Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2343647	2343697	51	27 [0]	[0] 6	glnG	fused DNA‑binding response regulator in two‑component regulatory system with GlnL, nitrogen regulator I (NRI)

ATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGTTTGATTATCTGCCCAAA  >  minE/2343585‑2343646                                                              | aTTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGTTTGATTATCTGCCCaaa  >  1:3276103/1‑62 (MQ=255) aTTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGTTTGATTATCTGCCCaaa  >  1:924000/1‑62 (MQ=255) aTTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGTTTGATTATCTGCCCaaa  >  1:908044/1‑62 (MQ=255) aTTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGTTTGATTATCTGCCCaaa  >  1:774568/1‑62 (MQ=255) aTTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGTTTGATTATCTGCCCaaa  >  1:687918/1‑62 (MQ=255) aTTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGTTTGATTATCTGCCCaaa  >  1:608876/1‑62 (MQ=255) aTTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGTTTGATTATCTGCCCaaa  >  1:601017/1‑62 (MQ=255) aTTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGTTTGATTATCTGCCCaaa  >  1:600325/1‑62 (MQ=255) aTTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGTTTGATTATCTGCCCaaa  >  1:476094/1‑62 (MQ=255) aTTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGTTTGATTATCTGCCCaaa  >  1:3605065/1‑62 (MQ=255) aTTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGTTTGATTATCTGCCCaaa  >  1:3551256/1‑62 (MQ=255) aTTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGTTTGATTATCTGCCCaaa  >  1:350877/1‑62 (MQ=255) aTTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGTTTGATTATCTGCCCaaa  >  1:3472127/1‑62 (MQ=255) aTTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGTTTGATTATCTGCCCaaa  >  1:3455659/1‑62 (MQ=255) aTTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGTTTGATTATCTGCCCaaa  >  1:114544/1‑62 (MQ=255) aTTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGTTTGATTATCTGCCCaaa  >  1:3158262/1‑62 (MQ=255) aTTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGTTTGATTATCTGCCCaaa  >  1:2722043/1‑62 (MQ=255) aTTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGTTTGATTATCTGCCCaaa  >  1:2716002/1‑62 (MQ=255) aTTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGTTTGATTATCTGCCCaaa  >  1:2247709/1‑62 (MQ=255) aTTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGTTTGATTATCTGCCCaaa  >  1:2170510/1‑62 (MQ=255) aTTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGTTTGATTATCTGCCCaaa  >  1:1932123/1‑62 (MQ=255) aTTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGTTTGATTATCTGCCCaaa  >  1:1929347/1‑62 (MQ=255) aTTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGTTTGATTATCTGCCCaaa  >  1:1895819/1‑62 (MQ=255) aTTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGTTTGATTATCTGCCCaaa  >  1:174124/1‑62 (MQ=255) aTTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGTTTGATTATCTGCCCaaa  >  1:1389603/1‑62 (MQ=255) aTTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGTTTGATTATCTGCCCaaa  >  1:1191695/1‑62 (MQ=255) aTTCCGATCCGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGTTTGATTATCTGCCCaaa  >  1:3138046/1‑62 (MQ=255)                                                              | ATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGTTTGATTATCTGCCCAAA  >  minE/2343585‑2343646

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑