Missing coverage evidence...
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ATCATGGGCACACCGCAGCTGGCGCGAATTCTGCACCCGTTTGTCGGCGTGGTTATGTTTGC  >  minE/2336649‑2336710                                                              | aTCATGGGCACACCGCAGCTGGCGCGAATTCTGCACCCGTTTGTGGGCGTGGTTATGTTTGc  <  1:1291371/62‑1 (MQ=255) aTCATGGGCACACCGCAGCTGGCGCGAATTCTGCACCCGTTTGTCGGCGTGGTTATGTTTGc  <  1:3145691/62‑1 (MQ=255) aTCATGGGCACACCGCAGCTGGCGCGAATTCTGCACCCGTTTGTCGGCGTGGTTATGTTTGc  <  1:2537168/62‑1 (MQ=255) aTCATGGGCACACCGCAGCTGGCGCGAATTCTGCACCCGTTTGTCGGCGTGGTTATGTTTGc  <  1:2706822/62‑1 (MQ=255) aTCATGGGCACACCGCAGCTGGCGCGAATTCTGCACCCGTTTGTCGGCGTGGTTATGTTTGc  <  1:2767304/62‑1 (MQ=255) aTCATGGGCACACCGCAGCTGGCGCGAATTCTGCACCCGTTTGTCGGCGTGGTTATGTTTGc  <  1:2808206/62‑1 (MQ=255) aTCATGGGCACACCGCAGCTGGCGCGAATTCTGCACCCGTTTGTCGGCGTGGTTATGTTTGc  <  1:2825583/62‑1 (MQ=255) aTCATGGGCACACCGCAGCTGGCGCGAATTCTGCACCCGTTTGTCGGCGTGGTTATGTTTGc  <  1:2909933/62‑1 (MQ=255) aTCATGGGCACACCGCAGCTGGCGCGAATTCTGCACCCGTTTGTCGGCGTGGTTATGTTTGc  <  1:2988105/62‑1 (MQ=255) aTCATGGGCACACCGCAGCTGGCGCGAATTCTGCACCCGTTTGTCGGCGTGGTTATGTTTGc  <  1:2990779/62‑1 (MQ=255) aTCATGGGCACACCGCAGCTGGCGCGAATTCTGCACCCGTTTGTCGGCGTGGTTATGTTTGc  <  1:2521695/62‑1 (MQ=255) aTCATGGGCACACCGCAGCTGGCGCGAATTCTGCACCCGTTTGTCGGCGTGGTTATGTTTGc  <  1:3586886/62‑1 (MQ=255) aTCATGGGCACACCGCAGCTGGCGCGAATTCTGCACCCGTTTGTCGGCGTGGTTATGTTTGc  <  1:480856/62‑1 (MQ=255) aTCATGGGCACACCGCAGCTGGCGCGAATTCTGCACCCGTTTGTCGGCGTGGTTATGTTTGc  <  1:500961/62‑1 (MQ=255) aTCATGGGCACACCGCAGCTGGCGCGAATTCTGCACCCGTTTGTCGGCGTGGTTATGTTTGc  <  1:512913/62‑1 (MQ=255) aTCATGGGCACACCGCAGCTGGCGCGAATTCTGCACCCGTTTGTCGGCGTGGTTATGTTTGc  <  1:839932/62‑1 (MQ=255) aTCATGGGCACACCGCAGCTGGCGCGAATTCTGCACCCGTTTGTCGGCGTGGTTATGTTTGc  <  1:904872/62‑1 (MQ=255) aTCATGGGCACACCGCAGCTGGCGCGAATTCTGCACCCGTTTGTCGGCGTGGTTATGTTTGc  <  1:1091369/62‑1 (MQ=255) aTCATGGGCACACCGCAGCTGGCGCGAATTCTGCACCCGTTTGTCGGCGTGGTTATGTTTGc  <  1:2460185/62‑1 (MQ=255) aTCATGGGCACACCGCAGCTGGCGCGAATTCTGCACCCGTTTGTCGGCGTGGTTATGTTTGc  <  1:2400251/62‑1 (MQ=255) aTCATGGGCACACCGCAGCTGGCGCGAATTCTGCACCCGTTTGTCGGCGTGGTTATGTTTGc  <  1:2320961/62‑1 (MQ=255) aTCATGGGCACACCGCAGCTGGCGCGAATTCTGCACCCGTTTGTCGGCGTGGTTATGTTTGc  <  1:2315591/62‑1 (MQ=255) aTCATGGGCACACCGCAGCTGGCGCGAATTCTGCACCCGTTTGTCGGCGTGGTTATGTTTGc  <  1:200267/62‑1 (MQ=255) aTCATGGGCACACCGCAGCTGGCGCGAATTCTGCACCCGTTTGTCGGCGTGGTTATGTTTGc  <  1:1999809/62‑1 (MQ=255) aTCATGGGCACACCGCAGCTGGCGCGAATTCTGCACCCGTTTGTCGGCGTGGTTATGTTTGc  <  1:1975760/62‑1 (MQ=255) aTCATGGGCACACCGCAGCTGGCGCGAATTCTGCACCCGTTTGTCGGCGTGGTTATGTTTGc  <  1:1831476/62‑1 (MQ=255) aTCATGGGCACACCGCAGCTGGCGCGAATTCTGCACCCGTTTGTCGGCGTGGTTATGTTTGc  <  1:1791741/62‑1 (MQ=255) aTCATGGGCACACCGCAGCTGGCGCGAATTCTGCACCCGTTTGTCGGCGTGGTTATGTTTGc  <  1:1560511/62‑1 (MQ=255) aTCATGGGCACACCGCAGCTGGCGCGAATTCTGCACCCGTTTGTCGGCGTGGTTATGTTTGc  <  1:1354937/62‑1 (MQ=255) aTCATGGGCACACCGCAGCTGGCGCGAATTCTGCACCCGTTTGTCGGCGTGGTTATGTTTGc  <  1:1222836/62‑1 (MQ=255) aTCATGGGCACACCGCAGCTGGCGCGAATTCTGCACCCGTTTGTCGGCGTGGTTATGTTTGc  <  1:1107416/62‑1 (MQ=255) aTCATGGGCACACCGCAGCTGGCGCGAATTCTGCACCCGTTTGGCGGCGTGGTTATGTTTGc  <  1:3480706/62‑1 (MQ=255)               gCAGCTGGCGCGAATTCTGCACCCGTTTGTCGGCGTGGTTATGTTTGc  <  1:2212086/48‑1 (MQ=255)                                                              | ATCATGGGCACACCGCAGCTGGCGCGAATTCTGCACCCGTTTGTCGGCGTGGTTATGTTTGC  >  minE/2336649‑2336710

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑