Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2253067	2253184	118	35 [0]	[0] 68	rpoC	RNA polymerase, beta prime subunit

GCAGTTCGTCGCGTTTGCCCGCAACGGCTGCTTCGGTCAGCACGCGAGTGGTCTCCTGGAAC  >  minE/2253005‑2253066                                                              | gcAGTTCGTCGCGTTTGCCCGCAACGGCTGCTTCGGTCAGCACGCGAGTGGTCTCCTGGAAc  >  1:351679/1‑62 (MQ=255) gcAGTTCGTCGCGTTTGCCCGCAACGGCTGCTTCGGTCAGCACGCGAGTGGTCTCCTGGAAc  >  1:2750649/1‑62 (MQ=255) gcAGTTCGTCGCGTTTGCCCGCAACGGCTGCTTCGGTCAGCACGCGAGTGGTCTCCTGGAAc  >  1:2935576/1‑62 (MQ=255) gcAGTTCGTCGCGTTTGCCCGCAACGGCTGCTTCGGTCAGCACGCGAGTGGTCTCCTGGAAc  >  1:3001585/1‑62 (MQ=255) gcAGTTCGTCGCGTTTGCCCGCAACGGCTGCTTCGGTCAGCACGCGAGTGGTCTCCTGGAAc  >  1:3036823/1‑62 (MQ=255) gcAGTTCGTCGCGTTTGCCCGCAACGGCTGCTTCGGTCAGCACGCGAGTGGTCTCCTGGAAc  >  1:3110526/1‑62 (MQ=255) gcAGTTCGTCGCGTTTGCCCGCAACGGCTGCTTCGGTCAGCACGCGAGTGGTCTCCTGGAAc  >  1:3145984/1‑62 (MQ=255) gcAGTTCGTCGCGTTTGCCCGCAACGGCTGCTTCGGTCAGCACGCGAGTGGTCTCCTGGAAc  >  1:3222531/1‑62 (MQ=255) gcAGTTCGTCGCGTTTGCCCGCAACGGCTGCTTCGGTCAGCACGCGAGTGGTCTCCTGGAAc  >  1:3374026/1‑62 (MQ=255) gcAGTTCGTCGCGTTTGCCCGCAACGGCTGCTTCGGTCAGCACGCGAGTGGTCTCCTGGAAc  >  1:2569894/1‑62 (MQ=255) gcAGTTCGTCGCGTTTGCCCGCAACGGCTGCTTCGGTCAGCACGCGAGTGGTCTCCTGGAAc  >  1:363902/1‑62 (MQ=255) gcAGTTCGTCGCGTTTGCCCGCAACGGCTGCTTCGGTCAGCACGCGAGTGGTCTCCTGGAAc  >  1:431664/1‑62 (MQ=255) gcAGTTCGTCGCGTTTGCCCGCAACGGCTGCTTCGGTCAGCACGCGAGTGGTCTCCTGGAAc  >  1:627787/1‑62 (MQ=255) gcAGTTCGTCGCGTTTGCCCGCAACGGCTGCTTCGGTCAGCACGCGAGTGGTCTCCTGGAAc  >  1:64825/1‑62 (MQ=255) gcAGTTCGTCGCGTTTGCCCGCAACGGCTGCTTCGGTCAGCACGCGAGTGGTCTCCTGGAAc  >  1:668637/1‑62 (MQ=255) gcAGTTCGTCGCGTTTGCCCGCAACGGCTGCTTCGGTCAGCACGCGAGTGGTCTCCTGGAAc  >  1:826578/1‑62 (MQ=255) gcAGTTCGTCGCGTTTGCCCGCAACGGCTGCTTCGGTCAGCACGCGAGTGGTCTCCTGGAAc  >  1:841359/1‑62 (MQ=255) gcAGTTCGTCGCGTTTGCCCGCAACGGCTGCTTCGGTCAGCACGCGAGTGGTCTCCTGGAAc  >  1:930365/1‑62 (MQ=255) gcAGTTCGTCGCGTTTGCCCGCAACGGCTGCTTCGGTCAGCACGCGAGTGGTCTCCTGGAAc  >  1:207955/1‑62 (MQ=255) gcAGTTCGTCGCGTTTGCCCGCAACGGCTGCTTCGGTCAGCACGCGAGTGGTCTCCTGGAAc  >  1:1261711/1‑62 (MQ=255) gcAGTTCGTCGCGTTTGCCCGCAACGGCTGCTTCGGTCAGCACGCGAGTGGTCTCCTGGAAc  >  1:1277118/1‑62 (MQ=255) gcAGTTCGTCGCGTTTGCCCGCAACGGCTGCTTCGGTCAGCACGCGAGTGGTCTCCTGGAAc  >  1:128902/1‑62 (MQ=255) gcAGTTCGTCGCGTTTGCCCGCAACGGCTGCTTCGGTCAGCACGCGAGTGGTCTCCTGGAAc  >  1:1640014/1‑62 (MQ=255) gcAGTTCGTCGCGTTTGCCCGCAACGGCTGCTTCGGTCAGCACGCGAGTGGTCTCCTGGAAc  >  1:1666228/1‑62 (MQ=255) gcAGTTCGTCGCGTTTGCCCGCAACGGCTGCTTCGGTCAGCACGCGAGTGGTCTCCTGGAAc  >  1:1810607/1‑62 (MQ=255) gcAGTTCGTCGCGTTTGCCCGCAACGGCTGCTTCGGTCAGCACGCGAGTGGTCTCCTGGAAc  >  1:1941279/1‑62 (MQ=255) gcAGTTCGTCGCGTTTGCCCGCAACGGCTGCTTCGGTCAGCACGCGAGTGGTCTCCTGGAAc  >  1:2037912/1‑62 (MQ=255) gcAGTTCGTCGCGTTTGCCCGCAACGGCTGCTTCGGTCAGCACGCGAGTGGTCTCCTGGAAc  >  1:1112379/1‑62 (MQ=255) gcAGTTCGTCGCGTTTGCCCGCAACGGCTGCTTCGGTCAGCACGCGAGTGGTCTCCTGGAAc  >  1:2136153/1‑62 (MQ=255) gcAGTTCGTCGCGTTTGCCCGCAACGGCTGCTTCGGTCAGCACGCGAGTGGTCTCCTGGAAc  >  1:2150128/1‑62 (MQ=255) gcAGTTCGTCGCGTTTGCCCGCAACGGCTGCTTCGGTCAGCACGCGAGTGGTCTCCTGGAAc  >  1:2178629/1‑62 (MQ=255) gcAGTTCGTCGCGTTTGCCCGCAACGGCTGCTTCGGTCAGCACGCGAGTGGTCTCCTGGAAc  >  1:2214138/1‑62 (MQ=255) gcAGTTCGTCGCGTTTGCCCGCAACGGCTGCTTCGGTCAGCACGCGAGTGGTCTCCTGGAAc  >  1:2294954/1‑62 (MQ=255) gcAGTTCGTCGCGTTTGCCCGCAACGGCTGCTTCGGTCAGCACGCGAGTGGTCTCCTGGAAc  >  1:2443262/1‑62 (MQ=255) gcAGTTCGTCGCGTTTGCCCGCAACGGCTGCTTCGGTCAGCACGCGAGTGGTCTCCTGGAAc  >  1:2447342/1‑62 (MQ=255)                                                              | GCAGTTCGTCGCGTTTGCCCGCAACGGCTGCTTCGGTCAGCACGCGAGTGGTCTCCTGGAAC  >  minE/2253005‑2253066

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑