Missing coverage evidence...
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TCCGGCTGGGCGGGCGTGATTGCCCTGGCGTTGTTGCAGGTGCCGATTGTTATCCGCACCA  >  minE/2477408‑2477468                                                             | tcCGGCTGGGCGGGCGTGATTGCCCTGGCGTTGTTGCAGGTGCCGATTGTTATCCGcacca  >  1:2790488/1‑61 (MQ=255) tcCGGCTGGGCGGGCGTGATTGCCCTGGCGTTGTTGCAGGTGCCGATTGTTATCCGcacca  >  1:903379/1‑61 (MQ=255) tcCGGCTGGGCGGGCGTGATTGCCCTGGCGTTGTTGCAGGTGCCGATTGTTATCCGcacca  >  1:529290/1‑61 (MQ=255) tcCGGCTGGGCGGGCGTGATTGCCCTGGCGTTGTTGCAGGTGCCGATTGTTATCCGcacca  >  1:494202/1‑61 (MQ=255) tcCGGCTGGGCGGGCGTGATTGCCCTGGCGTTGTTGCAGGTGCCGATTGTTATCCGcacca  >  1:48793/1‑61 (MQ=255) tcCGGCTGGGCGGGCGTGATTGCCCTGGCGTTGTTGCAGGTGCCGATTGTTATCCGcacca  >  1:3648881/1‑61 (MQ=255) tcCGGCTGGGCGGGCGTGATTGCCCTGGCGTTGTTGCAGGTGCCGATTGTTATCCGcacca  >  1:3557890/1‑61 (MQ=255) tcCGGCTGGGCGGGCGTGATTGCCCTGGCGTTGTTGCAGGTGCCGATTGTTATCCGcacca  >  1:3468811/1‑61 (MQ=255) tcCGGCTGGGCGGGCGTGATTGCCCTGGCGTTGTTGCAGGTGCCGATTGTTATCCGcacca  >  1:3040154/1‑61 (MQ=255) tcCGGCTGGGCGGGCGTGATTGCCCTGGCGTTGTTGCAGGTGCCGATTGTTATCCGcacca  >  1:1079282/1‑61 (MQ=255) tcCGGCTGGGCGGGCGTGATTGCCCTGGCGTTGTTGCAGGTGCCGATTGTTATCCGcacca  >  1:2610673/1‑61 (MQ=255) tcCGGCTGGGCGGGCGTGATTGCCCTGGCGTTGTTGCAGGTGCCGATTGTTATCCGcacca  >  1:236787/1‑61 (MQ=255) tcCGGCTGGGCGGGCGTGATTGCCCTGGCGTTGTTGCAGGTGCCGATTGTTATCCGcacca  >  1:2342298/1‑61 (MQ=255) tcCGGCTGGGCGGGCGTGATTGCCCTGGCGTTGTTGCAGGTGCCGATTGTTATCCGcacca  >  1:2225225/1‑61 (MQ=255) tcCGGCTGGGCGGGCGTGATTGCCCTGGCGTTGTTGCAGGTGCCGATTGTTATCCGcacca  >  1:2222382/1‑61 (MQ=255) tcCGGCTGGGCGGGCGTGATTGCCCTGGCGTTGTTGCAGGTGCCGATTGTTATCCGcacca  >  1:1695146/1‑61 (MQ=255) tcCGGCTGGGCGGGCGTGATTGCCCTGGCGTTGTTGCAGGTGCCGATTGTTATCCGcacca  >  1:1534820/1‑61 (MQ=255) tcCGGCTGGGCGGGCGTGATTGCCCTGGCGTTGTTGCAGGTGCCGATTGTTATCCGcacca  >  1:1472719/1‑61 (MQ=255)                                                             | TCCGGCTGGGCGGGCGTGATTGCCCTGGCGTTGTTGCAGGTGCCGATTGTTATCCGCACCA  >  minE/2477408‑2477468

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑