Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2533399	2533409	11	49 [0]	[0] 9	rfaQ	lipopolysaccharide core biosynthesis protein

CATTTCGAAAAATCCTGGTCATAAAGATGCGATATCATGGGGATATGT  >  minE/2533351‑2533398                                                | cATTTCGAAATATCCTGGTCATAAAGATGCGATATCATGGGGATATGt  >  1:3134159/1‑48 (MQ=255) cATTTCGAAAAGTCCTGGTCATAAAGATGCGATATCATGGGGATATGt  >  1:1182258/1‑48 (MQ=255) cATTTCGAAAAATCCTGGTCATAAAGATGCGATATCATGGGGATATGt  >  1:3370904/1‑48 (MQ=255) cATTTCGAAAAATCCTGGTCATAAAGATGCGATATCATGGGGATATGt  >  1:2182157/1‑48 (MQ=255) cATTTCGAAAAATCCTGGTCATAAAGATGCGATATCATGGGGATATGt  >  1:2219753/1‑48 (MQ=255) cATTTCGAAAAATCCTGGTCATAAAGATGCGATATCATGGGGATATGt  >  1:2229959/1‑48 (MQ=255) cATTTCGAAAAATCCTGGTCATAAAGATGCGATATCATGGGGATATGt  >  1:2354107/1‑48 (MQ=255) cATTTCGAAAAATCCTGGTCATAAAGATGCGATATCATGGGGATATGt  >  1:2358524/1‑48 (MQ=255) cATTTCGAAAAATCCTGGTCATAAAGATGCGATATCATGGGGATATGt  >  1:2490703/1‑48 (MQ=255) cATTTCGAAAAATCCTGGTCATAAAGATGCGATATCATGGGGATATGt  >  1:2509726/1‑48 (MQ=255) cATTTCGAAAAATCCTGGTCATAAAGATGCGATATCATGGGGATATGt  >  1:2532777/1‑48 (MQ=255) cATTTCGAAAAATCCTGGTCATAAAGATGCGATATCATGGGGATATGt  >  1:2819494/1‑48 (MQ=255) cATTTCGAAAAATCCTGGTCATAAAGATGCGATATCATGGGGATATGt  >  1:3074338/1‑48 (MQ=255) cATTTCGAAAAATCCTGGTCATAAAGATGCGATATCATGGGGATATGt  >  1:3145726/1‑48 (MQ=255) cATTTCGAAAAATCCTGGTCATAAAGATGCGATATCATGGGGATATGt  >  1:2102457/1‑48 (MQ=255) cATTTCGAAAAATCCTGGTCATAAAGATGCGATATCATGGGGATATGt  >  1:3391413/1‑48 (MQ=255) cATTTCGAAAAATCCTGGTCATAAAGATGCGATATCATGGGGATATGt  >  1:3482058/1‑48 (MQ=255) cATTTCGAAAAATCCTGGTCATAAAGATGCGATATCATGGGGATATGt  >  1:3593169/1‑48 (MQ=255) cATTTCGAAAAATCCTGGTCATAAAGATGCGATATCATGGGGATATGt  >  1:3631473/1‑48 (MQ=255) cATTTCGAAAAATCCTGGTCATAAAGATGCGATATCATGGGGATATGt  >  1:505155/1‑48 (MQ=255) cATTTCGAAAAATCCTGGTCATAAAGATGCGATATCATGGGGATATGt  >  1:53369/1‑48 (MQ=255) cATTTCGAAAAATCCTGGTCATAAAGATGCGATATCATGGGGATATGt  >  1:546527/1‑48 (MQ=255) cATTTCGAAAAATCCTGGTCATAAAGATGCGATATCATGGGGATATGt  >  1:618316/1‑48 (MQ=255) cATTTCGAAAAATCCTGGTCATAAAGATGCGATATCATGGGGATATGt  >  1:665305/1‑48 (MQ=255) cATTTCGAAAAATCCTGGTCATAAAGATGCGATATCATGGGGATATGt  >  1:877769/1‑48 (MQ=255) cATTTCGAAAAATCCTGGTCATAAAGATGCGATATCATGGGGATATGt  >  1:1460565/1‑48 (MQ=255) cATTTCGAAAAATCCTGGTCATAAAGATGCGATATCATGGGGATATGt  >  1:105860/1‑48 (MQ=255) cATTTCGAAAAATCCTGGTCATAAAGATGCGATATCATGGGGATATGt  >  1:1059266/1‑48 (MQ=255) cATTTCGAAAAATCCTGGTCATAAAGATGCGATATCATGGGGATATGt  >  1:1129460/1‑48 (MQ=255) cATTTCGAAAAATCCTGGTCATAAAGATGCGATATCATGGGGATATGt  >  1:1166905/1‑48 (MQ=255) cATTTCGAAAAATCCTGGTCATAAAGATGCGATATCATGGGGATATGt  >  1:1252133/1‑48 (MQ=255) cATTTCGAAAAATCCTGGTCATAAAGATGCGATATCATGGGGATATGt  >  1:1298454/1‑48 (MQ=255) cATTTCGAAAAATCCTGGTCATAAAGATGCGATATCATGGGGATATGt  >  1:1350105/1‑48 (MQ=255) cATTTCGAAAAATCCTGGTCATAAAGATGCGATATCATGGGGATATGt  >  1:137964/1‑48 (MQ=255) cATTTCGAAAAATCCTGGTCATAAAGATGCGATATCATGGGGATATGt  >  1:1379803/1‑48 (MQ=255) cATTTCGAAAAATCCTGGTCATAAAGATGCGATATCATGGGGATATGt  >  1:1421045/1‑48 (MQ=255) cATTTCGAAAAATCCTGGTCATAAAGATGCGATATCATGGGGATATGt  >  1:1435741/1‑48 (MQ=255) cATTTCGAAAAATCCTGGTCATAAAGATGCGATATCATGGGGATATGt  >  1:2146374/1‑48 (MQ=255) cATTTCGAAAAATCCTGGTCATAAAGATGCGATATCATGGGGATATGt  >  1:1513614/1‑48 (MQ=255) cATTTCGAAAAATCCTGGTCATAAAGATGCGATATCATGGGGATATGt  >  1:159999/1‑48 (MQ=255) cATTTCGAAAAATCCTGGTCATAAAGATGCGATATCATGGGGATATGt  >  1:1608519/1‑48 (MQ=255) cATTTCGAAAAATCCTGGTCATAAAGATGCGATATCATGGGGATATGt  >  1:1616114/1‑48 (MQ=255) cATTTCGAAAAATCCTGGTCATAAAGATGCGATATCATGGGGATATGt  >  1:16919/1‑48 (MQ=255) cATTTCGAAAAATCCTGGTCATAAAGATGCGATATCATGGGGATATGt  >  1:1748969/1‑48 (MQ=255) cATTTCGAAAAATCCTGGTCATAAAGATGCGATATCATGGGGATATGt  >  1:1870169/1‑48 (MQ=255) cATTTCGAAAAATCCTGGTCATAAAGATGCGATATCATGGGGATATGt  >  1:1934345/1‑48 (MQ=255) cATTTCGAAAAATCCTGGTCATAAAGATGCGATATCATGGGGATATGt  >  1:1940553/1‑48 (MQ=255) cATTTCGAAAAATCCTGGTCATAAAGATGCGATATCATGGGGATATGt  >  1:2056984/1‑48 (MQ=255) cATTTCGAAAAATCCTGGTCATAAAGATGCGATATCATGGGGATATGt  >  1:103619/1‑48 (MQ=255)                                                | CATTTCGAAAAATCCTGGTCATAAAGATGCGATATCATGGGGATATGT  >  minE/2533351‑2533398

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑