Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2294583	2294583	1	29 [0]	[0] 9	yijF	conserved hypothetical protein

CTGGTTCACGAAGATATGGCGAAGAATTTTGCTGAGTACCCGCAAAAATGGAAGTTAAAGCG  >  minE/2294521‑2294582                                                              | cttgTTCACGAAGATATGGCGAAGAATTTTGCTGAGTACCCGCAAAAATGGAAGTTAAAgcg  <  1:2780069/59‑1 (MQ=255) cTGGTTCACGAAGATATGGCGAAGAATTTTGCTGAGTACCCGCAAAAATGGAAGTTAAAgcg  <  1:2407024/62‑1 (MQ=255) cTGGTTCACGAAGATATGGCGAAGAATTTTGCTGAGTACCCGCAAAAATGGAAGTTAAAgcg  <  1:902434/62‑1 (MQ=255) cTGGTTCACGAAGATATGGCGAAGAATTTTGCTGAGTACCCGCAAAAATGGAAGTTAAAgcg  <  1:630598/62‑1 (MQ=255) cTGGTTCACGAAGATATGGCGAAGAATTTTGCTGAGTACCCGCAAAAATGGAAGTTAAAgcg  <  1:606920/62‑1 (MQ=255) cTGGTTCACGAAGATATGGCGAAGAATTTTGCTGAGTACCCGCAAAAATGGAAGTTAAAgcg  <  1:579405/62‑1 (MQ=255) cTGGTTCACGAAGATATGGCGAAGAATTTTGCTGAGTACCCGCAAAAATGGAAGTTAAAgcg  <  1:3201095/62‑1 (MQ=255) cTGGTTCACGAAGATATGGCGAAGAATTTTGCTGAGTACCCGCAAAAATGGAAGTTAAAgcg  <  1:3083258/62‑1 (MQ=255) cTGGTTCACGAAGATATGGCGAAGAATTTTGCTGAGTACCCGCAAAAATGGAAGTTAAAgcg  <  1:3070559/62‑1 (MQ=255) cTGGTTCACGAAGATATGGCGAAGAATTTTGCTGAGTACCCGCAAAAATGGAAGTTAAAgcg  <  1:3015049/62‑1 (MQ=255) cTGGTTCACGAAGATATGGCGAAGAATTTTGCTGAGTACCCGCAAAAATGGAAGTTAAAgcg  <  1:3008156/62‑1 (MQ=255) cTGGTTCACGAAGATATGGCGAAGAATTTTGCTGAGTACCCGCAAAAATGGAAGTTAAAgcg  <  1:2941321/62‑1 (MQ=255) cTGGTTCACGAAGATATGGCGAAGAATTTTGCTGAGTACCCGCAAAAATGGAAGTTAAAgcg  <  1:2804625/62‑1 (MQ=255) cTGGTTCACGAAGATATGGCGAAGAATTTTGCTGAGTACCCGCAAAAATGGAAGTTAAAgcg  <  1:2658831/62‑1 (MQ=255) cTGGTTCACGAAGATATGGCGAAGAATTTTGCTGAGTACCCGCAAAAATGGAAGTTAAAgcg  <  1:2444636/62‑1 (MQ=255) cTGGTTCACGAAGATATGGCGAAGAATTTTGCTGAGTACCCGCAAAAATGGAAGTTAAAgcg  <  1:2393945/62‑1 (MQ=255) cTGGTTCACGAAGATATGGCGAAGAATTTTGCTGAGTACCCGCAAAAATGGAAGTTAAAgcg  <  1:221882/62‑1 (MQ=255) cTGGTTCACGAAGATATGGCGAAGAATTTTGCTGAGTACCCGCAAAAATGGAAGTTAAAgcg  <  1:2204686/62‑1 (MQ=255) cTGGTTCACGAAGATATGGCGAAGAATTTTGCTGAGTACCCGCAAAAATGGAAGTTAAAgcg  <  1:2182573/62‑1 (MQ=255) cTGGTTCACGAAGATATGGCGAAGAATTTTGCTGAGTACCCGCAAAAATGGAAGTTAAAgcg  <  1:2109483/62‑1 (MQ=255) cTGGTTCACGAAGATATGGCGAAGAATTTTGCTGAGTACCCGCAAAAATGGAAGTTAAAgcg  <  1:2083513/62‑1 (MQ=255) cTGGTTCACGAAGATATGGCGAAGAATTTTGCTGAGTACCCGCAAAAATGGAAGTTAAAgcg  <  1:2065517/62‑1 (MQ=255) cTGGTTCACGAAGATATGGCGAAGAATTTTGCTGAGTACCCGCAAAAATGGAAGTTAAAgcg  <  1:1906161/62‑1 (MQ=255) cTGGTTCACGAAGATATGGCGAAGAATTTTGCTGAGTACCCGCAAAAATGGAAGTTAAAgcg  <  1:1863390/62‑1 (MQ=255) cTGGTTCACGAAGATATGGCGAAGAATTTTGCTGAGTACCCGCAAAAATGGAAGTTAAAgcg  <  1:1754292/62‑1 (MQ=255) cTGGTTCACGAAGATATGGCGAAGAATTTTGCTGAGTACCCGCAAAAATGGAAGTTAAAgcg  <  1:1716432/62‑1 (MQ=255) cTGGTTCACGAAGATATGGCGAAGAATTTTGCTGAGTACCCGCAAAAATGGAAGTTAAAgcg  <  1:163535/62‑1 (MQ=255) cTGGTTCACGAAGATATGGCGAAGAATTTTGCTGAGTACCCGCAAAAATGGAAGTTAAAgcg  <  1:1355810/62‑1 (MQ=255)  tGGTTCACGAAGATATGGCGAAGAATTTTGCTGAGTACCCGCAAAAATGGAAGTTAAAgcg  <  1:1039942/61‑1 (MQ=255)                                                              | CTGGTTCACGAAGATATGGCGAAGAATTTTGCTGAGTACCCGCAAAAATGGAAGTTAAAGCG  >  minE/2294521‑2294582

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑