Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2282953	2283013	61	58 [0]	[0] 95	[sthA]–[oxyR]	[sthA],[oxyR]

GTGGCGGCAACACTATTGAGTACTTCGTCAACACCACCTTTAACTACCCGACGATGGCGGAA  >  minE/2282891‑2282952                                                              | gTGGCGGCAACACTATTGAGTACTTCGTCAACACCACCTTTAACTACCCGACGATGGCGGaa  >  1:3377153/1‑62 (MQ=255) gTGGCGGCAACACTATTGAGTACTTCGTCAACACCACCTTTAACTACCCGACGATGGCGGaa  >  1:2673400/1‑62 (MQ=255) gTGGCGGCAACACTATTGAGTACTTCGTCAACACCACCTTTAACTACCCGACGATGGCGGaa  >  1:2685501/1‑62 (MQ=255) gTGGCGGCAACACTATTGAGTACTTCGTCAACACCACCTTTAACTACCCGACGATGGCGGaa  >  1:2738891/1‑62 (MQ=255) gTGGCGGCAACACTATTGAGTACTTCGTCAACACCACCTTTAACTACCCGACGATGGCGGaa  >  1:2797025/1‑62 (MQ=255) gTGGCGGCAACACTATTGAGTACTTCGTCAACACCACCTTTAACTACCCGACGATGGCGGaa  >  1:282276/1‑62 (MQ=255) gTGGCGGCAACACTATTGAGTACTTCGTCAACACCACCTTTAACTACCCGACGATGGCGGaa  >  1:3017783/1‑62 (MQ=255) gTGGCGGCAACACTATTGAGTACTTCGTCAACACCACCTTTAACTACCCGACGATGGCGGaa  >  1:3046826/1‑62 (MQ=255) gTGGCGGCAACACTATTGAGTACTTCGTCAACACCACCTTTAACTACCCGACGATGGCGGaa  >  1:3052644/1‑62 (MQ=255) gTGGCGGCAACACTATTGAGTACTTCGTCAACACCACCTTTAACTACCCGACGATGGCGGaa  >  1:3061055/1‑62 (MQ=255) gTGGCGGCAACACTATTGAGTACTTCGTCAACACCACCTTTAACTACCCGACGATGGCGGaa  >  1:3066317/1‑62 (MQ=255) gTGGCGGCAACACTATTGAGTACTTCGTCAACACCACCTTTAACTACCCGACGATGGCGGaa  >  1:3241357/1‑62 (MQ=255) gTGGCGGCAACACTATTGAGTACTTCGTCAACACCACCTTTAACTACCCGACGATGGCGGaa  >  1:3259681/1‑62 (MQ=255) gTGGCGGCAACACTATTGAGTACTTCGTCAACACCACCTTTAACTACCCGACGATGGCGGaa  >  1:3313260/1‑62 (MQ=255) gTGGCGGCAACACTATTGAGTACTTCGTCAACACCACCTTTAACTACCCGACGATGGCGGaa  >  1:3367868/1‑62 (MQ=255) gTGGCGGCAACACTATTGAGTACTTCGTCAACACCACCTTTAACTACCCGACGATGGCGGaa  >  1:2654907/1‑62 (MQ=255) gTGGCGGCAACACTATTGAGTACTTCGTCAACACCACCTTTAACTACCCGACGATGGCGGaa  >  1:3426647/1‑62 (MQ=255) gTGGCGGCAACACTATTGAGTACTTCGTCAACACCACCTTTAACTACCCGACGATGGCGGaa  >  1:3504476/1‑62 (MQ=255) gTGGCGGCAACACTATTGAGTACTTCGTCAACACCACCTTTAACTACCCGACGATGGCGGaa  >  1:3506827/1‑62 (MQ=255) gTGGCGGCAACACTATTGAGTACTTCGTCAACACCACCTTTAACTACCCGACGATGGCGGaa  >  1:3523097/1‑62 (MQ=255) gTGGCGGCAACACTATTGAGTACTTCGTCAACACCACCTTTAACTACCCGACGATGGCGGaa  >  1:3556167/1‑62 (MQ=255) gTGGCGGCAACACTATTGAGTACTTCGTCAACACCACCTTTAACTACCCGACGATGGCGGaa  >  1:3560532/1‑62 (MQ=255) gTGGCGGCAACACTATTGAGTACTTCGTCAACACCACCTTTAACTACCCGACGATGGCGGaa  >  1:442168/1‑62 (MQ=255) gTGGCGGCAACACTATTGAGTACTTCGTCAACACCACCTTTAACTACCCGACGATGGCGGaa  >  1:765466/1‑62 (MQ=255) gTGGCGGCAACACTATTGAGTACTTCGTCAACACCACCTTTAACTACCCGACGATGGCGGaa  >  1:831610/1‑62 (MQ=255) gTGGCGGCAACACTATTGAGTACTTCGTCAACACCACCTTTAACTACCCGACGATGGCGGaa  >  1:846284/1‑62 (MQ=255) gTGGCGGCAACACTATTGAGTACTTCGTCAACACCACCTTTAACTACCCGACGATGGCGGaa  >  1:855343/1‑62 (MQ=255) gTGGCGGCAACACTATTGAGTACTTCGTCAACACCACCTTTAACTACCCGACGATGGCGGaa  >  1:864866/1‑62 (MQ=255) gTGGCGGCAACACTATTGAGTACTTCGTCAACACCACCTTTAACTACCCGACGATGGCGGaa  >  1:907082/1‑62 (MQ=255) gTGGCGGCAACACTATTGAGTACTTCGTCAACACCACCTTTAACTACCCGACGATGGCGGaa  >  1:1899772/1‑62 (MQ=255) gTGGCGGCAACACTATTGAGTACTTCGTCAACACCACCTTTAACTACCCGACGATGGCGGaa  >  1:122506/1‑62 (MQ=255) gTGGCGGCAACACTATTGAGTACTTCGTCAACACCACCTTTAACTACCCGACGATGGCGGaa  >  1:1258428/1‑62 (MQ=255) gTGGCGGCAACACTATTGAGTACTTCGTCAACACCACCTTTAACTACCCGACGATGGCGGaa  >  1:1295520/1‑62 (MQ=255) gTGGCGGCAACACTATTGAGTACTTCGTCAACACCACCTTTAACTACCCGACGATGGCGGaa  >  1:1379076/1‑62 (MQ=255) gTGGCGGCAACACTATTGAGTACTTCGTCAACACCACCTTTAACTACCCGACGATGGCGGaa  >  1:1488896/1‑62 (MQ=255) gTGGCGGCAACACTATTGAGTACTTCGTCAACACCACCTTTAACTACCCGACGATGGCGGaa  >  1:1533566/1‑62 (MQ=255) gTGGCGGCAACACTATTGAGTACTTCGTCAACACCACCTTTAACTACCCGACGATGGCGGaa  >  1:1545038/1‑62 (MQ=255) gTGGCGGCAACACTATTGAGTACTTCGTCAACACCACCTTTAACTACCCGACGATGGCGGaa  >  1:1566686/1‑62 (MQ=255) gTGGCGGCAACACTATTGAGTACTTCGTCAACACCACCTTTAACTACCCGACGATGGCGGaa  >  1:162352/1‑62 (MQ=255) gTGGCGGCAACACTATTGAGTACTTCGTCAACACCACCTTTAACTACCCGACGATGGCGGaa  >  1:165588/1‑62 (MQ=255) gTGGCGGCAACACTATTGAGTACTTCGTCAACACCACCTTTAACTACCCGACGATGGCGGaa  >  1:1685448/1‑62 (MQ=255) gTGGCGGCAACACTATTGAGTACTTCGTCAACACCACCTTTAACTACCCGACGATGGCGGaa  >  1:170426/1‑62 (MQ=255) gTGGCGGCAACACTATTGAGTACTTCGTCAACACCACCTTTAACTACCCGACGATGGCGGaa  >  1:1730640/1‑62 (MQ=255) gTGGCGGCAACACTATTGAGTACTTCGTCAACACCACCTTTAACTACCCGACGATGGCGGaa  >  1:188047/1‑62 (MQ=255) gTGGCGGCAACACTATTGAGTACTTCGTCAACACCACCTTTAACTACCCGACGATGGCGGaa  >  1:1040585/1‑62 (MQ=255) gTGGCGGCAACACTATTGAGTACTTCGTCAACACCACCTTTAACTACCCGACGATGGCGGaa  >  1:1903933/1‑62 (MQ=255) gTGGCGGCAACACTATTGAGTACTTCGTCAACACCACCTTTAACTACCCGACGATGGCGGaa  >  1:1914762/1‑62 (MQ=255) gTGGCGGCAACACTATTGAGTACTTCGTCAACACCACCTTTAACTACCCGACGATGGCGGaa  >  1:1994129/1‑62 (MQ=255) gTGGCGGCAACACTATTGAGTACTTCGTCAACACCACCTTTAACTACCCGACGATGGCGGaa  >  1:1999036/1‑62 (MQ=255) gTGGCGGCAACACTATTGAGTACTTCGTCAACACCACCTTTAACTACCCGACGATGGCGGaa  >  1:2162113/1‑62 (MQ=255) gTGGCGGCAACACTATTGAGTACTTCGTCAACACCACCTTTAACTACCCGACGATGGCGGaa  >  1:2263278/1‑62 (MQ=255) gTGGCGGCAACACTATTGAGTACTTCGTCAACACCACCTTTAACTACCCGACGATGGCGGaa  >  1:2375621/1‑62 (MQ=255) gTGGCGGCAACACTATTGAGTACTTCGTCAACACCACCTTTAACTACCCGACGATGGCGGaa  >  1:2385092/1‑62 (MQ=255) gTGGCGGCAACACTATTGAGTACTTCGTCAACACCACCTTTAACTACCCGACGATGGCGGaa  >  1:2434241/1‑62 (MQ=255) gTGGCGGCAACACTATTGAGTACTTCGTCAACACCACCTTTAACTACCCGACGATGGCGGaa  >  1:2520813/1‑62 (MQ=255) gTGGCGGCAACACTATTGAGTACTTCGTCAACACCACCTTTAACTACCCGACGATGGCGGaa  >  1:2600202/1‑62 (MQ=255) gTGGCGGCAACACTATTGAGTACTTCGTCAACACCACCTTTAACTACCCGACGATGGCGGaa  >  1:2628621/1‑62 (MQ=255) gTGGCGGCAACACTATTGAGTACTTCGTCAACACCACCTATAACTACCCGACGATGGCGGaa  >  1:2325969/1‑62 (MQ=255)                                                              | GTGGCGGCAACACTATTGAGTACTTCGTCAACACCACCTTTAACTACCCGACGATGGCGGAA  >  minE/2282891‑2282952

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑