Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	2254091	2254133	43	35 [0]	[1] 18	rpoC	RNA polymerase, beta prime subunit

CAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTT  >  minE/2254029‑2254090                                                              | cAGTACGGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGAtcagtt  <  1:512716/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGAtcagtt  <  1:2788708/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGAtcagtt  <  1:2302792/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGAtcagtt  <  1:2348903/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGAtcagtt  <  1:2432262/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGAtcagtt  <  1:2478797/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGAtcagtt  <  1:2561848/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGAtcagtt  <  1:2673597/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGAtcagtt  <  1:2730935/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGAtcagtt  <  1:2745708/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGAtcagtt  <  1:2268699/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGAtcagtt  <  1:2823252/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGAtcagtt  <  1:2824744/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGAtcagtt  <  1:342679/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGAtcagtt  <  1:3642228/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGAtcagtt  <  1:531622/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGAtcagtt  <  1:58059/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGAtcagtt  <  1:1795459/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGAtcagtt  <  1:1126236/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGAtcagtt  <  1:1367740/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGAtcagtt  <  1:1368469/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGAtcagtt  <  1:1452788/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGAtcagtt  <  1:1467794/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGAtcagtt  <  1:1512899/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGAtcagtt  <  1:1515302/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGAtcagtt  <  1:1682223/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGAtcagtt  <  1:1109661/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGAtcagtt  <  1:1882836/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGAtcagtt  <  1:1922655/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGAtcagtt  <  1:2116134/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGAtcagtt  <  1:2179897/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGAtcagtt  <  1:2185970/62‑1 (MQ=255) cAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGAtcagtt  <  1:221196/62‑1 (MQ=255)  aGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGAtcagtt  <  1:2611015/61‑1 (MQ=255)               aaGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGAtcagtt  <  1:2264000/48‑1 (MQ=255)                                                              | CAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTT  >  minE/2254029‑2254090

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑