Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 2431167 2431194 28 76 [0] [0] 62 rho transcription termination factor

CGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGT  >  minE/2431129‑2431166
                                     |
cGGGAAGTCGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:1819820/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCATCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:1671836/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:3037891/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:3471524/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:3450597/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:3419954/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:3400709/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:332367/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:3285641/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:3129865/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:3103343/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:3583000/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:3033129/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:3026559/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:2976975/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:2958288/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:2909570/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:2770623/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:2767057/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:100787/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:643368/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:951630/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:940469/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:936918/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:916819/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:905245/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:837802/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:807629/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:781885/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:3564772/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:616008/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:614773/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:583363/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:546268/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:486367/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:451739/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:402494/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:275495/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:168081/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:2701153/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:1956138/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:1858365/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:1816028/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:1781023/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:1779393/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:1708492/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:1705832/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:2014543/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:164825/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:1641562/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:1627619/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:1625603/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:138452/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:1182161/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:1145382/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:109525/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:222395/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:2671357/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:2652916/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:2629147/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:2616260/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:2540256/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:2486849/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:2435336/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:2411272/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:2386665/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:2382399/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:2379348/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:2375100/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:2077121/38‑1 (MQ=255)
cGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGAGCTTACGAGAGAGGt  <  1:1785497/38‑1 (MQ=255)
 gggAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:2419902/37‑1 (MQ=255)
 gggAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:3367238/37‑1 (MQ=255)
 gggAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:437689/37‑1 (MQ=255)
 gggAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:2933662/37‑1 (MQ=255)
 gggAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGt  <  1:2648499/37‑1 (MQ=255)
                                     |
CGGGAAGACGCGTTTTTCAGCGATCTTACGAGAGAGGT  >  minE/2431129‑2431166

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: