Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2432239	2432239	1	50 [0]	[0] 202	rho/rhoL	transcription termination factor/rho operon leader peptide

TTAATTCGGTAAGATTCATAGTGGTGTGAGTTCTTAAACTTGGGGTAAATCTCGAACTTAA  >  minE/2432178‑2432238                                                             | tttaTTCGGTAAGTTTCATAGTGGTGTGAGTTCTTAAACTTGGGGTAAATCTCGAACTTaa  <  1:2129023/58‑1 (MQ=255) ttAATTCGGTAAGATTCATAGTGGTGTGAGTTCTTAAACTTTGGGTAAATCTCGAACTTaa  <  1:2600216/61‑1 (MQ=255) ttAATTCGGTAAGATTCATAGTGGTGTGAGTTCTTAAACTTGGGGTAAATCTCGAACTTaa  <  1:3451679/61‑1 (MQ=255) ttAATTCGGTAAGATTCATAGTGGTGTGAGTTCTTAAACTTGGGGTAAATCTCGAACTTaa  <  1:2672996/61‑1 (MQ=255) ttAATTCGGTAAGATTCATAGTGGTGTGAGTTCTTAAACTTGGGGTAAATCTCGAACTTaa  <  1:2781409/61‑1 (MQ=255) ttAATTCGGTAAGATTCATAGTGGTGTGAGTTCTTAAACTTGGGGTAAATCTCGAACTTaa  <  1:285320/61‑1 (MQ=255) ttAATTCGGTAAGATTCATAGTGGTGTGAGTTCTTAAACTTGGGGTAAATCTCGAACTTaa  <  1:2909791/61‑1 (MQ=255) ttAATTCGGTAAGATTCATAGTGGTGTGAGTTCTTAAACTTGGGGTAAATCTCGAACTTaa  <  1:2973834/61‑1 (MQ=255) ttAATTCGGTAAGATTCATAGTGGTGTGAGTTCTTAAACTTGGGGTAAATCTCGAACTTaa  <  1:302821/61‑1 (MQ=255) ttAATTCGGTAAGATTCATAGTGGTGTGAGTTCTTAAACTTGGGGTAAATCTCGAACTTaa  <  1:316240/61‑1 (MQ=255) ttAATTCGGTAAGATTCATAGTGGTGTGAGTTCTTAAACTTGGGGTAAATCTCGAACTTaa  <  1:3291782/61‑1 (MQ=255) ttAATTCGGTAAGATTCATAGTGGTGTGAGTTCTTAAACTTGGGGTAAATCTCGAACTTaa  <  1:330815/61‑1 (MQ=255) ttAATTCGGTAAGATTCATAGTGGTGTGAGTTCTTAAACTTGGGGTAAATCTCGAACTTaa  <  1:3401811/61‑1 (MQ=255) ttAATTCGGTAAGATTCATAGTGGTGTGAGTTCTTAAACTTGGGGTAAATCTCGAACTTaa  <  1:1140003/61‑1 (MQ=255) ttAATTCGGTAAGATTCATAGTGGTGTGAGTTCTTAAACTTGGGGTAAATCTCGAACTTaa  <  1:3471468/61‑1 (MQ=255) ttAATTCGGTAAGATTCATAGTGGTGTGAGTTCTTAAACTTGGGGTAAATCTCGAACTTaa  <  1:3524412/61‑1 (MQ=255) ttAATTCGGTAAGATTCATAGTGGTGTGAGTTCTTAAACTTGGGGTAAATCTCGAACTTaa  <  1:3555229/61‑1 (MQ=255) ttAATTCGGTAAGATTCATAGTGGTGTGAGTTCTTAAACTTGGGGTAAATCTCGAACTTaa  <  1:386164/61‑1 (MQ=255) ttAATTCGGTAAGATTCATAGTGGTGTGAGTTCTTAAACTTGGGGTAAATCTCGAACTTaa  <  1:523189/61‑1 (MQ=255) ttAATTCGGTAAGATTCATAGTGGTGTGAGTTCTTAAACTTGGGGTAAATCTCGAACTTaa  <  1:580597/61‑1 (MQ=255) ttAATTCGGTAAGATTCATAGTGGTGTGAGTTCTTAAACTTGGGGTAAATCTCGAACTTaa  <  1:892596/61‑1 (MQ=255) ttAATTCGGTAAGATTCATAGTGGTGTGAGTTCTTAAACTTGGGGTAAATCTCGAACTTaa  <  1:927712/61‑1 (MQ=255) ttAATTCGGTAAGATTCATAGTGGTGTGAGTTCTTAAACTTGGGGTAAATCTCGAACTTaa  <  1:935711/61‑1 (MQ=255) ttAATTCGGTAAGATTCATAGTGGTGTGAGTTCTTAAACTTGGGGTAAATCTCGAACTTaa  <  1:938617/61‑1 (MQ=255) ttAATTCGGTAAGATTCATAGTGGTGTGAGTTCTTAAACTTGGGGTAAATCTCGAACTTaa  <  1:971710/61‑1 (MQ=255) ttAATTCGGTAAGATTCATAGTGGTGTGAGTTCTTAAACTTGGGGTAAATCTCGAACTTaa  <  1:1932295/61‑1 (MQ=255) ttAATTCGGTAAGATTCATAGTGGTGTGAGTTCTTAAACTTGGGGTAAATCTCGAACTTaa  <  1:1087878/61‑1 (MQ=255) ttAATTCGGTAAGATTCATAGTGGTGTGAGTTCTTAAACTTGGGGTAAATCTCGAACTTaa  <  1:1162549/61‑1 (MQ=255) ttAATTCGGTAAGATTCATAGTGGTGTGAGTTCTTAAACTTGGGGTAAATCTCGAACTTaa  <  1:1230553/61‑1 (MQ=255) ttAATTCGGTAAGATTCATAGTGGTGTGAGTTCTTAAACTTGGGGTAAATCTCGAACTTaa  <  1:1317600/61‑1 (MQ=255) ttAATTCGGTAAGATTCATAGTGGTGTGAGTTCTTAAACTTGGGGTAAATCTCGAACTTaa  <  1:1380626/61‑1 (MQ=255) ttAATTCGGTAAGATTCATAGTGGTGTGAGTTCTTAAACTTGGGGTAAATCTCGAACTTaa  <  1:1541026/61‑1 (MQ=255) ttAATTCGGTAAGATTCATAGTGGTGTGAGTTCTTAAACTTGGGGTAAATCTCGAACTTaa  <  1:1607692/61‑1 (MQ=255) ttAATTCGGTAAGATTCATAGTGGTGTGAGTTCTTAAACTTGGGGTAAATCTCGAACTTaa  <  1:1657613/61‑1 (MQ=255) ttAATTCGGTAAGATTCATAGTGGTGTGAGTTCTTAAACTTGGGGTAAATCTCGAACTTaa  <  1:1823482/61‑1 (MQ=255) ttAATTCGGTAAGATTCATAGTGGTGTGAGTTCTTAAACTTGGGGTAAATCTCGAACTTaa  <  1:1847256/61‑1 (MQ=255) ttAATTCGGTAAGATTCATAGTGGTGTGAGTTCTTAAACTTGGGGTAAATCTCGAACTTaa  <  1:2059775/61‑1 (MQ=255) ttAATTCGGTAAGATTCATAGTGGTGTGAGTTCTTAAACTTGGGGTAAATCTCGAACTTaa  <  1:210188/61‑1 (MQ=255) ttAATTCGGTAAGATTCATAGTGGTGTGAGTTCTTAAACTTGGGGTAAATCTCGAACTTaa  <  1:2118382/61‑1 (MQ=255) ttAATTCGGTAAGATTCATAGTGGTGTGAGTTCTTAAACTTGGGGTAAATCTCGAACTTaa  <  1:2177562/61‑1 (MQ=255) ttAATTCGGTAAGATTCATAGTGGTGTGAGTTCTTAAACTTGGGGTAAATCTCGAACTTaa  <  1:2181586/61‑1 (MQ=255) ttAATTCGGTAAGATTCATAGTGGTGTGAGTTCTTAAACTTGGGGTAAATCTCGAACTTaa  <  1:224286/61‑1 (MQ=255) ttAATTCGGTAAGATTCATAGTGGTGTGAGTTCTTAAACTTGGGGTAAATCTCGAACTTaa  <  1:2369300/61‑1 (MQ=255) ttAATTCGGTAAGATTCATAGTGGTGTGAGTTCTTAAACTTGGGGTAAATCTCGAACTTaa  <  1:2455473/61‑1 (MQ=255) ttAATTCGGTAAGATTCATAGTGGTGTGAGTTCTTAAACTTGGGGTAAATCTCGAACTTaa  <  1:2517912/61‑1 (MQ=255) ttAATTCGGTAAGATTCATAGTGGTGTGAGTTCTTAAACTTGGGGTAAATCTCGAACTTaa  <  1:2547284/61‑1 (MQ=255) ttAATTCGGTAAGATTCATAGTGGTGTGAGTTCTTAAACTTGGGATAAATCTCGAACTTaa  <  1:2018796/61‑1 (MQ=255)  tAATTCGGTAAGATTCATAGTGGTGTGAGTTCTTAAACTTGGGGTAAATCTCGAACTTaa  <  1:2549775/60‑1 (MQ=255)            aGATTCATAGTGGTGTGAGTTCTTAAACTTGGGGTAAATCTCGAACTTaa  <  1:488170/50‑1 (MQ=255)                  aTAGTGGTGTGAGTTCTTAAACTTGGGGTAAATCTCGAACTTaa  <  1:1861578/44‑1 (MQ=255)                                                             | TTAATTCGGTAAGATTCATAGTGGTGTGAGTTCTTAAACTTGGGGTAAATCTCGAACTTAA  >  minE/2432178‑2432238

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑