Missing coverage evidence...
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CATCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATC  >  minE/2319185‑2319245                                                             | caTCCTGAGTATCTTTAGCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATc  <  1:791028/61‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTTCCAACAAACGCACCAAGATc  <  1:2504022/61‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATc  <  1:482575/61‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATc  <  1:3240444/61‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATc  <  1:3305243/61‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATc  <  1:3329786/61‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATc  <  1:3358240/61‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATc  <  1:3368614/61‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATc  <  1:3390636/61‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATc  <  1:3393595/61‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATc  <  1:3583073/61‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATc  <  1:393804/61‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATc  <  1:42630/61‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATc  <  1:481178/61‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATc  <  1:3173776/61‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATc  <  1:497765/61‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATc  <  1:513092/61‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATc  <  1:629679/61‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATc  <  1:675148/61‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATc  <  1:771954/61‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATc  <  1:784233/61‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATc  <  1:797563/61‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATc  <  1:872039/61‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATc  <  1:915633/61‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATc  <  1:959471/61‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATc  <  1:1919319/61‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATc  <  1:1149517/61‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATc  <  1:1172538/61‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATc  <  1:1236102/61‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATc  <  1:1249790/61‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATc  <  1:1327967/61‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATc  <  1:151137/61‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATc  <  1:1545538/61‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATc  <  1:1589211/61‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATc  <  1:1620486/61‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATc  <  1:1777741/61‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATc  <  1:1137696/61‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATc  <  1:2089043/61‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATc  <  1:2246736/61‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATc  <  1:2247791/61‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATc  <  1:2291403/61‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATc  <  1:231168/61‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATc  <  1:2592867/61‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATc  <  1:2733173/61‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATc  <  1:288937/61‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATc  <  1:2901691/61‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATc  <  1:2939522/61‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATc  <  1:3013105/61‑1 (MQ=255)  aTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATc  <  1:590154/60‑1 (MQ=255)                                                             | CATCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATC  >  minE/2319185‑2319245

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑