Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2442032	2442038	7	46 [0]	[0] 8	ilvA	threonine deaminase

AGCTGTAGAGGCGTTCCTGCAACGGATGCGATGGACGTCCGCCGACCATATAGCGCACGTG  >  minE/2441971‑2442031                                                             | aGCTGTAGAGGCGTTCCTGCAACGGATGCGATGGACGTCCGCCGACCATATAGCGCACgtg  <  1:3455672/61‑1 (MQ=255) aGCTGTAGAGGCGTTCCTGCAACGGATGCGATGGACGTCCGCCGACCATATAGCGCACgtg  <  1:1115198/61‑1 (MQ=255) aGCTGTAGAGGCGTTCCTGCAACGGATGCGATGGACGTCCGCCGACCATATAGCGCACgtg  <  1:2900951/61‑1 (MQ=255) aGCTGTAGAGGCGTTCCTGCAACGGATGCGATGGACGTCCGCCGACCATATAGCGCACgtg  <  1:2927635/61‑1 (MQ=255) aGCTGTAGAGGCGTTCCTGCAACGGATGCGATGGACGTCCGCCGACCATATAGCGCACgtg  <  1:3031667/61‑1 (MQ=255) aGCTGTAGAGGCGTTCCTGCAACGGATGCGATGGACGTCCGCCGACCATATAGCGCACgtg  <  1:3070632/61‑1 (MQ=255) aGCTGTAGAGGCGTTCCTGCAACGGATGCGATGGACGTCCGCCGACCATATAGCGCACgtg  <  1:312599/61‑1 (MQ=255) aGCTGTAGAGGCGTTCCTGCAACGGATGCGATGGACGTCCGCCGACCATATAGCGCACgtg  <  1:3208109/61‑1 (MQ=255) aGCTGTAGAGGCGTTCCTGCAACGGATGCGATGGACGTCCGCCGACCATATAGCGCACgtg  <  1:3332682/61‑1 (MQ=255) aGCTGTAGAGGCGTTCCTGCAACGGATGCGATGGACGTCCGCCGACCATATAGCGCACgtg  <  1:3372926/61‑1 (MQ=255) aGCTGTAGAGGCGTTCCTGCAACGGATGCGATGGACGTCCGCCGACCATATAGCGCACgtg  <  1:3433442/61‑1 (MQ=255) aGCTGTAGAGGCGTTCCTGCAACGGATGCGATGGACGTCCGCCGACCATATAGCGCACgtg  <  1:2864549/61‑1 (MQ=255) aGCTGTAGAGGCGTTCCTGCAACGGATGCGATGGACGTCCGCCGACCATATAGCGCACgtg  <  1:3469455/61‑1 (MQ=255) aGCTGTAGAGGCGTTCCTGCAACGGATGCGATGGACGTCCGCCGACCATATAGCGCACgtg  <  1:3560497/61‑1 (MQ=255) aGCTGTAGAGGCGTTCCTGCAACGGATGCGATGGACGTCCGCCGACCATATAGCGCACgtg  <  1:437608/61‑1 (MQ=255) aGCTGTAGAGGCGTTCCTGCAACGGATGCGATGGACGTCCGCCGACCATATAGCGCACgtg  <  1:551053/61‑1 (MQ=255) aGCTGTAGAGGCGTTCCTGCAACGGATGCGATGGACGTCCGCCGACCATATAGCGCACgtg  <  1:669577/61‑1 (MQ=255) aGCTGTAGAGGCGTTCCTGCAACGGATGCGATGGACGTCCGCCGACCATATAGCGCACgtg  <  1:682242/61‑1 (MQ=255) aGCTGTAGAGGCGTTCCTGCAACGGATGCGATGGACGTCCGCCGACCATATAGCGCACgtg  <  1:689471/61‑1 (MQ=255) aGCTGTAGAGGCGTTCCTGCAACGGATGCGATGGACGTCCGCCGACCATATAGCGCACgtg  <  1:7671/61‑1 (MQ=255) aGCTGTAGAGGCGTTCCTGCAACGGATGCGATGGACGTCCGCCGACCATATAGCGCACgtg  <  1:887723/61‑1 (MQ=255) aGCTGTAGAGGCGTTCCTGCAACGGATGCGATGGACGTCCGCCGACCATATAGCGCACgtg  <  1:915457/61‑1 (MQ=255) aGCTGTAGAGGCGTTCCTGCAACGGATGCGATGGACGTCCGCCGACCATATAGCGCACgtg  <  1:1713814/61‑1 (MQ=255) aGCTGTAGAGGCGTTCCTGCAACGGATGCGATGGACGTCCGCCGACCATATAGCGCACgtg  <  1:1271613/61‑1 (MQ=255) aGCTGTAGAGGCGTTCCTGCAACGGATGCGATGGACGTCCGCCGACCATATAGCGCACgtg  <  1:127239/61‑1 (MQ=255) aGCTGTAGAGGCGTTCCTGCAACGGATGCGATGGACGTCCGCCGACCATATAGCGCACgtg  <  1:1297224/61‑1 (MQ=255) aGCTGTAGAGGCGTTCCTGCAACGGATGCGATGGACGTCCGCCGACCATATAGCGCACgtg  <  1:1257560/61‑1 (MQ=255) aGCTGTAGAGGCGTTCCTGCAACGGATGCGATGGACGTCCGCCGACCATATAGCGCACgtg  <  1:1177202/61‑1 (MQ=255) aGCTGTAGAGGCGTTCCTGCAACGGATGCGATGGACGTCCGCCGACCATATAGCGCACgtg  <  1:1418069/61‑1 (MQ=255) aGCTGTAGAGGCGTTCCTGCAACGGATGCGATGGACGTCCGCCGACCATATAGCGCACgtg  <  1:1132441/61‑1 (MQ=255) aGCTGTAGAGGCGTTCCTGCAACGGATGCGATGGACGTCCGCCGACCATATAGCGCACgtg  <  1:2849411/61‑1 (MQ=255) aGCTGTAGAGGCGTTCCTGCAACGGATGCGATGGACGTCCGCCGACCATATAGCGCACgtg  <  1:170313/61‑1 (MQ=255) aGCTGTAGAGGCGTTCCTGCAACGGATGCGATGGACGTCCGCCGACCATATAGCGCACgtg  <  1:1741674/61‑1 (MQ=255) aGCTGTAGAGGCGTTCCTGCAACGGATGCGATGGACGTCCGCCGACCATATAGCGCACgtg  <  1:1788864/61‑1 (MQ=255) aGCTGTAGAGGCGTTCCTGCAACGGATGCGATGGACGTCCGCCGACCATATAGCGCACgtg  <  1:1805668/61‑1 (MQ=255) aGCTGTAGAGGCGTTCCTGCAACGGATGCGATGGACGTCCGCCGACCATATAGCGCACgtg  <  1:2032836/61‑1 (MQ=255) aGCTGTAGAGGCGTTCCTGCAACGGATGCGATGGACGTCCGCCGACCATATAGCGCACgtg  <  1:2062678/61‑1 (MQ=255) aGCTGTAGAGGCGTTCCTGCAACGGATGCGATGGACGTCCGCCGACCATATAGCGCACgtg  <  1:2179019/61‑1 (MQ=255) aGCTGTAGAGGCGTTCCTGCAACGGATGCGATGGACGTCCGCCGACCATATAGCGCACgtg  <  1:2337667/61‑1 (MQ=255) aGCTGTAGAGGCGTTCCTGCAACGGATGCGATGGACGTCCGCCGACCATATAGCGCACgtg  <  1:2360763/61‑1 (MQ=255) aGCTGTAGAGGCGTTCCTGCAACGGATGCGATGGACGTCCGCCGACCATATAGCGCACgtg  <  1:1119014/61‑1 (MQ=255)  gCTGTAGAGGCGTTCCTGCAACGGATGCGATGGACGTCCGCCGACCATATAGCGCACgtg  <  1:1669316/60‑1 (MQ=255)  gCTGTAGAGGCGTTCCTGCAACGGATGCGATGGACGTCCGCCGACCATATAGCGCACgtg  <  1:1380887/60‑1 (MQ=255)  gCTGTAGAGGCGTTCCTGCAACGGATGCGATGGACGTCCGCCGACCATATAGCGCACgtg  <  1:351065/60‑1 (MQ=255)     gTAGAGGCGTTCCTGCAACGGATGCGATGGACGTCCGCCGACCATATAGCGCACgtg  <  1:2841982/57‑1 (MQ=255)                   gCAACGGATGCGATGGACGTCCGCCGACCATATAGCGCACgtg  <  1:3594358/43‑1 (MQ=255)                                                             | AGCTGTAGAGGCGTTCCTGCAACGGATGCGATGGACGTCCGCCGACCATATAGCGCACGTG  >  minE/2441971‑2442031

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑