Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 2533894 2533903 10 33 [0] [0] 19 rfaQ lipopolysaccharide core biosynthesis protein

AGAAGATGCGCCGGGAATTAGATGCCCTGGGCGTAAAAGATCATT  >  minE/2533849‑2533893
                                            |
agaagaTGCGCCGGGAATTAGATGCCCTGGGCGTAAAAGATCAtt  <  1:2357729/45‑1 (MQ=255)
agaagaTGCGCCGGGAATTAGATGCCCTGGGCGTAAAAGATCAtt  <  1:988301/45‑1 (MQ=255)
agaagaTGCGCCGGGAATTAGATGCCCTGGGCGTAAAAGATCAtt  <  1:961130/45‑1 (MQ=255)
agaagaTGCGCCGGGAATTAGATGCCCTGGGCGTAAAAGATCAtt  <  1:896210/45‑1 (MQ=255)
agaagaTGCGCCGGGAATTAGATGCCCTGGGCGTAAAAGATCAtt  <  1:817811/45‑1 (MQ=255)
agaagaTGCGCCGGGAATTAGATGCCCTGGGCGTAAAAGATCAtt  <  1:676662/45‑1 (MQ=255)
agaagaTGCGCCGGGAATTAGATGCCCTGGGCGTAAAAGATCAtt  <  1:639868/45‑1 (MQ=255)
agaagaTGCGCCGGGAATTAGATGCCCTGGGCGTAAAAGATCAtt  <  1:613283/45‑1 (MQ=255)
agaagaTGCGCCGGGAATTAGATGCCCTGGGCGTAAAAGATCAtt  <  1:357512/45‑1 (MQ=255)
agaagaTGCGCCGGGAATTAGATGCCCTGGGCGTAAAAGATCAtt  <  1:3497328/45‑1 (MQ=255)
agaagaTGCGCCGGGAATTAGATGCCCTGGGCGTAAAAGATCAtt  <  1:3365931/45‑1 (MQ=255)
agaagaTGCGCCGGGAATTAGATGCCCTGGGCGTAAAAGATCAtt  <  1:321393/45‑1 (MQ=255)
agaagaTGCGCCGGGAATTAGATGCCCTGGGCGTAAAAGATCAtt  <  1:2920887/45‑1 (MQ=255)
agaagaTGCGCCGGGAATTAGATGCCCTGGGCGTAAAAGATCAtt  <  1:2826951/45‑1 (MQ=255)
agaagaTGCGCCGGGAATTAGATGCCCTGGGCGTAAAAGATCAtt  <  1:2755372/45‑1 (MQ=255)
agaagaTGCGCCGGGAATTAGATGCCCTGGGCGTAAAAGATCAtt  <  1:1011249/45‑1 (MQ=255)
agaagaTGCGCCGGGAATTAGATGCCCTGGGCGTAAAAGATCAtt  <  1:2075239/45‑1 (MQ=255)
agaagaTGCGCCGGGAATTAGATGCCCTGGGCGTAAAAGATCAtt  <  1:1029391/45‑1 (MQ=255)
agaagaTGCGCCGGGAATTAGATGCCCTGGGCGTAAAAGATCAtt  <  1:1062963/45‑1 (MQ=255)
agaagaTGCGCCGGGAATTAGATGCCCTGGGCGTAAAAGATCAtt  <  1:1257052/45‑1 (MQ=255)
agaagaTGCGCCGGGAATTAGATGCCCTGGGCGTAAAAGATCAtt  <  1:1308114/45‑1 (MQ=255)
agaagaTGCGCCGGGAATTAGATGCCCTGGGCGTAAAAGATCAtt  <  1:1346887/45‑1 (MQ=255)
agaagaTGCGCCGGGAATTAGATGCCCTGGGCGTAAAAGATCAtt  <  1:1407985/45‑1 (MQ=255)
agaagaTGCGCCGGGAATTAGATGCCCTGGGCGTAAAAGATCAtt  <  1:149545/45‑1 (MQ=255)
agaagaTGCGCCGGGAATTAGATGCCCTGGGCGTAAAAGATCAtt  <  1:1504069/45‑1 (MQ=255)
agaagaTGCGCCGGGAATTAGATGCCCTGGGCGTAAAAGATCAtt  <  1:1610711/45‑1 (MQ=255)
agaagaTGCGCCGGGAATTAGATGCCCTGGGCGTAAAAGATCAtt  <  1:1702915/45‑1 (MQ=255)
agaagaTGCGCCGGGAATTAGATGCCCTGGGCGTAAAAGATCAtt  <  1:1841426/45‑1 (MQ=255)
agaagaTGCGCCGGGAATTAGATGCCCTGGGCGTAAAAGATCAtt  <  1:1939022/45‑1 (MQ=255)
agaagaTGCGCCGGGAATTAGATGCCCTGGGCGTAAAAGATCAtt  <  1:2269662/45‑1 (MQ=255)
 gaagaTGCGCCGGGAATTAGATGCCCTGGGCGTAAAAGATCAtt  <  1:356785/44‑1 (MQ=255)
 gaagaTGCGCCGGGAATTAGATGCCCTGGGCGTAAAAGATCAtt  <  1:1134684/44‑1 (MQ=255)
          ccGGGAATTAGATGCCCTGGGCGTAAAAGATCAtt  <  1:340958/35‑1 (MQ=255)
                                            |
AGAAGATGCGCCGGGAATTAGATGCCCTGGGCGTAAAAGATCATT  >  minE/2533849‑2533893

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: