Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2253393	2253460	68	72 [0]	[1] 37	rpoC	RNA polymerase, beta prime subunit

TCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGGCGC  >  minE/2253331‑2253392                                                              | tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:2802759/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:3026729/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:3019257/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:297803/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:2941319/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:2914034/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:2905171/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:2888445/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:2816264/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:3071813/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:2729907/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:2722603/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:2638480/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:2632085/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:2609488/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:2594962/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:2590342/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:1037756/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:445064/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:894527/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:867167/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:647157/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:611896/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:567303/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:476187/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:457505/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:448249/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:2505868/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:370418/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:3609355/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:356854/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:3470102/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:3387709/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:3148380/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:3120518/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:3084703/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:1606792/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:2498389/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:1793354/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:1792131/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:1776804/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:1776524/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:1724111/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:168555/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:1682966/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:181162/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:155692/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:1485282/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:1469191/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:1438012/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:1419189/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:1300566/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:1274678/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:1254599/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:1946382/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:2498305/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:2477055/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:2409267/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:2344202/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:2335530/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:2325915/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:2304298/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:228268/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:2202803/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:2193046/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:2022456/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:1996647/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:1994606/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:1990436/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:1894471/1‑62 (MQ=255) tCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACAACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:251271/1‑62 (MQ=255) ccGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGgcgc  >  1:1718937/2‑62 (MQ=255)                                                              | TCGTTAACGATGTAACGAGTAACAGCATGAACACCACGCAGACGCAGAATGTCGTGCGGCGC  >  minE/2253331‑2253392

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑