Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2347059	2347104	46	82 [0]	[0] 47	yihI	conserved hypothetical protein

TTTCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAGGGG  >  minE/2346997‑2347058                                                              | tttCTTACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:2703361/62‑1 (MQ=255) tttCTCGCTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:1255799/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTTGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:1476980/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:2466902/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:3011698/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:2978278/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:2844790/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:2832100/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:2728816/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:2543529/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:2528898/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:2480391/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:3033392/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:2439962/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:2412601/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:2335390/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:2311338/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:2254864/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:2214249/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:220383/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:1087999/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:3375732/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:936848/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:883346/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:75321/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:675542/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:674506/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:520764/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:427023/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:3449839/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:3398798/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:2167287/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:3370364/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:3367723/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:3229757/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:3180081/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:3163315/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:3145331/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:3062602/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:3036300/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:1295936/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:2111030/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:1463629/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:1448667/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:1439085/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:143818/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:1426913/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:1381739/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:1366198/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:1316768/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:1501198/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:1294707/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:1281671/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:1270867/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:1245297/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:121250/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:1202023/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:1179620/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:1127870/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:1115469/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:1537961/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:1506213/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:1588426/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:1604545/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:1992572/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:1705964/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:1737488/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:1742863/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:174342/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:1938167/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:1812838/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGGGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:1951512/62‑1 (MQ=255) tttCTCACTCTTCGGTTTGAGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:3370004/62‑1 (MQ=255) gttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:1290580/61‑1 (MQ=255)  ttCTCACTCTTCGGTTTTTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:2339869/61‑1 (MQ=255)  ttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACTCCCAATGGAATAgggg  <  1:2093843/61‑1 (MQ=255)  ttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:2339762/61‑1 (MQ=255)  ttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:1831349/61‑1 (MQ=255)  ttCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:2347222/61‑1 (MQ=255)   tctctctcTTCGGTTTGTGCTGGTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:1753778/60‑1 (MQ=255)         tctTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:1681420/54‑1 (MQ=255)             cGGTTTGTGCTGTTTGGGGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAgggg  <  1:1578317/50‑1 (MQ=255)                                                              | TTTCTCACTCTTCGGTTTGTGCTGTTTGGTGACTTTTTCAGTCACGCCCAATGGAATAGGGG  >  minE/2346997‑2347058

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑