Missing coverage evidence...
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CAAATTCCGGGAACATATCGGTCCAGGCTTCCACGTCATACAACGCCCCCAGGTTACGACCA  >  minE/228306‑228367                                                              | caAATTCCGGGAACATATCGGTCCAGGCTTCCACGTCATACAACGCCCCCAGGTTTCGACCa  <  1:1114245/62‑1 (MQ=255) caAATTCCGGGAACATATCGGTCCAGGCTTCCACGTCATACAACGCCCCCAGGTTACGACCa  <  1:978390/62‑1 (MQ=255) caAATTCCGGGAACATATCGGTCCAGGCTTCCACGTCATACAACGCCCCCAGGTTACGACCa  <  1:1052824/62‑1 (MQ=255) caAATTCCGGGAACATATCGGTCCAGGCTTCCACGTCATACAACGCCCCCAGGTTACGACCa  <  1:608104/62‑1 (MQ=255) caAATTCCGGGAACATATCGGTCCAGGCTTCCACGTCATACAACGCCCCCAGGTTACGACCa  <  1:479554/62‑1 (MQ=255) caAATTCCGGGAACATATCGGTCCAGGCTTCCACGTCATACAACGCCCCCAGGTTACGACCa  <  1:3534040/62‑1 (MQ=255) caAATTCCGGGAACATATCGGTCCAGGCTTCCACGTCATACAACGCCCCCAGGTTACGACCa  <  1:3461825/62‑1 (MQ=255) caAATTCCGGGAACATATCGGTCCAGGCTTCCACGTCATACAACGCCCCCAGGTTACGACCa  <  1:3287630/62‑1 (MQ=255) caAATTCCGGGAACATATCGGTCCAGGCTTCCACGTCATACAACGCCCCCAGGTTACGACCa  <  1:2997389/62‑1 (MQ=255) caAATTCCGGGAACATATCGGTCCAGGCTTCCACGTCATACAACGCCCCCAGGTTACGACCa  <  1:2803773/62‑1 (MQ=255) caAATTCCGGGAACATATCGGTCCAGGCTTCCACGTCATACAACGCCCCCAGGTTACGACCa  <  1:2484554/62‑1 (MQ=255) caAATTCCGGGAACATATCGGTCCAGGCTTCCACGTCATACAACGCCCCCAGGTTACGACCa  <  1:2398124/62‑1 (MQ=255) caAATTCCGGGAACATATCGGTCCAGGCTTCCACGTCATACAACGCCCCCAGGTTACGACCa  <  1:2387392/62‑1 (MQ=255) caAATTCCGGGAACATATCGGTCCAGGCTTCCACGTCATACAACGCCCCCAGGTTACGACCa  <  1:2249133/62‑1 (MQ=255) caAATTCCGGGAACATATCGGTCCAGGCTTCCACGTCATACAACGCCCCCAGGTTACGACCa  <  1:188875/62‑1 (MQ=255) caAATTCCGGGAACATATCGGTCCAGGCTTCCACGTCATACAACGCCCCCAGGTTACGACCa  <  1:1866175/62‑1 (MQ=255) caAATTCCGGGAACATATCGGTCCAGGCTTCCACGTCATACAACGCCCCCAGGTTACGACCa  <  1:1850286/62‑1 (MQ=255) caAATTCCGGGAACATATCGGTCCAGGCTTCCACGTCATACAACGCCCCCAGGTTACGACCa  <  1:1730042/62‑1 (MQ=255) caAATTCCGGGAACATATCGGTCCAGGCTTCCACGTCATACAACGCCCCCAGGTTACGACCa  <  1:1292824/62‑1 (MQ=255) caAATTCCGGGAACATATCGGTCCAGGCTTCCACGTCATACAACGCCCCCAGGTTACGACCa  <  1:1157596/62‑1 (MQ=255)  aaaTTCCGGGAACATATCGGTCCAGGCTTCCACGTCATACAACGCCCCCAGGTTACGACCa  <  1:2782242/61‑1 (MQ=255)            aaCATATCGGTCCAGGCTTCCACGTCATACAACGCCCCCAGGTTACGACCa  <  1:2692151/51‑1 (MQ=255)                            cTTCCACGTCATACAACGCCCCCAGGTTACGACCa  <  1:127935/35‑1 (MQ=255)                                                              | CAAATTCCGGGAACATATCGGTCCAGGCTTCCACGTCATACAACGCCCCCAGGTTACGACCA  >  minE/228306‑228367

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑