCCGCTATACGGGAGATGGGCTTTGAACATCTGCTGTTAGTCAc  >  1:2055578/1‑62 (MQ=255) gATATTGCCAGGGAAAGTGCCGCTATACGGGAGATGGGCTTTGAACATCTGCTGTTAGTCAc  >  1:2119916/1‑62 (MQ=255) gATATTGCCAGGGAAAGTGCCGCTATACGGGAGATGGGCTTTGAACATCTGCTGTTAGTCAc  >  1:2129794/1‑62 (MQ=255) gATATTGCCAGGGAAAGTGCCGCTATACGGGAGATGGGCTTTGAACATCTGCTGTTAGTCAc  >  1:2191261/1‑62 (MQ=255) gATATTGCCAGGGAAAGTGCCGCTATACGGGAGATGGGCTTTGAACATCTGCTGTTAGTCAc  >  1:2193658/1‑62 (MQ=255) gATATTGCCAGGGAAAGTGCCGCTATACGGGAGATGGGCTTTGAACATCTGCTGTTAGTCAc  >  1:2200824/1‑62 (MQ=255) gATATTGCCAGGGAAAGTGCCGCTATACGGGAGATGGGCTTTGAACATCTGCTGTTAGTCAc  >  1:2255089/1‑62 (MQ=255)                                                              | GATATTGCCAGGGAAAGTGCCGCTATACGGGAGATGGGCTTTGAACATCTGCTGTTAGTCAC  >  minE/2250843‑2250904

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑