Missing coverage evidence...
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ATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGCGAGATCGGCAATGCCATACAGTA  >  minE/2531934‑2531995                                                              | aTGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGCGAGATCGGCAATGCCATACAGTa  <  1:1373231/62‑1 (MQ=255) aTGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGCGAGATCGGCAATGCCATACAGTa  <  1:847324/62‑1 (MQ=255) aTGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGCGAGATCGGCAATGCCATACAGTa  <  1:809095/62‑1 (MQ=255) aTGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGCGAGATCGGCAATGCCATACAGTa  <  1:753499/62‑1 (MQ=255) aTGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGCGAGATCGGCAATGCCATACAGTa  <  1:506029/62‑1 (MQ=255) aTGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGCGAGATCGGCAATGCCATACAGTa  <  1:365721/62‑1 (MQ=255) aTGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGCGAGATCGGCAATGCCATACAGTa  <  1:3447813/62‑1 (MQ=255) aTGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGCGAGATCGGCAATGCCATACAGTa  <  1:343967/62‑1 (MQ=255) aTGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGCGAGATCGGCAATGCCATACAGTa  <  1:3423581/62‑1 (MQ=255) aTGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGCGAGATCGGCAATGCCATACAGTa  <  1:3331063/62‑1 (MQ=255) aTGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGCGAGATCGGCAATGCCATACAGTa  <  1:3257036/62‑1 (MQ=255) aTGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGCGAGATCGGCAATGCCATACAGTa  <  1:3198032/62‑1 (MQ=255) aTGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGCGAGATCGGCAATGCCATACAGTa  <  1:3165274/62‑1 (MQ=255) aTGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGCGAGATCGGCAATGCCATACAGTa  <  1:30343/62‑1 (MQ=255) aTGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGCGAGATCGGCAATGCCATACAGTa  <  1:2954402/62‑1 (MQ=255) aTGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGCGAGATCGGCAATGCCATACAGTa  <  1:2805639/62‑1 (MQ=255) aTGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGCGAGATCGGCAATGCCATACAGTa  <  1:1087354/62‑1 (MQ=255) aTGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGCGAGATCGGCAATGCCATACAGTa  <  1:2546606/62‑1 (MQ=255) aTGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGCGAGATCGGCAATGCCATACAGTa  <  1:2511148/62‑1 (MQ=255) aTGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGCGAGATCGGCAATGCCATACAGTa  <  1:2406732/62‑1 (MQ=255) aTGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGCGAGATCGGCAATGCCATACAGTa  <  1:2298766/62‑1 (MQ=255) aTGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGCGAGATCGGCAATGCCATACAGTa  <  1:2226611/62‑1 (MQ=255) aTGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGCGAGATCGGCAATGCCATACAGTa  <  1:2177968/62‑1 (MQ=255) aTGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGCGAGATCGGCAATGCCATACAGTa  <  1:2164463/62‑1 (MQ=255) aTGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGCGAGATCGGCAATGCCATACAGTa  <  1:145182/62‑1 (MQ=255) aTGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGCGAGATCGGCAATGCCATACAGTa  <  1:2126043/62‑1 (MQ=255) aTGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGCGAGATCGGCAATGCCATACAGTa  <  1:210270/62‑1 (MQ=255) aTGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGCGAGATCGGCAATGCCATACAGTa  <  1:1899808/62‑1 (MQ=255) aTGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGCGAGATCGGCAATGCCATACAGTa  <  1:1952209/62‑1 (MQ=255) aTGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGCGAGATCGGCAATGCCATACAGTa  <  1:197012/62‑1 (MQ=255) aTGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGCGAGATCGGCAACGCCATACAGTa  <  1:2766271/62‑1 (MQ=255)  tGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGCGAGATCGGCAATGCCATACAGTa  <  1:3582550/61‑1 (MQ=255)  tGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGCGAGATCGGCAATGCCATACAGTa  <  1:614322/61‑1 (MQ=255)  tGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGCGAGATCGGCAATGCCATACAGTa  <  1:641454/61‑1 (MQ=255)  tGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGCGAGATCGGCAATGCCATACAGTa  <  1:2676300/61‑1 (MQ=255)           cGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGCGAGATCGGCAATGCCATACAGTa  <  1:3467125/52‑1 (MQ=255)            gTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGCGAGATCGGCAATGCCATACAGTa  <  1:945667/51‑1 (MQ=255)              tCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGCGAGATCGGCAATGCCATACAGTa  <  1:216267/49‑1 (MQ=255)                                                              | ATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGCGAGATCGGCAATGCCATACAGTA  >  minE/2531934‑2531995

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑