Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2405475	2405530	56	50 [0]	[0] 31	cyaA	adenylate cyclase

GAAACGCGCAGCGCCTTGAAACGCCCGGTTTCCTGGCGGGTGCTGGAAAGACGCAATTC  >  minE/2405416‑2405474                                                           | gAAACGCGCAGCGCCTTGAAACGCCCGGTTTCGTGGCGGGTGCTGGAAAGACGCAATTc  >  1:2381619/1‑59 (MQ=255) gAAACGCGCAGCGCCTTGAAACGCCCGGTTTCCTGGCGGGTGCTGGAAAGACGCAATTc  >  1:3569004/1‑59 (MQ=255) gAAACGCGCAGCGCCTTGAAACGCCCGGTTTCCTGGCGGGTGCTGGAAAGACGCAATTc  >  1:2836940/1‑59 (MQ=255) gAAACGCGCAGCGCCTTGAAACGCCCGGTTTCCTGGCGGGTGCTGGAAAGACGCAATTc  >  1:3152012/1‑59 (MQ=255) gAAACGCGCAGCGCCTTGAAACGCCCGGTTTCCTGGCGGGTGCTGGAAAGACGCAATTc  >  1:3156076/1‑59 (MQ=255) gAAACGCGCAGCGCCTTGAAACGCCCGGTTTCCTGGCGGGTGCTGGAAAGACGCAATTc  >  1:3156838/1‑59 (MQ=255) gAAACGCGCAGCGCCTTGAAACGCCCGGTTTCCTGGCGGGTGCTGGAAAGACGCAATTc  >  1:3193714/1‑59 (MQ=255) gAAACGCGCAGCGCCTTGAAACGCCCGGTTTCCTGGCGGGTGCTGGAAAGACGCAATTc  >  1:3209450/1‑59 (MQ=255) gAAACGCGCAGCGCCTTGAAACGCCCGGTTTCCTGGCGGGTGCTGGAAAGACGCAATTc  >  1:3280270/1‑59 (MQ=255) gAAACGCGCAGCGCCTTGAAACGCCCGGTTTCCTGGCGGGTGCTGGAAAGACGCAATTc  >  1:3388400/1‑59 (MQ=255) gAAACGCGCAGCGCCTTGAAACGCCCGGTTTCCTGGCGGGTGCTGGAAAGACGCAATTc  >  1:3485007/1‑59 (MQ=255) gAAACGCGCAGCGCCTTGAAACGCCCGGTTTCCTGGCGGGTGCTGGAAAGACGCAATTc  >  1:3485158/1‑59 (MQ=255) gAAACGCGCAGCGCCTTGAAACGCCCGGTTTCCTGGCGGGTGCTGGAAAGACGCAATTc  >  1:3551530/1‑59 (MQ=255) gAAACGCGCAGCGCCTTGAAACGCCCGGTTTCCTGGCGGGTGCTGGAAAGACGCAATTc  >  1:2768909/1‑59 (MQ=255) gAAACGCGCAGCGCCTTGAAACGCCCGGTTTCCTGGCGGGTGCTGGAAAGACGCAATTc  >  1:3593941/1‑59 (MQ=255) gAAACGCGCAGCGCCTTGAAACGCCCGGTTTCCTGGCGGGTGCTGGAAAGACGCAATTc  >  1:3617839/1‑59 (MQ=255) gAAACGCGCAGCGCCTTGAAACGCCCGGTTTCCTGGCGGGTGCTGGAAAGACGCAATTc  >  1:52115/1‑59 (MQ=255) gAAACGCGCAGCGCCTTGAAACGCCCGGTTTCCTGGCGGGTGCTGGAAAGACGCAATTc  >  1:556031/1‑59 (MQ=255) gAAACGCGCAGCGCCTTGAAACGCCCGGTTTCCTGGCGGGTGCTGGAAAGACGCAATTc  >  1:716067/1‑59 (MQ=255) gAAACGCGCAGCGCCTTGAAACGCCCGGTTTCCTGGCGGGTGCTGGAAAGACGCAATTc  >  1:720377/1‑59 (MQ=255) gAAACGCGCAGCGCCTTGAAACGCCCGGTTTCCTGGCGGGTGCTGGAAAGACGCAATTc  >  1:782048/1‑59 (MQ=255) gAAACGCGCAGCGCCTTGAAACGCCCGGTTTCCTGGCGGGTGCTGGAAAGACGCAATTc  >  1:842187/1‑59 (MQ=255) gAAACGCGCAGCGCCTTGAAACGCCCGGTTTCCTGGCGGGTGCTGGAAAGACGCAATTc  >  1:867933/1‑59 (MQ=255) gAAACGCGCAGCGCCTTGAAACGCCCGGTTTCCTGGCGGGTGCTGGAAAGACGCAATTc  >  1:970760/1‑59 (MQ=255) gAAACGCGCAGCGCCTTGAAACGCCCGGTTTCCTGGCGGGTGCTGGAAAGACGCAATTc  >  1:98831/1‑59 (MQ=255) gAAACGCGCAGCGCCTTGAAACGCCCGGTTTCCTGGCGGGTGCTGGAAAGACGCAATTc  >  1:994863/1‑59 (MQ=255) gAAACGCGCAGCGCCTTGAAACGCCCGGTTTCCTGGCGGGTGCTGGAAAGACGCAATTc  >  1:2012896/1‑59 (MQ=255) gAAACGCGCAGCGCCTTGAAACGCCCGGTTTCCTGGCGGGTGCTGGAAAGACGCAATTc  >  1:1054379/1‑59 (MQ=255) gAAACGCGCAGCGCCTTGAAACGCCCGGTTTCCTGGCGGGTGCTGGAAAGACGCAATTc  >  1:1111499/1‑59 (MQ=255) gAAACGCGCAGCGCCTTGAAACGCCCGGTTTCCTGGCGGGTGCTGGAAAGACGCAATTc  >  1:1135689/1‑59 (MQ=255) gAAACGCGCAGCGCCTTGAAACGCCCGGTTTCCTGGCGGGTGCTGGAAAGACGCAATTc  >  1:1178803/1‑59 (MQ=255) gAAACGCGCAGCGCCTTGAAACGCCCGGTTTCCTGGCGGGTGCTGGAAAGACGCAATTc  >  1:124336/1‑59 (MQ=255) gAAACGCGCAGCGCCTTGAAACGCCCGGTTTCCTGGCGGGTGCTGGAAAGACGCAATTc  >  1:1244416/1‑59 (MQ=255) gAAACGCGCAGCGCCTTGAAACGCCCGGTTTCCTGGCGGGTGCTGGAAAGACGCAATTc  >  1:1469510/1‑59 (MQ=255) gAAACGCGCAGCGCCTTGAAACGCCCGGTTTCCTGGCGGGTGCTGGAAAGACGCAATTc  >  1:149743/1‑59 (MQ=255) gAAACGCGCAGCGCCTTGAAACGCCCGGTTTCCTGGCGGGTGCTGGAAAGACGCAATTc  >  1:155798/1‑59 (MQ=255) gAAACGCGCAGCGCCTTGAAACGCCCGGTTTCCTGGCGGGTGCTGGAAAGACGCAATTc  >  1:1879794/1‑59 (MQ=255) gAAACGCGCAGCGCCTTGAAACGCCCGGTTTCCTGGCGGGTGCTGGAAAGACGCAATTc  >  1:1945975/1‑59 (MQ=255) gAAACGCGCAGCGCCTTGAAACGCCCGGTTTCCTGGCGGGTGCTGGAAAGACGCAATTc  >  1:1017796/1‑59 (MQ=255) gAAACGCGCAGCGCCTTGAAACGCCCGGTTTCCTGGCGGGTGCTGGAAAGACGCAATTc  >  1:2047394/1‑59 (MQ=255) gAAACGCGCAGCGCCTTGAAACGCCCGGTTTCCTGGCGGGTGCTGGAAAGACGCAATTc  >  1:2050637/1‑59 (MQ=255) gAAACGCGCAGCGCCTTGAAACGCCCGGTTTCCTGGCGGGTGCTGGAAAGACGCAATTc  >  1:2055376/1‑59 (MQ=255) gAAACGCGCAGCGCCTTGAAACGCCCGGTTTCCTGGCGGGTGCTGGAAAGACGCAATTc  >  1:2060496/1‑59 (MQ=255) gAAACGCGCAGCGCCTTGAAACGCCCGGTTTCCTGGCGGGTGCTGGAAAGACGCAATTc  >  1:2256423/1‑59 (MQ=255) gAAACGCGCAGCGCCTTGAAACGCCCGGTTTCCTGGCGGGTGCTGGAAAGACGCAATTc  >  1:2296774/1‑59 (MQ=255) gAAACGCGCAGCGCCTTGAAACGCCCGGTTTCCTGGCGGGTGCTGGAAAGACGCAATTc  >  1:2479888/1‑59 (MQ=255) gAAACGCGCAGCGCCTTGAAACGCCCGGTTTCCTGGCGGGTGCTGGAAAGACGCAATTc  >  1:2573987/1‑59 (MQ=255) gAAACGCGCAGCGCCTTGAAACGCCCGGTTTCCTGGCGGGTGCTGGAAAGACGCAATTc  >  1:2595238/1‑59 (MQ=255) gAAACGCGCAGCGCCTTGAAACGCCCGGTTTCCTGGCGGGTGCTGGAAAGACGCAATTc  >  1:2621509/1‑59 (MQ=255) gAAACGCGCAGCGCCTTGAAACGCCCGGTTTCCTGGCGGGTGCTGGAAAGACGCAATTc  >  1:2643384/1‑59 (MQ=255)                                                           | GAAACGCGCAGCGCCTTGAAACGCCCGGTTTCCTGGCGGGTGCTGGAAAGACGCAATTC  >  minE/2405416‑2405474

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑