Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2501446	2501545	100	58 [0]	[0] 86	uhpB	sensory histidine kinase in two‑component regulatory sytem with UhpA

GTGAAACATGCTGATGCCAGCGCGGTCACCCTGCAAGGCTGGCAGCAGGATGAACGGTTGAT  >  minE/2501384‑2501445                                                              | gtgAAAGATGCTGATGCCAGCGCGGTCACCCTGCAAGGGTGGCAGCAGGATGAACGGTTGAt  >  1:1117726/1‑62 (MQ=255) gtgAAACATGCTGATGCCAGCGCGGTCACCCTGCAAGGCTGGCAGCAGGATGAACGGTTGAt  >  1:3619147/1‑62 (MQ=255) gtgAAACATGCTGATGCCAGCGCGGTCACCCTGCAAGGCTGGCAGCAGGATGAACGGTTGAt  >  1:287539/1‑62 (MQ=255) gtgAAACATGCTGATGCCAGCGCGGTCACCCTGCAAGGCTGGCAGCAGGATGAACGGTTGAt  >  1:2878095/1‑62 (MQ=255) gtgAAACATGCTGATGCCAGCGCGGTCACCCTGCAAGGCTGGCAGCAGGATGAACGGTTGAt  >  1:2881117/1‑62 (MQ=255) gtgAAACATGCTGATGCCAGCGCGGTCACCCTGCAAGGCTGGCAGCAGGATGAACGGTTGAt  >  1:2896004/1‑62 (MQ=255) gtgAAACATGCTGATGCCAGCGCGGTCACCCTGCAAGGCTGGCAGCAGGATGAACGGTTGAt  >  1:2943318/1‑62 (MQ=255) gtgAAACATGCTGATGCCAGCGCGGTCACCCTGCAAGGCTGGCAGCAGGATGAACGGTTGAt  >  1:3006577/1‑62 (MQ=255) gtgAAACATGCTGATGCCAGCGCGGTCACCCTGCAAGGCTGGCAGCAGGATGAACGGTTGAt  >  1:3033234/1‑62 (MQ=255) gtgAAACATGCTGATGCCAGCGCGGTCACCCTGCAAGGCTGGCAGCAGGATGAACGGTTGAt  >  1:3133745/1‑62 (MQ=255) gtgAAACATGCTGATGCCAGCGCGGTCACCCTGCAAGGCTGGCAGCAGGATGAACGGTTGAt  >  1:3257086/1‑62 (MQ=255) gtgAAACATGCTGATGCCAGCGCGGTCACCCTGCAAGGCTGGCAGCAGGATGAACGGTTGAt  >  1:3321189/1‑62 (MQ=255) gtgAAACATGCTGATGCCAGCGCGGTCACCCTGCAAGGCTGGCAGCAGGATGAACGGTTGAt  >  1:338582/1‑62 (MQ=255) gtgAAACATGCTGATGCCAGCGCGGTCACCCTGCAAGGCTGGCAGCAGGATGAACGGTTGAt  >  1:3531902/1‑62 (MQ=255) gtgAAACATGCTGATGCCAGCGCGGTCACCCTGCAAGGCTGGCAGCAGGATGAACGGTTGAt  >  1:3576699/1‑62 (MQ=255) gtgAAACATGCTGATGCCAGCGCGGTCACCCTGCAAGGCTGGCAGCAGGATGAACGGTTGAt  >  1:3608125/1‑62 (MQ=255) gtgAAACATGCTGATGCCAGCGCGGTCACCCTGCAAGGCTGGCAGCAGGATGAACGGTTGAt  >  1:2822394/1‑62 (MQ=255) gtgAAACATGCTGATGCCAGCGCGGTCACCCTGCAAGGCTGGCAGCAGGATGAACGGTTGAt  >  1:416710/1‑62 (MQ=255) gtgAAACATGCTGATGCCAGCGCGGTCACCCTGCAAGGCTGGCAGCAGGATGAACGGTTGAt  >  1:468019/1‑62 (MQ=255) gtgAAACATGCTGATGCCAGCGCGGTCACCCTGCAAGGCTGGCAGCAGGATGAACGGTTGAt  >  1:564056/1‑62 (MQ=255) gtgAAACATGCTGATGCCAGCGCGGTCACCCTGCAAGGCTGGCAGCAGGATGAACGGTTGAt  >  1:60437/1‑62 (MQ=255) gtgAAACATGCTGATGCCAGCGCGGTCACCCTGCAAGGCTGGCAGCAGGATGAACGGTTGAt  >  1:68325/1‑62 (MQ=255) gtgAAACATGCTGATGCCAGCGCGGTCACCCTGCAAGGCTGGCAGCAGGATGAACGGTTGAt  >  1:715849/1‑62 (MQ=255) gtgAAACATGCTGATGCCAGCGCGGTCACCCTGCAAGGCTGGCAGCAGGATGAACGGTTGAt  >  1:74919/1‑62 (MQ=255) gtgAAACATGCTGATGCCAGCGCGGTCACCCTGCAAGGCTGGCAGCAGGATGAACGGTTGAt  >  1:781137/1‑62 (MQ=255) gtgAAACATGCTGATGCCAGCGCGGTCACCCTGCAAGGCTGGCAGCAGGATGAACGGTTGAt  >  1:782449/1‑62 (MQ=255) gtgAAACATGCTGATGCCAGCGCGGTCACCCTGCAAGGCTGGCAGCAGGATGAACGGTTGAt  >  1:811166/1‑62 (MQ=255) gtgAAACATGCTGATGCCAGCGCGGTCACCCTGCAAGGCTGGCAGCAGGATGAACGGTTGAt  >  1:813489/1‑62 (MQ=255) gtgAAACATGCTGATGCCAGCGCGGTCACCCTGCAAGGCTGGCAGCAGGATGAACGGTTGAt  >  1:956667/1‑62 (MQ=255) gtgAAACATGCTGATGCCAGCGCGGTCACCCTGCAAGGCTGGCAGCAGGATGAACGGTTGAt  >  1:995207/1‑62 (MQ=255) gtgAAACATGCTGATGCCAGCGCGGTCACCCTGCAAGGCTGGCAGCAGGATGAACGGTTGAt  >  1:2046977/1‑62 (MQ=255) gtgAAACATGCTGATGCCAGCGCGGTCACCCTGCAAGGCTGGCAGCAGGATGAACGGTTGAt  >  1:104914/1‑62 (MQ=255) gtgAAACATGCTGATGCCAGCGCGGTCACCCTGCAAGGCTGGCAGCAGGATGAACGGTTGAt  >  1:1062583/1‑62 (MQ=255) gtgAAACATGCTGATGCCAGCGCGGTCACCCTGCAAGGCTGGCAGCAGGATGAACGGTTGAt  >  1:114748/1‑62 (MQ=255) gtgAAACATGCTGATGCCAGCGCGGTCACCCTGCAAGGCTGGCAGCAGGATGAACGGTTGAt  >  1:121727/1‑62 (MQ=255) gtgAAACATGCTGATGCCAGCGCGGTCACCCTGCAAGGCTGGCAGCAGGATGAACGGTTGAt  >  1:1430792/1‑62 (MQ=255) gtgAAACATGCTGATGCCAGCGCGGTCACCCTGCAAGGCTGGCAGCAGGATGAACGGTTGAt  >  1:1531626/1‑62 (MQ=255) gtgAAACATGCTGATGCCAGCGCGGTCACCCTGCAAGGCTGGCAGCAGGATGAACGGTTGAt  >  1:1565694/1‑62 (MQ=255) gtgAAACATGCTGATGCCAGCGCGGTCACCCTGCAAGGCTGGCAGCAGGATGAACGGTTGAt  >  1:1632844/1‑62 (MQ=255) gtgAAACATGCTGATGCCAGCGCGGTCACCCTGCAAGGCTGGCAGCAGGATGAACGGTTGAt  >  1:1641289/1‑62 (MQ=255) gtgAAACATGCTGATGCCAGCGCGGTCACCCTGCAAGGCTGGCAGCAGGATGAACGGTTGAt  >  1:1687552/1‑62 (MQ=255) gtgAAACATGCTGATGCCAGCGCGGTCACCCTGCAAGGCTGGCAGCAGGATGAACGGTTGAt  >  1:1728713/1‑62 (MQ=255) gtgAAACATGCTGATGCCAGCGCGGTCACCCTGCAAGGCTGGCAGCAGGATGAACGGTTGAt  >  1:1926602/1‑62 (MQ=255) gtgAAACATGCTGATGCCAGCGCGGTCACCCTGCAAGGCTGGCAGCAGGATGAACGGTTGAt  >  1:2031023/1‑62 (MQ=255) gtgAAACATGCTGATGCCAGCGCGGTCACCCTGCAAGGCTGGCAGCAGGATGAACGGTTGAt  >  1:1043011/1‑62 (MQ=255) gtgAAACATGCTGATGCCAGCGCGGTCACCCTGCAAGGCTGGCAGCAGGATGAACGGTTGAt  >  1:2092891/1‑62 (MQ=255) gtgAAACATGCTGATGCCAGCGCGGTCACCCTGCAAGGCTGGCAGCAGGATGAACGGTTGAt  >  1:2191364/1‑62 (MQ=255) gtgAAACATGCTGATGCCAGCGCGGTCACCCTGCAAGGCTGGCAGCAGGATGAACGGTTGAt  >  1:2206315/1‑62 (MQ=255) gtgAAACATGCTGATGCCAGCGCGGTCACCCTGCAAGGCTGGCAGCAGGATGAACGGTTGAt  >  1:2287386/1‑62 (MQ=255) gtgAAACATGCTGATGCCAGCGCGGTCACCCTGCAAGGCTGGCAGCAGGATGAACGGTTGAt  >  1:2308194/1‑62 (MQ=255) gtgAAACATGCTGATGCCAGCGCGGTCACCCTGCAAGGCTGGCAGCAGGATGAACGGTTGAt  >  1:2382162/1‑62 (MQ=255) gtgAAACATGCTGATGCCAGCGCGGTCACCCTGCAAGGCTGGCAGCAGGATGAACGGTTGAt  >  1:244361/1‑62 (MQ=255) gtgAAACATGCTGATGCCAGCGCGGTCACCCTGCAAGGCTGGCAGCAGGATGAACGGTTGAt  >  1:2481183/1‑62 (MQ=255) gtgAAACATGCTGATGCCAGCGCGGTCACCCTGCAAGGCTGGCAGCAGGATGAACGGTTGAt  >  1:2557588/1‑62 (MQ=255) gtgAAACATGCTGATGCCAGCGCGGTCACCCTGCAAGGCTGGCAGCAGGATGAACGGTTGAt  >  1:2626030/1‑62 (MQ=255) gtgAAACATGCTGATGCCAGCGCGGTCACCCTGCAAGGCTGGCAGCAGGATGAACGGTTGAt  >  1:2664329/1‑62 (MQ=255) gtgAAACATGCTGATGCCAGCGCGGTCACCCTGCAAGGCTGGCAGCAGGATGAACGGTTGAt  >  1:267224/1‑62 (MQ=255) gtgAAACATGCTGATGCCAGCGCGGTCACCCTGCAAGGCTGGCAGCAGGATGAACGGTTGAt  >  1:2705220/1‑62 (MQ=255)                                                              | GTGAAACATGCTGATGCCAGCGCGGTCACCCTGCAAGGCTGGCAGCAGGATGAACGGTTGAT  >  minE/2501384‑2501445

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑