Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	2361577–2363089	2363453	365–1877	18 [0]	[0] 18	[rrsA]	[rrsA]

CACTTCAAAGAACGCTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGTT  >  minE/2361516‑2361576                                                             | cACTTCAAAGAACGCTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGtt  <  1:3000520/61‑1 (MQ=35) cACTTCAAAGAACGCTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGtt  <  1:978065/61‑1 (MQ=35) cACTTCAAAGAACGCTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGtt  <  1:806592/61‑1 (MQ=35) cACTTCAAAGAACGCTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGtt  <  1:737222/61‑1 (MQ=35) cACTTCAAAGAACGCTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGtt  <  1:373515/61‑1 (MQ=35) cACTTCAAAGAACGCTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGtt  <  1:3584358/61‑1 (MQ=35) cACTTCAAAGAACGCTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGtt  <  1:3548960/61‑1 (MQ=35) cACTTCAAAGAACGCTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGtt  <  1:3469344/61‑1 (MQ=35) cACTTCAAAGAACGCTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGtt  <  1:1711313/61‑1 (MQ=35) cACTTCAAAGAACGCTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGtt  <  1:2760178/61‑1 (MQ=35) cACTTCAAAGAACGCTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGtt  <  1:269245/61‑1 (MQ=35) cACTTCAAAGAACGCTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGtt  <  1:2667534/61‑1 (MQ=35) cACTTCAAAGAACGCTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGtt  <  1:2617006/61‑1 (MQ=35) cACTTCAAAGAACGCTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGtt  <  1:2606461/61‑1 (MQ=35) cACTTCAAAGAACGCTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGtt  <  1:2329400/61‑1 (MQ=35) cACTTCAAAGAACGCTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGtt  <  1:2013614/61‑1 (MQ=35) cACTTCAAAGAACGCTTCTTTAAGGTAAGGAGGGGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGtt  <  1:3053994/61‑1 (MQ=25) cACTTCAAAGAACACTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGtt  <  1:1939442/61‑1 (MQ=25)                                                             | CACTTCAAAGAACGCTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGTT  >  minE/2361516‑2361576

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑