Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2394177	2394220	44	62 [0]	[0] 13	yigI	conserved hypothetical protein

CGCCGGTCTGGTGTGCGTGGGAAGTACCTTAACCCGCCACGAAACCATC  >  minE/2394128‑2394176                                                 | ctccgGTCTGGTGTGCGTGGGAAGTACCTTAACCCGCCACGAAACCATc  <  1:3646574/47‑1 (MQ=255) cgccgGTCTGGTGTGCGTGGGAAGTACCTTAACCCGCCACGAAACCATc  <  1:381072/49‑1 (MQ=255) cgccgGTCTGGTGTGCGTGGGAAGTACCTTAACCCGCCACGAAACCATc  <  1:2718138/49‑1 (MQ=255) cgccgGTCTGGTGTGCGTGGGAAGTACCTTAACCCGCCACGAAACCATc  <  1:1112405/49‑1 (MQ=255) cgccgGTCTGGTGTGCGTGGGAAGTACCTTAACCCGCCACGAAACCATc  <  1:2828051/49‑1 (MQ=255) cgccgGTCTGGTGTGCGTGGGAAGTACCTTAACCCGCCACGAAACCATc  <  1:2955027/49‑1 (MQ=255) cgccgGTCTGGTGTGCGTGGGAAGTACCTTAACCCGCCACGAAACCATc  <  1:2978060/49‑1 (MQ=255) cgccgGTCTGGTGTGCGTGGGAAGTACCTTAACCCGCCACGAAACCATc  <  1:3075234/49‑1 (MQ=255) cgccgGTCTGGTGTGCGTGGGAAGTACCTTAACCCGCCACGAAACCATc  <  1:3187192/49‑1 (MQ=255) cgccgGTCTGGTGTGCGTGGGAAGTACCTTAACCCGCCACGAAACCATc  <  1:3367274/49‑1 (MQ=255) cgccgGTCTGGTGTGCGTGGGAAGTACCTTAACCCGCCACGAAACCATc  <  1:3455045/49‑1 (MQ=255) cgccgGTCTGGTGTGCGTGGGAAGTACCTTAACCCGCCACGAAACCATc  <  1:3456754/49‑1 (MQ=255) cgccgGTCTGGTGTGCGTGGGAAGTACCTTAACCCGCCACGAAACCATc  <  1:3535618/49‑1 (MQ=255) cgccgGTCTGGTGTGCGTGGGAAGTACCTTAACCCGCCACGAAACCATc  <  1:3647307/49‑1 (MQ=255) cgccgGTCTGGTGTGCGTGGGAAGTACCTTAACCCGCCACGAAACCATc  <  1:369112/49‑1 (MQ=255) cgccgGTCTGGTGTGCGTGGGAAGTACCTTAACCCGCCACGAAACCATc  <  1:2800708/49‑1 (MQ=255) cgccgGTCTGGTGTGCGTGGGAAGTACCTTAACCCGCCACGAAACCATc  <  1:402440/49‑1 (MQ=255) cgccgGTCTGGTGTGCGTGGGAAGTACCTTAACCCGCCACGAAACCATc  <  1:420028/49‑1 (MQ=255) cgccgGTCTGGTGTGCGTGGGAAGTACCTTAACCCGCCACGAAACCATc  <  1:539170/49‑1 (MQ=255) cgccgGTCTGGTGTGCGTGGGAAGTACCTTAACCCGCCACGAAACCATc  <  1:542441/49‑1 (MQ=255) cgccgGTCTGGTGTGCGTGGGAAGTACCTTAACCCGCCACGAAACCATc  <  1:551005/49‑1 (MQ=255) cgccgGTCTGGTGTGCGTGGGAAGTACCTTAACCCGCCACGAAACCATc  <  1:573460/49‑1 (MQ=255) cgccgGTCTGGTGTGCGTGGGAAGTACCTTAACCCGCCACGAAACCATc  <  1:668863/49‑1 (MQ=255) cgccgGTCTGGTGTGCGTGGGAAGTACCTTAACCCGCCACGAAACCATc  <  1:671194/49‑1 (MQ=255) cgccgGTCTGGTGTGCGTGGGAAGTACCTTAACCCGCCACGAAACCATc  <  1:673952/49‑1 (MQ=255) cgccgGTCTGGTGTGCGTGGGAAGTACCTTAACCCGCCACGAAACCATc  <  1:742820/49‑1 (MQ=255) cgccgGTCTGGTGTGCGTGGGAAGTACCTTAACCCGCCACGAAACCATc  <  1:764910/49‑1 (MQ=255) cgccgGTCTGGTGTGCGTGGGAAGTACCTTAACCCGCCACGAAACCATc  <  1:77404/49‑1 (MQ=255) cgccgGTCTGGTGTGCGTGGGAAGTACCTTAACCCGCCACGAAACCATc  <  1:957991/49‑1 (MQ=255) cgccgGTCTGGTGTGCGTGGGAAGTACCTTAACCCGCCACGAAACCATc  <  1:997832/49‑1 (MQ=255) cgccgGTCTGGTGTGCGTGGGAAGTACCTTAACCCGCCACGAAACCATc  <  1:2067269/49‑1 (MQ=255) cgccgGTCTGGTGTGCGTGGGAAGTACCTTAACCCGCCACGAAACCATc  <  1:1171726/49‑1 (MQ=255) cgccgGTCTGGTGTGCGTGGGAAGTACCTTAACCCGCCACGAAACCATc  <  1:1172305/49‑1 (MQ=255) cgccgGTCTGGTGTGCGTGGGAAGTACCTTAACCCGCCACGAAACCATc  <  1:1243919/49‑1 (MQ=255) cgccgGTCTGGTGTGCGTGGGAAGTACCTTAACCCGCCACGAAACCATc  <  1:1536912/49‑1 (MQ=255) cgccgGTCTGGTGTGCGTGGGAAGTACCTTAACCCGCCACGAAACCATc  <  1:1550489/49‑1 (MQ=255) cgccgGTCTGGTGTGCGTGGGAAGTACCTTAACCCGCCACGAAACCATc  <  1:1557757/49‑1 (MQ=255) cgccgGTCTGGTGTGCGTGGGAAGTACCTTAACCCGCCACGAAACCATc  <  1:159080/49‑1 (MQ=255) cgccgGTCTGGTGTGCGTGGGAAGTACCTTAACCCGCCACGAAACCATc  <  1:1721759/49‑1 (MQ=255) cgccgGTCTGGTGTGCGTGGGAAGTACCTTAACCCGCCACGAAACCATc  <  1:1724251/49‑1 (MQ=255) cgccgGTCTGGTGTGCGTGGGAAGTACCTTAACCCGCCACGAAACCATc  <  1:1740295/49‑1 (MQ=255) cgccgGTCTGGTGTGCGTGGGAAGTACCTTAACCCGCCACGAAACCATc  <  1:1905542/49‑1 (MQ=255) cgccgGTCTGGTGTGCGTGGGAAGTACCTTAACCCGCCACGAAACCATc  <  1:1914864/49‑1 (MQ=255) cgccgGTCTGGTGTGCGTGGGAAGTACCTTAACCCGCCACGAAACCATc  <  1:1980793/49‑1 (MQ=255) cgccgGTCTGGTGTGCGTGGGAAGTACCTTAACCCGCCACGAAACCATc  <  1:2059636/49‑1 (MQ=255) cgccgGTCTGGTGTGCGTGGGAAGTACCTTAACCCGCCACGAAACCATc  <  1:2711818/49‑1 (MQ=255) cgccgGTCTGGTGTGCGTGGGAAGTACCTTAACCCGCCACGAAACCATc  <  1:2094798/49‑1 (MQ=255) cgccgGTCTGGTGTGCGTGGGAAGTACCTTAACCCGCCACGAAACCATc  <  1:2177233/49‑1 (MQ=255) cgccgGTCTGGTGTGCGTGGGAAGTACCTTAACCCGCCACGAAACCATc  <  1:2240046/49‑1 (MQ=255) cgccgGTCTGGTGTGCGTGGGAAGTACCTTAACCCGCCACGAAACCATc  <  1:2283269/49‑1 (MQ=255) cgccgGTCTGGTGTGCGTGGGAAGTACCTTAACCCGCCACGAAACCATc  <  1:2377258/49‑1 (MQ=255) cgccgGTCTGGTGTGCGTGGGAAGTACCTTAACCCGCCACGAAACCATc  <  1:2388149/49‑1 (MQ=255) cgccgGTCTGGTGTGCGTGGGAAGTACCTTAACCCGCCACGAAACCATc  <  1:23993/49‑1 (MQ=255) cgccgGTCTGGTGTGCGTGGGAAGTACCTTAACCCGCCACGAAACCATc  <  1:2564232/49‑1 (MQ=255) cgccgGTCTGGTGTGCGTGGGAAGTACCTTAACCCGCCACGAAACCATc  <  1:2641334/49‑1 (MQ=255) cgccgGTCTGGTGTGCGTGGGAAGTACCTTAACCCGCCACGAAACCATc  <  1:2694286/49‑1 (MQ=255) cgccgGTCTGGTGTGCGTGGGAAGTACCTTAACCCGCCACGAAACAATc  <  1:2122485/49‑1 (MQ=255) cgccgGTCTGGTGTGCGTGGGAAGTACCTTAACCCCCCACGAAACCATc  <  1:368545/49‑1 (MQ=255)  tccgGTCTGGTGTGCGTGGGTAGTACCTTTACCCGCCACGAAACCATc  <  1:637154/47‑1 (MQ=255)  gccgGTCTGGTGTGCGTGGGAAGTACCTTAACCCGCCACGAAACCATc  <  1:2330304/48‑1 (MQ=255)         tGGTGTGCGTGGGAAGTACCTTAACCCGCCACGAAACCATc  <  1:2872603/41‑1 (MQ=255)              tgCGTGGGAAGTACCTTAACCCGCCACGAAACCATc  <  1:2623123/36‑1 (MQ=255)                                                 | CGCCGGTCTGGTGTGCGTGGGAAGTACCTTAACCCGCCACGAAACCATC  >  minE/2394128‑2394176

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑