Missing coverage evidence...
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CACACACGCCAGTTCCTGAATGTGGATGGTGGTGAAACGGTCTTCCTGAACAACACGCTCGG  >  minE/2258626‑2258687                                                              | cacacgcGCCAGTTCCTGAATGTGGATGGTGGTGAAACGGTCTTCCTGAACAACACGCTCgg  <  1:2433013/62‑1 (MQ=255) cacacacGCCAGTTCCTGAATGTGGATGGTGGTGAAACGGTCTTCCTGAACAACACGCTCgg  <  1:1301080/62‑1 (MQ=255) cacacacGCCAGTTCCTGAATGTGGATGGTGGTGAAACGGTCTTCCTGAACAACACGCTCgg  <  1:898263/62‑1 (MQ=255) cacacacGCCAGTTCCTGAATGTGGATGGTGGTGAAACGGTCTTCCTGAACAACACGCTCgg  <  1:709038/62‑1 (MQ=255) cacacacGCCAGTTCCTGAATGTGGATGGTGGTGAAACGGTCTTCCTGAACAACACGCTCgg  <  1:554204/62‑1 (MQ=255) cacacacGCCAGTTCCTGAATGTGGATGGTGGTGAAACGGTCTTCCTGAACAACACGCTCgg  <  1:383181/62‑1 (MQ=255) cacacacGCCAGTTCCTGAATGTGGATGGTGGTGAAACGGTCTTCCTGAACAACACGCTCgg  <  1:3369568/62‑1 (MQ=255) cacacacGCCAGTTCCTGAATGTGGATGGTGGTGAAACGGTCTTCCTGAACAACACGCTCgg  <  1:2992973/62‑1 (MQ=255) cacacacGCCAGTTCCTGAATGTGGATGGTGGTGAAACGGTCTTCCTGAACAACACGCTCgg  <  1:2705936/62‑1 (MQ=255) cacacacGCCAGTTCCTGAATGTGGATGGTGGTGAAACGGTCTTCCTGAACAACACGCTCgg  <  1:262664/62‑1 (MQ=255) cacacacGCCAGTTCCTGAATGTGGATGGTGGTGAAACGGTCTTCCTGAACAACACGCTCgg  <  1:256604/62‑1 (MQ=255) cacacacGCCAGTTCCTGAATGTGGATGGTGGTGAAACGGTCTTCCTGAACAACACGCTCgg  <  1:2406938/62‑1 (MQ=255) cacacacGCCAGTTCCTGAATGTGGATGGTGGTGAAACGGTCTTCCTGAACAACACGCTCgg  <  1:2394243/62‑1 (MQ=255) cacacacGCCAGTTCCTGAATGTGGATGGTGGTGAAACGGTCTTCCTGAACAACACGCTCgg  <  1:2296951/62‑1 (MQ=255) cacacacGCCAGTTCCTGAATGTGGATGGTGGTGAAACGGTCTTCCTGAACAACACGCTCgg  <  1:1952849/62‑1 (MQ=255) cacacacGCCAGTTCCTGAATGTGGATGGTGGTGAAACGGTCTTCCTGAACAACACGCTCgg  <  1:1682048/62‑1 (MQ=255) cacacacGCCAGTTCCTGAATGTGGATGGTGGTGAAACGGTCTTCCTGAACAACACGCTCgg  <  1:1310198/62‑1 (MQ=255) cacacacGCCAGTTCCTGAATGTGGATGGTGGTGAAACGGTCTTCCTGAACAACACGCTCgg  <  1:1227109/62‑1 (MQ=255)  acacacGCCAGTTCCTGAATGTGGATGGTGGTGAAACGGTCTTCCTGAACAACACGCTCgg  <  1:979626/61‑1 (MQ=255)   cacacGCCAGTTCCTGAATGTGGATGGTGGTGAAACTGTCTTCCTGAACAACACGCTCgg  <  1:2337310/60‑1 (MQ=255)           aGTTCCTGTATGTGGATGGTGGTGAAACGGTCTTCCTGAACAACACGCTCgg  <  1:2643232/52‑1 (MQ=255)                                                              | CACACACGCCAGTTCCTGAATGTGGATGGTGGTGAAACGGTCTTCCTGAACAACACGCTCGG  >  minE/2258626‑2258687

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑