Missing coverage evidence...
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ATTACAAGCGTTGCGCCGCCCAGAACCGGTTCTGGAATGTGTTGTACAAAACCGCTCACTGC  >  minE/2511370‑2511431                                                              | aTTACAAGCGTTGCGCCGCCCAGAACCGGTTCTGGTATGTGTTGTACAAAACCGCTCACTGc  >  1:337307/1‑62 (MQ=255) aTTACAAGCGTTGCGCCGCCCAGAACCGGTTCTGGAATGTGTTGTACAAAACCGCTCACTGc  >  1:3316532/1‑62 (MQ=255) aTTACAAGCGTTGCGCCGCCCAGAACCGGTTCTGGAATGTGTTGTACAAAACCGCTCACTGc  >  1:2749796/1‑62 (MQ=255) aTTACAAGCGTTGCGCCGCCCAGAACCGGTTCTGGAATGTGTTGTACAAAACCGCTCACTGc  >  1:2772035/1‑62 (MQ=255) aTTACAAGCGTTGCGCCGCCCAGAACCGGTTCTGGAATGTGTTGTACAAAACCGCTCACTGc  >  1:2871574/1‑62 (MQ=255) aTTACAAGCGTTGCGCCGCCCAGAACCGGTTCTGGAATGTGTTGTACAAAACCGCTCACTGc  >  1:2905083/1‑62 (MQ=255) aTTACAAGCGTTGCGCCGCCCAGAACCGGTTCTGGAATGTGTTGTACAAAACCGCTCACTGc  >  1:2954499/1‑62 (MQ=255) aTTACAAGCGTTGCGCCGCCCAGAACCGGTTCTGGAATGTGTTGTACAAAACCGCTCACTGc  >  1:304551/1‑62 (MQ=255) aTTACAAGCGTTGCGCCGCCCAGAACCGGTTCTGGAATGTGTTGTACAAAACCGCTCACTGc  >  1:309863/1‑62 (MQ=255) aTTACAAGCGTTGCGCCGCCCAGAACCGGTTCTGGAATGTGTTGTACAAAACCGCTCACTGc  >  1:3181995/1‑62 (MQ=255) aTTACAAGCGTTGCGCCGCCCAGAACCGGTTCTGGAATGTGTTGTACAAAACCGCTCACTGc  >  1:2653348/1‑62 (MQ=255) aTTACAAGCGTTGCGCCGCCCAGAACCGGTTCTGGAATGTGTTGTACAAAACCGCTCACTGc  >  1:378607/1‑62 (MQ=255) aTTACAAGCGTTGCGCCGCCCAGAACCGGTTCTGGAATGTGTTGTACAAAACCGCTCACTGc  >  1:489087/1‑62 (MQ=255) aTTACAAGCGTTGCGCCGCCCAGAACCGGTTCTGGAATGTGTTGTACAAAACCGCTCACTGc  >  1:504350/1‑62 (MQ=255) aTTACAAGCGTTGCGCCGCCCAGAACCGGTTCTGGAATGTGTTGTACAAAACCGCTCACTGc  >  1:517932/1‑62 (MQ=255) aTTACAAGCGTTGCGCCGCCCAGAACCGGTTCTGGAATGTGTTGTACAAAACCGCTCACTGc  >  1:730822/1‑62 (MQ=255) aTTACAAGCGTTGCGCCGCCCAGAACCGGTTCTGGAATGTGTTGTACAAAACCGCTCACTGc  >  1:924954/1‑62 (MQ=255) aTTACAAGCGTTGCGCCGCCCAGAACCGGTTCTGGAATGTGTTGTACAAAACCGCTCACTGc  >  1:955009/1‑62 (MQ=255) aTTACAAGCGTTGCGCCGCCCAGAACCGGTTCTGGAATGTGTTGTACAAAACCGCTCACTGc  >  1:2055080/1‑62 (MQ=255) aTTACAAGCGTTGCGCCGCCCAGAACCGGTTCTGGAATGTGTTGTACAAAACCGCTCACTGc  >  1:1170988/1‑62 (MQ=255) aTTACAAGCGTTGCGCCGCCCAGAACCGGTTCTGGAATGTGTTGTACAAAACCGCTCACTGc  >  1:1320516/1‑62 (MQ=255) aTTACAAGCGTTGCGCCGCCCAGAACCGGTTCTGGAATGTGTTGTACAAAACCGCTCACTGc  >  1:1399423/1‑62 (MQ=255) aTTACAAGCGTTGCGCCGCCCAGAACCGGTTCTGGAATGTGTTGTACAAAACCGCTCACTGc  >  1:1797855/1‑62 (MQ=255) aTTACAAGCGTTGCGCCGCCCAGAACCGGTTCTGGAATGTGTTGTACAAAACCGCTCACTGc  >  1:186828/1‑62 (MQ=255) aTTACAAGCGTTGCGCCGCCCAGAACCGGTTCTGGAATGTGTTGTACAAAACCGCTCACTGc  >  1:1883369/1‑62 (MQ=255) aTTACAAGCGTTGCGCCGCCCAGAACCGGTTCTGGAATGTGTTGTACAAAACCGCTCACTGc  >  1:1961665/1‑62 (MQ=255) aTTACAAGCGTTGCGCCGCCCAGAACCGGTTCTGGAATGTGTTGTACAAAACCGCTCACTGc  >  1:2049440/1‑62 (MQ=255) aTTACAAGCGTTGCGCCGCCCAGAACCGGTTCTGGAATGTGTTGTACAAAACCGCTCACTGc  >  1:1025822/1‑62 (MQ=255) aTTACAAGCGTTGCGCCGCCCAGAACCGGTTCTGGAATGTGTTGTACAAAACCGCTCACTGc  >  1:2177734/1‑62 (MQ=255) aTTACAAGCGTTGCGCCGCCCAGAACCGGTTCTGGAATGTGTTGTACAAAACCGCTCACTGc  >  1:2243944/1‑62 (MQ=255) aTTACAAGCGTTGCGCCGCCCAGAACCGGTTCTGGAATGTGTTGTACAAAACCGCTCACTGc  >  1:2378362/1‑62 (MQ=255) aTTACAAGCGTTGCGCCGCCCAGAACCGGTTCTGGAATGTGTTGTACAAAACCGCTCACTGc  >  1:2440306/1‑62 (MQ=255) aTTACAAGCGTTGCGCCGCCCAGAACCGGTTCTGGAATGTGTTGTACAAAACCGCTCACTGc  >  1:2444198/1‑62 (MQ=255) aTTACAAGCGTTGCGCCGCCCAGAACCGGTTCTGGAATGTGTTGTACAAAACCGCTCACTGc  >  1:2546507/1‑62 (MQ=255) aTTACAAGCGTTGCGCCGCCCAGAACCGGTTCTGGAATGTGTTGTACAAAACCGCTCACTGc  >  1:2548862/1‑62 (MQ=255) aTTACAAGCGTTGCGCCGCCCAGAACCGGTTCTGGAATGTGTTGTACAAAACCGCTCACTGc  >  1:2555078/1‑62 (MQ=255)                                                              | ATTACAAGCGTTGCGCCGCCCAGAACCGGTTCTGGAATGTGTTGTACAAAACCGCTCACTGC  >  minE/2511370‑2511431

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑