Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2252963	2252988	26	56 [0]	[0] 33	rpoC	RNA polymerase, beta prime subunit

CGGAGCTTCACCCGCAGCACGGCGACGCATACGATCCTGGTGGTACGCGTAACCGGTACCTG  >  minE/2252901‑2252962                                                              | cGGAGCTTCACCCGCAGCACGGCGACGCATACGATCCTGGTGGTACGCGTGACCGGTACCTg  <  1:71519/62‑1 (MQ=255) cGGAGCTTCACCCGCAGCACGGCGACGCATACGATCCTGGTGGTACGCGTAACCGGTACCTg  <  1:42785/62‑1 (MQ=255) cGGAGCTTCACCCGCAGCACGGCGACGCATACGATCCTGGTGGTACGCGTAACCGGTACCTg  <  1:2814438/62‑1 (MQ=255) cGGAGCTTCACCCGCAGCACGGCGACGCATACGATCCTGGTGGTACGCGTAACCGGTACCTg  <  1:1069430/62‑1 (MQ=255) cGGAGCTTCACCCGCAGCACGGCGACGCATACGATCCTGGTGGTACGCGTAACCGGTACCTg  <  1:2883166/62‑1 (MQ=255) cGGAGCTTCACCCGCAGCACGGCGACGCATACGATCCTGGTGGTACGCGTAACCGGTACCTg  <  1:3143985/62‑1 (MQ=255) cGGAGCTTCACCCGCAGCACGGCGACGCATACGATCCTGGTGGTACGCGTAACCGGTACCTg  <  1:3173662/62‑1 (MQ=255) cGGAGCTTCACCCGCAGCACGGCGACGCATACGATCCTGGTGGTACGCGTAACCGGTACCTg  <  1:3185218/62‑1 (MQ=255) cGGAGCTTCACCCGCAGCACGGCGACGCATACGATCCTGGTGGTACGCGTAACCGGTACCTg  <  1:3271700/62‑1 (MQ=255) cGGAGCTTCACCCGCAGCACGGCGACGCATACGATCCTGGTGGTACGCGTAACCGGTACCTg  <  1:3284267/62‑1 (MQ=255) cGGAGCTTCACCCGCAGCACGGCGACGCATACGATCCTGGTGGTACGCGTAACCGGTACCTg  <  1:3328840/62‑1 (MQ=255) cGGAGCTTCACCCGCAGCACGGCGACGCATACGATCCTGGTGGTACGCGTAACCGGTACCTg  <  1:333408/62‑1 (MQ=255) cGGAGCTTCACCCGCAGCACGGCGACGCATACGATCCTGGTGGTACGCGTAACCGGTACCTg  <  1:3484829/62‑1 (MQ=255) cGGAGCTTCACCCGCAGCACGGCGACGCATACGATCCTGGTGGTACGCGTAACCGGTACCTg  <  1:3530477/62‑1 (MQ=255) cGGAGCTTCACCCGCAGCACGGCGACGCATACGATCCTGGTGGTACGCGTAACCGGTACCTg  <  1:3569191/62‑1 (MQ=255) cGGAGCTTCACCCGCAGCACGGCGACGCATACGATCCTGGTGGTACGCGTAACCGGTACCTg  <  1:2847244/62‑1 (MQ=255) cGGAGCTTCACCCGCAGCACGGCGACGCATACGATCCTGGTGGTACGCGTAACCGGTACCTg  <  1:460729/62‑1 (MQ=255) cGGAGCTTCACCCGCAGCACGGCGACGCATACGATCCTGGTGGTACGCGTAACCGGTACCTg  <  1:471121/62‑1 (MQ=255) cGGAGCTTCACCCGCAGCACGGCGACGCATACGATCCTGGTGGTACGCGTAACCGGTACCTg  <  1:505575/62‑1 (MQ=255) cGGAGCTTCACCCGCAGCACGGCGACGCATACGATCCTGGTGGTACGCGTAACCGGTACCTg  <  1:590297/62‑1 (MQ=255) cGGAGCTTCACCCGCAGCACGGCGACGCATACGATCCTGGTGGTACGCGTAACCGGTACCTg  <  1:597286/62‑1 (MQ=255) cGGAGCTTCACCCGCAGCACGGCGACGCATACGATCCTGGTGGTACGCGTAACCGGTACCTg  <  1:665747/62‑1 (MQ=255) cGGAGCTTCACCCGCAGCACGGCGACGCATACGATCCTGGTGGTACGCGTAACCGGTACCTg  <  1:708436/62‑1 (MQ=255) cGGAGCTTCACCCGCAGCACGGCGACGCATACGATCCTGGTGGTACGCGTAACCGGTACCTg  <  1:726877/62‑1 (MQ=255) cGGAGCTTCACCCGCAGCACGGCGACGCATACGATCCTGGTGGTACGCGTAACCGGTACCTg  <  1:798272/62‑1 (MQ=255) cGGAGCTTCACCCGCAGCACGGCGACGCATACGATCCTGGTGGTACGCGTAACCGGTACCTg  <  1:916223/62‑1 (MQ=255) cGGAGCTTCACCCGCAGCACGGCGACGCATACGATCCTGGTGGTACGCGTAACCGGTACCTg  <  1:935000/62‑1 (MQ=255) cGGAGCTTCACCCGCAGCACGGCGACGCATACGATCCTGGTGGTACGCGTAACCGGTACCTg  <  1:2098362/62‑1 (MQ=255) cGGAGCTTCACCCGCAGCACGGCGACGCATACGATCCTGGTGGTACGCGTAACCGGTACCTg  <  1:1138112/62‑1 (MQ=255) cGGAGCTTCACCCGCAGCACGGCGACGCATACGATCCTGGTGGTACGCGTAACCGGTACCTg  <  1:1281666/62‑1 (MQ=255) cGGAGCTTCACCCGCAGCACGGCGACGCATACGATCCTGGTGGTACGCGTAACCGGTACCTg  <  1:1451357/62‑1 (MQ=255) cGGAGCTTCACCCGCAGCACGGCGACGCATACGATCCTGGTGGTACGCGTAACCGGTACCTg  <  1:1478225/62‑1 (MQ=255) cGGAGCTTCACCCGCAGCACGGCGACGCATACGATCCTGGTGGTACGCGTAACCGGTACCTg  <  1:1524800/62‑1 (MQ=255) cGGAGCTTCACCCGCAGCACGGCGACGCATACGATCCTGGTGGTACGCGTAACCGGTACCTg  <  1:1736575/62‑1 (MQ=255) cGGAGCTTCACCCGCAGCACGGCGACGCATACGATCCTGGTGGTACGCGTAACCGGTACCTg  <  1:1785069/62‑1 (MQ=255) cGGAGCTTCACCCGCAGCACGGCGACGCATACGATCCTGGTGGTACGCGTAACCGGTACCTg  <  1:1802152/62‑1 (MQ=255) cGGAGCTTCACCCGCAGCACGGCGACGCATACGATCCTGGTGGTACGCGTAACCGGTACCTg  <  1:1863352/62‑1 (MQ=255) cGGAGCTTCACCCGCAGCACGGCGACGCATACGATCCTGGTGGTACGCGTAACCGGTACCTg  <  1:1959769/62‑1 (MQ=255) cGGAGCTTCACCCGCAGCACGGCGACGCATACGATCCTGGTGGTACGCGTAACCGGTACCTg  <  1:1974747/62‑1 (MQ=255) cGGAGCTTCACCCGCAGCACGGCGACGCATACGATCCTGGTGGTACGCGTAACCGGTACCTg  <  1:2014440/62‑1 (MQ=255) cGGAGCTTCACCCGCAGCACGGCGACGCATACGATCCTGGTGGTACGCGTAACCGGTACCTg  <  1:2017492/62‑1 (MQ=255) cGGAGCTTCACCCGCAGCACGGCGACGCATACGATCCTGGTGGTACGCGTAACCGGTACCTg  <  1:2777851/62‑1 (MQ=255) cGGAGCTTCACCCGCAGCACGGCGACGCATACGATCCTGGTGGTACGCGTAACCGGTACCTg  <  1:2104981/62‑1 (MQ=255) cGGAGCTTCACCCGCAGCACGGCGACGCATACGATCCTGGTGGTACGCGTAACCGGTACCTg  <  1:219103/62‑1 (MQ=255) cGGAGCTTCACCCGCAGCACGGCGACGCATACGATCCTGGTGGTACGCGTAACCGGTACCTg  <  1:2269146/62‑1 (MQ=255) cGGAGCTTCACCCGCAGCACGGCGACGCATACGATCCTGGTGGTACGCGTAACCGGTACCTg  <  1:2303066/62‑1 (MQ=255) cGGAGCTTCACCCGCAGCACGGCGACGCATACGATCCTGGTGGTACGCGTAACCGGTACCTg  <  1:2338517/62‑1 (MQ=255) cGGAGCTTCACCCGCAGCACGGCGACGCATACGATCCTGGTGGTACGCGTAACCGGTACCTg  <  1:2463922/62‑1 (MQ=255) cGGAGCTTCACCCGCAGCACGGCGACGCATACGATCCTGGTGGTACGCGTAACCGGTACCTg  <  1:2524776/62‑1 (MQ=255) cGGAGCTTCACCCGCAGCACGGCGACGCATACGATCCTGGTGGTACGCGTAACCGGTACCTg  <  1:2549385/62‑1 (MQ=255) cGGAGCTTCACCCGCAGCACGGCGACGCATACGATCCTGGTGGTACGCGTAACCGGTACCTg  <  1:256382/62‑1 (MQ=255) cGGAGCTTCACCCGCAGCACGGCGACGCATACGATCCTGGTGGTACGCGTAACCGGTACCTg  <  1:2749057/62‑1 (MQ=255)  ggAGCTTCACCCGCAGCACGGCGACGCATACGATCCTGGTGGTACGCGTAACCGGTACCTg  <  1:3533715/61‑1 (MQ=255)  ggAGCTTCACCCGCAGCACGGCGACGCATACGATCCTGGTGGTACGCGTAACCGGTACCTg  <  1:881076/61‑1 (MQ=255)                  caCGGCGACGCATACGATCCTGGTGGTACGCGTAACCGGTACCTg  <  1:267726/45‑1 (MQ=255)                   aCGGCGACGCATACGATCCTGGTGGTACGCGTAACCGGTACCTg  <  1:3306625/44‑1 (MQ=255)                                                              | CGGAGCTTCACCCGCAGCACGGCGACGCATACGATCCTGGTGGTACGCGTAACCGGTACCTG  >  minE/2252901‑2252962

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑