Missing coverage evidence... | ||||||||||
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seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | minE | 2447101 | 2447128 | 28 | 36 [0] | [0] 13 | ilvG | Mutation in protein compared to W3110: p.Glu327_Ilefs*223 Restoration of IlvG found in MG1655 (548 amino acids), fusion of N‑ter and C‑ter fragments ECK3760:JW3740+JW3741:b4488; large subunit of acetolactate synthase II |
TCACGCAGCTGCGCGCAGTGTAGCTGCCAGTCATTGATATTTAACGGCTGCTGTAATGCTG > minE/2447040‑2447100 | tcaCGCAGCTGCGCGCAGTGTAGCTGCCAGTCATTGATATTTAACGGCTGCTGTAATGCTg > 1:562141/1‑61 (MQ=255) tcaCGCAGCTGCGCGCAGTGTAGCTGCCAGTCATTGATATTTAACGGCTGCTGTAATGCTg > 1:3060933/1‑61 (MQ=255) tcaCGCAGCTGCGCGCAGTGTAGCTGCCAGTCATTGATATTTAACGGCTGCTGTAATGCTg > 1:3077080/1‑61 (MQ=255) tcaCGCAGCTGCGCGCAGTGTAGCTGCCAGTCATTGATATTTAACGGCTGCTGTAATGCTg > 1:3120664/1‑61 (MQ=255) tcaCGCAGCTGCGCGCAGTGTAGCTGCCAGTCATTGATATTTAACGGCTGCTGTAATGCTg > 1:3326368/1‑61 (MQ=255) tcaCGCAGCTGCGCGCAGTGTAGCTGCCAGTCATTGATATTTAACGGCTGCTGTAATGCTg > 1:3341306/1‑61 (MQ=255) tcaCGCAGCTGCGCGCAGTGTAGCTGCCAGTCATTGATATTTAACGGCTGCTGTAATGCTg > 1:3501125/1‑61 (MQ=255) tcaCGCAGCTGCGCGCAGTGTAGCTGCCAGTCATTGATATTTAACGGCTGCTGTAATGCTg > 1:355069/1‑61 (MQ=255) tcaCGCAGCTGCGCGCAGTGTAGCTGCCAGTCATTGATATTTAACGGCTGCTGTAATGCTg > 1:3578147/1‑61 (MQ=255) tcaCGCAGCTGCGCGCAGTGTAGCTGCCAGTCATTGATATTTAACGGCTGCTGTAATGCTg > 1:3060543/1‑61 (MQ=255) tcaCGCAGCTGCGCGCAGTGTAGCTGCCAGTCATTGATATTTAACGGCTGCTGTAATGCTg > 1:565591/1‑61 (MQ=255) tcaCGCAGCTGCGCGCAGTGTAGCTGCCAGTCATTGATATTTAACGGCTGCTGTAATGCTg > 1:684648/1‑61 (MQ=255) tcaCGCAGCTGCGCGCAGTGTAGCTGCCAGTCATTGATATTTAACGGCTGCTGTAATGCTg > 1:790061/1‑61 (MQ=255) tcaCGCAGCTGCGCGCAGTGTAGCTGCCAGTCATTGATATTTAACGGCTGCTGTAATGCTg > 1:796995/1‑61 (MQ=255) tcaCGCAGCTGCGCGCAGTGTAGCTGCCAGTCATTGATATTTAACGGCTGCTGTAATGCTg > 1:888077/1‑61 (MQ=255) tcaCGCAGCTGCGCGCAGTGTAGCTGCCAGTCATTGATATTTAACGGCTGCTGTAATGCTg > 1:905304/1‑61 (MQ=255) tcaCGCAGCTGCGCGCAGTGTAGCTGCCAGTCATTGATATTTAACGGCTGCTGTAATGCTg > 1:949482/1‑61 (MQ=255) tcaCGCAGCTGCGCGCAGTGTAGCTGCCAGTCATTGATATTTAACGGCTGCTGTAATGCTg > 1:959385/1‑61 (MQ=255) tcaCGCAGCTGCGCGCAGTGTAGCTGCCAGTCATTGATATTTAACGGCTGCTGTAATGCTg > 1:239638/1‑61 (MQ=255) tcaCGCAGCTGCGCGCAGTGTAGCTGCCAGTCATTGATATTTAACGGCTGCTGTAATGCTg > 1:1227316/1‑61 (MQ=255) tcaCGCAGCTGCGCGCAGTGTAGCTGCCAGTCATTGATATTTAACGGCTGCTGTAATGCTg > 1:156242/1‑61 (MQ=255) tcaCGCAGCTGCGCGCAGTGTAGCTGCCAGTCATTGATATTTAACGGCTGCTGTAATGCTg > 1:1567692/1‑61 (MQ=255) tcaCGCAGCTGCGCGCAGTGTAGCTGCCAGTCATTGATATTTAACGGCTGCTGTAATGCTg > 1:1666591/1‑61 (MQ=255) tcaCGCAGCTGCGCGCAGTGTAGCTGCCAGTCATTGATATTTAACGGCTGCTGTAATGCTg > 1:1945261/1‑61 (MQ=255) tcaCGCAGCTGCGCGCAGTGTAGCTGCCAGTCATTGATATTTAACGGCTGCTGTAATGCTg > 1:2183001/1‑61 (MQ=255) tcaCGCAGCTGCGCGCAGTGTAGCTGCCAGTCATTGATATTTAACGGCTGCTGTAATGCTg > 1:2215909/1‑61 (MQ=255) tcaCGCAGCTGCGCGCAGTGTAGCTGCCAGTCATTGATATTTAACGGCTGCTGTAATGCTg > 1:2384758/1‑61 (MQ=255) tcaCGCAGCTGCGCGCAGTGTAGCTGCCAGTCATTGATATTTAACGGCTGCTGTAATGCTg > 1:1040774/1‑61 (MQ=255) tcaCGCAGCTGCGCGCAGTGTAGCTGCCAGTCATTGATATTTAACGGCTGCTGTAATGCTg > 1:2430325/1‑61 (MQ=255) tcaCGCAGCTGCGCGCAGTGTAGCTGCCAGTCATTGATATTTAACGGCTGCTGTAATGCTg > 1:2438034/1‑61 (MQ=255) tcaCGCAGCTGCGCGCAGTGTAGCTGCCAGTCATTGATATTTAACGGCTGCTGTAATGCTg > 1:2464998/1‑61 (MQ=255) tcaCGCAGCTGCGCGCAGTGTAGCTGCCAGTCATTGATATTTAACGGCTGCTGTAATGCTg > 1:274174/1‑61 (MQ=255) tcaCGCAGCTGCGCGCAGTGTAGCTGCCAGTCATTGATATTTAACGGCTGCTGTAATGCTg > 1:2840924/1‑61 (MQ=255) tcaCGCAGCTGCGCGCAGTGTAGCTGCCAGTCATTGATATTTAACGGCTGCTGTAATGCTg > 1:2879352/1‑61 (MQ=255) tcaCGCAGCTGCGCGCAGTGTAGCTGCCAGTCATTGATATTTAACGGCTGCTGTAATGCTg > 1:2918231/1‑61 (MQ=255) tcaCGCAGCTGCGCGCAGTGTAGCTGCCAGTCATTGATATTTAACGGCTGCTGTAATGCTg > 1:3019310/1‑61 (MQ=255) | TCACGCAGCTGCGCGCAGTGTAGCTGCCAGTCATTGATATTTAACGGCTGCTGTAATGCTG > minE/2447040‑2447100 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |