Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2379888	2379898	11	37 [0]	[0] 33	rmuC	predicted recombination limiting protein

TACCCGGCTTAACTACTCCCAATGGGCTAGCGCGACTGCTGATTATATTCATCATCGCGTT  >  minE/2379827‑2379887                                                             | tACCCGGCTTAACTACTCCCAATGGGCTAGCGCGACTGCTGATTATATTCATCATTGCGtt  <  1:585687/61‑1 (MQ=255) tACCCGGCTTAACTACTCCCAATGGGCTAGCGCGACTGCTGATTATATTCATCATCGCGtt  <  1:3377321/61‑1 (MQ=255) tACCCGGCTTAACTACTCCCAATGGGCTAGCGCGACTGCTGATTATATTCATCATCGCGtt  <  1:3056765/61‑1 (MQ=255) tACCCGGCTTAACTACTCCCAATGGGCTAGCGCGACTGCTGATTATATTCATCATCGCGtt  <  1:3115761/61‑1 (MQ=255) tACCCGGCTTAACTACTCCCAATGGGCTAGCGCGACTGCTGATTATATTCATCATCGCGtt  <  1:3139164/61‑1 (MQ=255) tACCCGGCTTAACTACTCCCAATGGGCTAGCGCGACTGCTGATTATATTCATCATCGCGtt  <  1:3164521/61‑1 (MQ=255) tACCCGGCTTAACTACTCCCAATGGGCTAGCGCGACTGCTGATTATATTCATCATCGCGtt  <  1:3248811/61‑1 (MQ=255) tACCCGGCTTAACTACTCCCAATGGGCTAGCGCGACTGCTGATTATATTCATCATCGCGtt  <  1:3261952/61‑1 (MQ=255) tACCCGGCTTAACTACTCCCAATGGGCTAGCGCGACTGCTGATTATATTCATCATCGCGtt  <  1:3350889/61‑1 (MQ=255) tACCCGGCTTAACTACTCCCAATGGGCTAGCGCGACTGCTGATTATATTCATCATCGCGtt  <  1:3375772/61‑1 (MQ=255) tACCCGGCTTAACTACTCCCAATGGGCTAGCGCGACTGCTGATTATATTCATCATCGCGtt  <  1:3009940/61‑1 (MQ=255) tACCCGGCTTAACTACTCCCAATGGGCTAGCGCGACTGCTGATTATATTCATCATCGCGtt  <  1:3440697/61‑1 (MQ=255) tACCCGGCTTAACTACTCCCAATGGGCTAGCGCGACTGCTGATTATATTCATCATCGCGtt  <  1:3448739/61‑1 (MQ=255) tACCCGGCTTAACTACTCCCAATGGGCTAGCGCGACTGCTGATTATATTCATCATCGCGtt  <  1:3644253/61‑1 (MQ=255) tACCCGGCTTAACTACTCCCAATGGGCTAGCGCGACTGCTGATTATATTCATCATCGCGtt  <  1:766226/61‑1 (MQ=255) tACCCGGCTTAACTACTCCCAATGGGCTAGCGCGACTGCTGATTATATTCATCATCGCGtt  <  1:821731/61‑1 (MQ=255) tACCCGGCTTAACTACTCCCAATGGGCTAGCGCGACTGCTGATTATATTCATCATCGCGtt  <  1:935663/61‑1 (MQ=255) tACCCGGCTTAACTACTCCCAATGGGCTAGCGCGACTGCTGATTATATTCATCATCGCGtt  <  1:970246/61‑1 (MQ=255) tACCCGGCTTAACTACTCCCAATGGGCTAGCGCGACTGCTGATTATATTCATCATCGCGtt  <  1:2154055/61‑1 (MQ=255) tACCCGGCTTAACTACTCCCAATGGGCTAGCGCGACTGCTGATTATATTCATCATCGCGtt  <  1:1126235/61‑1 (MQ=255) tACCCGGCTTAACTACTCCCAATGGGCTAGCGCGACTGCTGATTATATTCATCATCGCGtt  <  1:1301900/61‑1 (MQ=255) tACCCGGCTTAACTACTCCCAATGGGCTAGCGCGACTGCTGATTATATTCATCATCGCGtt  <  1:1353145/61‑1 (MQ=255) tACCCGGCTTAACTACTCCCAATGGGCTAGCGCGACTGCTGATTATATTCATCATCGCGtt  <  1:1450356/61‑1 (MQ=255) tACCCGGCTTAACTACTCCCAATGGGCTAGCGCGACTGCTGATTATATTCATCATCGCGtt  <  1:1565498/61‑1 (MQ=255) tACCCGGCTTAACTACTCCCAATGGGCTAGCGCGACTGCTGATTATATTCATCATCGCGtt  <  1:1811758/61‑1 (MQ=255) tACCCGGCTTAACTACTCCCAATGGGCTAGCGCGACTGCTGATTATATTCATCATCGCGtt  <  1:206214/61‑1 (MQ=255) tACCCGGCTTAACTACTCCCAATGGGCTAGCGCGACTGCTGATTATATTCATCATCGCGtt  <  1:1111701/61‑1 (MQ=255) tACCCGGCTTAACTACTCCCAATGGGCTAGCGCGACTGCTGATTATATTCATCATCGCGtt  <  1:2259194/61‑1 (MQ=255) tACCCGGCTTAACTACTCCCAATGGGCTAGCGCGACTGCTGATTATATTCATCATCGCGtt  <  1:2459353/61‑1 (MQ=255) tACCCGGCTTAACTACTCCCAATGGGCTAGCGCGACTGCTGATTATATTCATCATCGCGtt  <  1:2502487/61‑1 (MQ=255) tACCCGGCTTAACTACTCCCAATGGGCTAGCGCGACTGCTGATTATATTCATCATCGCGtt  <  1:2554368/61‑1 (MQ=255) tACCCGGCTTAACTACTCCCAATGGGCTAGCGCGACTGCTGATTATATTCATCATCGCGtt  <  1:2803448/61‑1 (MQ=255) tACCCGGCTTAACTACTCCCAATGGGCTAGCGCGACTGCTGATTATATTCATCATCGCGtt  <  1:2988581/61‑1 (MQ=255)  aCCCGGCTTAACTACTCCCAATGGGCTAGCGCGACTGCTGATTATATTCATCATCGCGtt  <  1:2972445/60‑1 (MQ=255)         ttAACTACTCCCAATGGGCTAGCGCGACTGCTGATTATATTCATCATCGCGtt  <  1:117173/53‑1 (MQ=255)                    cAATGGGCTAGCGCGACTGCTGATTATATTCATCATCGCGtt  <  1:3030067/42‑1 (MQ=255)                     aaTGGGCTAGCGCGACTGCTGATTATATTCATCATCGCGtt  <  1:1819721/41‑1 (MQ=255)                                                             | TACCCGGCTTAACTACTCCCAATGGGCTAGCGCGACTGCTGATTATATTCATCATCGCGTT  >  minE/2379827‑2379887

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑