Missing coverage evidence...
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GGCAAACAGAGCGAGCTGGAGGCTATGTGCCGCGATTGGCCATTCTTCTCGACGCGTCTCGG  >  minE/2291521‑2291582                                                              | ggCAAACAGAGCGAGCTGGAGGCTATGTGCCGCGATTGGCCATTCTTCTCGACGCGTCTCgg  <  1:3224362/62‑1 (MQ=255) ggCAAACAGAGCGAGCTGGAGGCTATGTGCCGCGATTGGCCATTCTTCTCGACGCGTCTCgg  <  1:2240531/62‑1 (MQ=255) ggCAAACAGAGCGAGCTGGAGGCTATGTGCCGCGATTGGCCATTCTTCTCGACGCGTCTCgg  <  1:2271818/62‑1 (MQ=255) ggCAAACAGAGCGAGCTGGAGGCTATGTGCCGCGATTGGCCATTCTTCTCGACGCGTCTCgg  <  1:2400549/62‑1 (MQ=255) ggCAAACAGAGCGAGCTGGAGGCTATGTGCCGCGATTGGCCATTCTTCTCGACGCGTCTCgg  <  1:2501310/62‑1 (MQ=255) ggCAAACAGAGCGAGCTGGAGGCTATGTGCCGCGATTGGCCATTCTTCTCGACGCGTCTCgg  <  1:2799474/62‑1 (MQ=255) ggCAAACAGAGCGAGCTGGAGGCTATGTGCCGCGATTGGCCATTCTTCTCGACGCGTCTCgg  <  1:2822640/62‑1 (MQ=255) ggCAAACAGAGCGAGCTGGAGGCTATGTGCCGCGATTGGCCATTCTTCTCGACGCGTCTCgg  <  1:2868150/62‑1 (MQ=255) ggCAAACAGAGCGAGCTGGAGGCTATGTGCCGCGATTGGCCATTCTTCTCGACGCGTCTCgg  <  1:3071779/62‑1 (MQ=255) ggCAAACAGAGCGAGCTGGAGGCTATGTGCCGCGATTGGCCATTCTTCTCGACGCGTCTCgg  <  1:1239812/62‑1 (MQ=255) ggCAAACAGAGCGAGCTGGAGGCTATGTGCCGCGATTGGCCATTCTTCTCGACGCGTCTCgg  <  1:3232190/62‑1 (MQ=255) ggCAAACAGAGCGAGCTGGAGGCTATGTGCCGCGATTGGCCATTCTTCTCGACGCGTCTCgg  <  1:337508/62‑1 (MQ=255) ggCAAACAGAGCGAGCTGGAGGCTATGTGCCGCGATTGGCCATTCTTCTCGACGCGTCTCgg  <  1:3380455/62‑1 (MQ=255) ggCAAACAGAGCGAGCTGGAGGCTATGTGCCGCGATTGGCCATTCTTCTCGACGCGTCTCgg  <  1:3420420/62‑1 (MQ=255) ggCAAACAGAGCGAGCTGGAGGCTATGTGCCGCGATTGGCCATTCTTCTCGACGCGTCTCgg  <  1:3638994/62‑1 (MQ=255) ggCAAACAGAGCGAGCTGGAGGCTATGTGCCGCGATTGGCCATTCTTCTCGACGCGTCTCgg  <  1:466459/62‑1 (MQ=255) ggCAAACAGAGCGAGCTGGAGGCTATGTGCCGCGATTGGCCATTCTTCTCGACGCGTCTCgg  <  1:621288/62‑1 (MQ=255) ggCAAACAGAGCGAGCTGGAGGCTATGTGCCGCGATTGGCCATTCTTCTCGACGCGTCTCgg  <  1:2145928/62‑1 (MQ=255) ggCAAACAGAGCGAGCTGGAGGCTATGTGCCGCGATTGGCCATTCTTCTCGACGCGTCTCgg  <  1:1542749/62‑1 (MQ=255) ggCAAACAGAGCGAGCTGGAGGCTATGTGCCGCGATTGGCCATTCTTCTCGACGCGTCTCgg  <  1:1597859/62‑1 (MQ=255) ggCAAACAGAGCGAGCTGGAGGCTATGTGCCGCGATTGGCCATTCTTCTCGACGCGTCTCgg  <  1:1608847/62‑1 (MQ=255) ggCAAACAGAGCGAGCTGGAGGCTATGTGCCGCGATTGGCCATTCTTCTCGACGCGTCTCgg  <  1:2207238/62‑1 (MQ=255) ggCAAACAGAGCGAGCTGGAGGCTATGTGCCGCGATTGGCCATTCTTCTCGACGCGTCTCgg  <  1:1684303/62‑1 (MQ=255) ggCAAACAGAGCGAGCTGGAGGCTATGTGCCGCGATTGGCCATTCTTCTCGACGCGTCTCgg  <  1:1525052/62‑1 (MQ=255) ggCAAACAGAGCGAGCTGGAGGCTATGTGCCGCGATTGGCCATTCTTCTCGACGCGTCTCgg  <  1:1729179/62‑1 (MQ=255) ggCAAACAGAGCGAGCTGGAGGCTATGTGCCGCGATTGGCCATTCTTCTCGACGCGTCTCgg  <  1:1786384/62‑1 (MQ=255) ggCAAACAGAGCGAGCTGGAGGCTATGTGCCGCGATTGGCCATTCTTCTCGACGCGTCTCgg  <  1:1939250/62‑1 (MQ=255) ggCAAACAGAGCGAGCTGGAGGCTATGTGCCGCGATTGGCCATTCTTCTCGACGCGTCTCgg  <  1:1500141/62‑1 (MQ=255) ggCAAACAGAGCGAGCTGGAGGCTATGTGCCGCGATTGGCCATTCTTCTCGACGCGTCTCgg  <  1:1091659/62‑1 (MQ=255) ggCAAACAGAGCGAGCTGGAGGCTATGTGCCGCGATTGGCCATTCTTCTCGACGCGTCTCgg  <  1:2116131/62‑1 (MQ=255)  gCAAACAGAGCGAGCTGGAGGCTATGTGCCGCGATTGGCCATTCTTCTCGACGCGTCTCgg  <  1:3524485/61‑1 (MQ=255)  gCAAACAGAGCGAGCTGGAGGCTATGTGCCGCGATTGGCCATTCTTCTCGACGCGTCTCgg  <  1:543813/61‑1 (MQ=255)  gCAAACAGAGCGAGCTGGAGGCTATGTGCCGCGATTGGCCATTCTTCTCGACGCGTCTCgg  <  1:3302163/61‑1 (MQ=255)  gCAAACAGAGCGAGCTGGAGGCTATGTGCCGCGATTGGCCATTCTTCTCGACGCGTCTCgg  <  1:3482654/61‑1 (MQ=255)  gCAAACAGAGCGAGCTGGAGGCTATGTGCCGCGATTGGCCATTCTTCTCGACGCGTCTCgg  <  1:1667665/61‑1 (MQ=255)  gCAAACAGAGCGAGCTGGAGGCTATGTGCCGCGATTGGCCATTCTTCTCGACGCGTCTCgg  <  1:1998283/61‑1 (MQ=255)  gCAAACAGAGCGAGCTGGAGGCTATGTGCCGCGATTGGCCATTCTTCTCGACGCGTCTCgg  <  1:2699401/61‑1 (MQ=255)  gCAAACAGAGCGAGCTGGAGGCTATGTGCCGCGATTGGCCATTCTTCTCGACGCGGCTCgg  <  1:3194648/61‑1 (MQ=255)         gagcgagcTGGAGGCTATGTGCCGCGATTGGCCATTCTTCTCGACGCGTCTCgg  <  1:71310/54‑1 (MQ=255)                cTGGAGGCTATGTGCCGCGATTGGCCATTCTTCTCGACGCGTCTCgg  <  1:2054929/47‑1 (MQ=255)                       cTATGTGCCGCGATTGGCCATTCTTCTCGACGCGTCTCgg  <  1:3455983/40‑1 (MQ=255)                                                              | GGCAAACAGAGCGAGCTGGAGGCTATGTGCCGCGATTGGCCATTCTTCTCGACGCGTCTCGG  >  minE/2291521‑2291582

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑